Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC61.38■■■■■ 7.42
CUX2O14529 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC60.82■■■■■ 7.33
CUX2O14529 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC59.72■■■■■ 7.15
CUX2O14529 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.28■■■■■ 7.08
CUX2O14529 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.2■■■■■ 7.07
CUX2O14529 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC58.84■■■■■ 7.01
CUX2O14529 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.8■■■■■ 7
CUX2O14529 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC58.43■■■■■ 6.94
CUX2O14529 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.37■■■■■ 6.94
CUX2O14529 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.24■■■■■ 6.91
CUX2O14529 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.78■■■■■ 6.84
CUX2O14529 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.68■■■■■ 6.82
CUX2O14529 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC57.53■■■■■ 6.8
CUX2O14529 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.41■■■■■ 6.78
CUX2O14529 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC57.2■■■■■ 6.75
CUX2O14529 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.18■■■■■ 6.74
CUX2O14529 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC56.77■■■■■ 6.68
CUX2O14529 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.63■■■■■ 6.66
CUX2O14529 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.6■■■■■ 6.65
CUX2O14529 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC56.53■■■■■ 6.64
CUX2O14529 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC56.51■■■■■ 6.64
CUX2O14529 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
CUX2O14529 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
CUX2O14529 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.32■■■■■ 6.61
CUX2O14529 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.19■■■■■ 6.59
CUX2O14529 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC56.13■■■■■ 6.58
CUX2O14529 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
CUX2O14529 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56■■■■■ 6.56
CUX2O14529 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC55.94■■■■■ 6.55
CUX2O14529 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC55.57■■■■■ 6.49
CUX2O14529 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.57■■■■■ 6.49
CUX2O14529 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.47■■■■■ 6.47
CUX2O14529 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC55.42■■■■■ 6.46
CUX2O14529 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC55.34■■■■■ 6.45
CUX2O14529 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC54.92■■■■■ 6.38
CUX2O14529 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
CUX2O14529 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC54.71■■■■■ 6.35
CUX2O14529 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
CUX2O14529 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.68■■■■■ 6.34
CUX2O14529 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC54.67■■■■■ 6.34
CUX2O14529 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.61■■■■■ 6.33
CUX2O14529 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.6■■■■■ 6.33
CUX2O14529 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.32
CUX2O14529 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC54.46■■■■■ 6.31
CUX2O14529 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.44■■■■■ 6.31
CUX2O14529 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
CUX2O14529 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC54.36■■■■■ 6.29
CUX2O14529 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC54.3■■■■■ 6.28
CUX2O14529 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.28
CUX2O14529 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC54.12■■■■■ 6.25
CUX2O14529 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.23
CUX2O14529 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.91■■■■■ 6.22
CUX2O14529 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC53.89■■■■■ 6.22
CUX2O14529 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC53.87■■■■■ 6.21
CUX2O14529 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
CUX2O14529 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
CUX2O14529 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
CUX2O14529 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
CUX2O14529 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC53.56■■■■■ 6.16
CUX2O14529 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.55■■■■■ 6.16
CUX2O14529 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC53.5■■■■■ 6.15
CUX2O14529 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
CUX2O14529 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.49■■■■■ 6.15
CUX2O14529 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC53.46■■■■■ 6.15
CUX2O14529 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.14
CUX2O14529 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC53.39■■■■■ 6.14
CUX2O14529 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC53.28■■■■■ 6.12
CUX2O14529 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
CUX2O14529 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.25■■■■■ 6.11
CUX2O14529 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
CUX2O14529 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
CUX2O14529 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC53.16■■■■■ 6.1
CUX2O14529 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC53.13■■■■■ 6.1
CUX2O14529 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
CUX2O14529 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC53.1■■■■■ 6.09
CUX2O14529 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC53.07■■■■■ 6.09
CUX2O14529 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC53.01■■■■■ 6.08
CUX2O14529 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.07
CUX2O14529 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.98■■■■■ 6.07
CUX2O14529 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
CUX2O14529 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
CUX2O14529 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.94■■■■■ 6.06
CUX2O14529 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
CUX2O14529 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
CUX2O14529 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
CUX2O14529 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC52.83■■■■■ 6.05
CUX2O14529 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
CUX2O14529 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.77■■■■■ 6.04
CUX2O14529 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.04
CUX2O14529 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.04
CUX2O14529 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC52.74■■■■■ 6.03
CUX2O14529 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC52.68■■■■■ 6.02
CUX2O14529 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC52.68■■■■■ 6.02
CUX2O14529 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC52.67■■■■■ 6.02
CUX2O14529 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC52.56■■■■■ 6
CUX2O14529 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
CUX2O14529 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC52.48■■■■■ 5.99
CUX2O14529 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC52.44■■■■■ 5.99
CUX2O14529 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC52.36■■■■■ 5.97
CUX2O14529 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms