Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC73.42■■■■■ 9.34
Ccdc180J3QNE4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC68.26■■■■■ 8.52
Ccdc180J3QNE4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.73■■■■■ 8.27
Ccdc180J3QNE4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC64.13■■■■■ 7.86
Ccdc180J3QNE4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC63.99■■■■■ 7.83
Ccdc180J3QNE4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC62.88■■■■■ 7.66
Ccdc180J3QNE4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.16■■■■■ 7.54
Ccdc180J3QNE4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.96■■■■■ 7.51
Ccdc180J3QNE4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC61.48■■■■■ 7.43
Ccdc180J3QNE4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.23■■■■■ 7.39
Ccdc180J3QNE4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC61.22■■■■■ 7.39
Ccdc180J3QNE4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.62■■■■■ 7.3
Ccdc180J3QNE4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.73■■■■■ 7.15
Ccdc180J3QNE4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC59.53■■■■■ 7.12
Ccdc180J3QNE4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.43■■■■■ 7.1
Ccdc180J3QNE4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC59.06■■■■■ 7.05
Ccdc180J3QNE4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC58.83■■■■■ 7.01
Ccdc180J3QNE4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.8■■■■■ 7
Ccdc180J3QNE4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC58.7■■■■■ 6.99
Ccdc180J3QNE4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.68■■■■■ 6.98
Ccdc180J3QNE4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.37■■■■■ 6.93
Ccdc180J3QNE4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.32■■■■■ 6.93
Ccdc180J3QNE4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.28■■■■■ 6.92
Ccdc180J3QNE4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC58.11■■■■■ 6.89
Ccdc180J3QNE4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.08■■■■■ 6.89
Ccdc180J3QNE4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC58.04■■■■■ 6.88
Ccdc180J3QNE4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC58.01■■■■■ 6.88
Ccdc180J3QNE4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.93■■■■■ 6.86
Ccdc180J3QNE4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.87■■■■■ 6.85
Ccdc180J3QNE4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.58■■■■■ 6.81
Ccdc180J3QNE4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.43■■■■■ 6.78
Ccdc180J3QNE4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC57.36■■■■■ 6.77
Ccdc180J3QNE4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.35■■■■■ 6.77
Ccdc180J3QNE4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.2■■■■■ 6.75
Ccdc180J3QNE4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.83■■■■■ 6.69
Ccdc180J3QNE4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
Ccdc180J3QNE4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC56.47■■■■■ 6.63
Ccdc180J3QNE4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.44■■■■■ 6.63
Ccdc180J3QNE4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC56.33■■■■■ 6.61
Ccdc180J3QNE4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.18■■■■■ 6.58
Ccdc180J3QNE4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
Ccdc180J3QNE4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC55.97■■■■■ 6.55
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC55.9■■■■■ 6.54
Ccdc180J3QNE4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC55.77■■■■■ 6.52
Ccdc180J3QNE4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC55.62■■■■■ 6.49
Ccdc180J3QNE4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.49
Ccdc180J3QNE4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC55.5■■■■■ 6.47
Ccdc180J3QNE4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
Ccdc180J3QNE4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC55.14■■■■■ 6.42
Ccdc180J3QNE4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC55.12■■■■■ 6.41
Ccdc180J3QNE4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC55.01■■■■■ 6.4
Ccdc180J3QNE4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC54.87■■■■■ 6.38
Ccdc180J3QNE4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
Ccdc180J3QNE4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC54.78■■■■■ 6.36
Ccdc180J3QNE4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC54.77■■■■■ 6.36
Ccdc180J3QNE4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.72■■■■■ 6.35
Ccdc180J3QNE4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
Ccdc180J3QNE4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.67■■■■■ 6.34
Ccdc180J3QNE4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
Ccdc180J3QNE4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC54.55■■■■■ 6.32
Ccdc180J3QNE4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC54.35■■■■■ 6.29
Ccdc180J3QNE4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC54.33■■■■■ 6.29
Ccdc180J3QNE4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
Ccdc180J3QNE4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
Ccdc180J3QNE4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
Ccdc180J3QNE4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC54.26■■■■■ 6.28
Ccdc180J3QNE4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC54.19■■■■■ 6.27
Ccdc180J3QNE4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC54.12■■■■■ 6.25
Ccdc180J3QNE4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.11■■■■■ 6.25
Ccdc180J3QNE4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
Ccdc180J3QNE4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC54■■■■■ 6.24
Ccdc180J3QNE4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.23
Ccdc180J3QNE4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.23
Ccdc180J3QNE4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC53.92■■■■■ 6.22
Ccdc180J3QNE4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
Ccdc180J3QNE4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC53.85■■■■■ 6.21
Ccdc180J3QNE4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
Ccdc180J3QNE4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC53.79■■■■■ 6.2
Ccdc180J3QNE4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
Ccdc180J3QNE4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
Ccdc180J3QNE4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
Ccdc180J3QNE4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.54■■■■■ 6.16
Ccdc180J3QNE4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
Ccdc180J3QNE4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC53.49■■■■■ 6.15
Ccdc180J3QNE4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
Ccdc180J3QNE4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC53.46■■■■■ 6.15
Ccdc180J3QNE4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
Ccdc180J3QNE4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC53.25■■■■■ 6.12
Ccdc180J3QNE4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
Ccdc180J3QNE4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
Ccdc180J3QNE4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC53.11■■■■■ 6.09
Ccdc180J3QNE4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
Ccdc180J3QNE4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
Ccdc180J3QNE4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.9■■■■■ 6.06
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.89■■■■■ 6.06
Ccdc180J3QNE4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
Ccdc180J3QNE4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC52.83■■■■■ 6.05
Ccdc180J3QNE4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC52.8■■■■■ 6.04
Ccdc180J3QNE4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms