Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.07■■■■■ 6.89
CHD1O14646 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.53■■■■■ 6.8
CHD1O14646 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC57.5■■■■■ 6.79
CHD1O14646 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.35■■■■■ 6.61
CHD1O14646 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.89■■■■■ 6.54
CHD1O14646 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
CHD1O14646 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.55■■■■■ 6.48
CHD1O14646 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.49■■■■■ 6.47
CHD1O14646 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.45■■■■■ 6.47
CHD1O14646 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
CHD1O14646 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.01■■■■■ 6.4
CHD1O14646 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.93■■■■■ 6.38
CHD1O14646 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.74■■■■■ 6.35
CHD1O14646 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
CHD1O14646 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.62■■■■■ 6.33
CHD1O14646 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
CHD1O14646 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.18■■■■■ 6.26
CHD1O14646 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
CHD1O14646 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
CHD1O14646 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
CHD1O14646 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
CHD1O14646 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.72■■■■■ 6.19
CHD1O14646 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
CHD1O14646 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
CHD1O14646 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.45■■■■■ 6.15
CHD1O14646 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.37■■■■■ 6.13
CHD1O14646 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.29■■■■■ 6.12
CHD1O14646 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.2■■■■■ 6.11
CHD1O14646 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
CHD1O14646 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.17■■■■■ 6.1
CHD1O14646 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.97■■■■■ 6.07
CHD1O14646 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.73■■■■■ 6.03
CHD1O14646 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
CHD1O14646 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
CHD1O14646 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.31■■■■■ 5.96
CHD1O14646 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
CHD1O14646 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
CHD1O14646 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CHD1O14646 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.7■■■■■ 5.87
CHD1O14646 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CHD1O14646 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.63■■■■■ 5.86
CHD1O14646 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.5■■■■■ 5.83
CHD1O14646 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
CHD1O14646 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.47■■■■■ 5.83
CHD1O14646 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
CHD1O14646 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
CHD1O14646 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
CHD1O14646 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.35■■■■■ 5.81
CHD1O14646 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
CHD1O14646 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.24■■■■■ 5.79
CHD1O14646 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
CHD1O14646 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
CHD1O14646 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
CHD1O14646 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
CHD1O14646 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.1■■■■■ 5.77
CHD1O14646 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
CHD1O14646 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
CHD1O14646 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
CHD1O14646 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.02■■■■■ 5.76
CHD1O14646 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
CHD1O14646 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC51■■■■■ 5.75
CHD1O14646 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
CHD1O14646 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
CHD1O14646 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
CHD1O14646 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
CHD1O14646 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
CHD1O14646 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
CHD1O14646 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CHD1O14646 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
CHD1O14646 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
CHD1O14646 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
CHD1O14646 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
CHD1O14646 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
CHD1O14646 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
CHD1O14646 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
CHD1O14646 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
CHD1O14646 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
CHD1O14646 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.25■■■■■ 5.63
CHD1O14646 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.19■■■■■ 5.62
CHD1O14646 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CHD1O14646 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.17■■■■■ 5.62
CHD1O14646 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.15■■■■■ 5.62
CHD1O14646 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
CHD1O14646 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.11■■■■■ 5.61
CHD1O14646 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
CHD1O14646 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
CHD1O14646 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
CHD1O14646 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
CHD1O14646 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
CHD1O14646 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
CHD1O14646 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
CHD1O14646 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.57
CHD1O14646 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
CHD1O14646 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
CHD1O14646 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
CHD1O14646 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.77■■■■■ 5.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms