Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM49D1C9J1S8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM49D1C9J1S8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM49D1C9J1S8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM49D1C9J1S8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM49D1C9J1S8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM49D1C9J1S8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM49D1C9J1S8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM49D1C9J1S8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM49D1C9J1S8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM49D1C9J1S8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRIM49D1C9J1S8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRIM49D1C9J1S8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRIM49D1C9J1S8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM49D1C9J1S8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM49D1C9J1S8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM49D1C9J1S8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM49D1C9J1S8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM49D1C9J1S8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM49D1C9J1S8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM49D1C9J1S8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRIM49D1C9J1S8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM49D1C9J1S8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRIM49D1C9J1S8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRIM49D1C9J1S8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM49D1C9J1S8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM49D1C9J1S8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRIM49D1C9J1S8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM49D1C9J1S8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM49D1C9J1S8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM49D1C9J1S8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM49D1C9J1S8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM49D1C9J1S8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM49D1C9J1S8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM49D1C9J1S8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM49D1C9J1S8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM49D1C9J1S8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM49D1C9J1S8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM49D1C9J1S8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM49D1C9J1S8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM49D1C9J1S8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM49D1C9J1S8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM49D1C9J1S8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM49D1C9J1S8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM49D1C9J1S8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM49D1C9J1S8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM49D1C9J1S8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM49D1C9J1S8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM49D1C9J1S8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM49D1C9J1S8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM49D1C9J1S8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM49D1C9J1S8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM49D1C9J1S8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM49D1C9J1S8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM49D1C9J1S8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM49D1C9J1S8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM49D1C9J1S8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM49D1C9J1S8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM49D1C9J1S8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM49D1C9J1S8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM49D1C9J1S8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM49D1C9J1S8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM49D1C9J1S8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM49D1C9J1S8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM49D1C9J1S8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM49D1C9J1S8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM49D1C9J1S8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49D1C9J1S8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM49D1C9J1S8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM49D1C9J1S8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM49D1C9J1S8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM49D1C9J1S8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM49D1C9J1S8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM49D1C9J1S8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM49D1C9J1S8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM49D1C9J1S8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM49D1C9J1S8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM49D1C9J1S8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM49D1C9J1S8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM49D1C9J1S8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM49D1C9J1S8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM49D1C9J1S8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM49D1C9J1S8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM49D1C9J1S8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM49D1C9J1S8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM49D1C9J1S8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM49D1C9J1S8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM49D1C9J1S8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM49D1C9J1S8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM49D1C9J1S8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM49D1C9J1S8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM49D1C9J1S8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms