Protein: A6NC98

CCDC88B, Coiled-coil domain-containing protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 1,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88BA6NC98 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC61.26■■■■■ 7.4
CCDC88BA6NC98 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC60.55■■■■■ 7.28
CCDC88BA6NC98 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.75■■■■■ 7.15
CCDC88BA6NC98 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC59.69■■■■■ 7.15
CCDC88BA6NC98 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.22■■■■■ 7.07
CCDC88BA6NC98 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.91■■■■■ 7.02
CCDC88BA6NC98 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.73■■■■■ 6.99
CCDC88BA6NC98 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC58.49■■■■■ 6.95
CCDC88BA6NC98 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.93■■■■■ 6.86
CCDC88BA6NC98 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC57.67■■■■■ 6.82
CCDC88BA6NC98 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC57.66■■■■■ 6.82
CCDC88BA6NC98 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC57.61■■■■■ 6.81
CCDC88BA6NC98 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.36■■■■■ 6.77
CCDC88BA6NC98 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC57.22■■■■■ 6.75
CCDC88BA6NC98 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC57.12■■■■■ 6.73
CCDC88BA6NC98 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.09■■■■■ 6.73
CCDC88BA6NC98 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.92■■■■■ 6.7
CCDC88BA6NC98 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.83■■■■■ 6.69
CCDC88BA6NC98 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.67■■■■■ 6.66
CCDC88BA6NC98 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC56.51■■■■■ 6.64
CCDC88BA6NC98 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.2■■■■■ 6.59
CCDC88BA6NC98 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.1■■■■■ 6.57
CCDC88BA6NC98 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC56.1■■■■■ 6.57
CCDC88BA6NC98 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC56.1■■■■■ 6.57
CCDC88BA6NC98 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.06■■■■■ 6.56
CCDC88BA6NC98 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.89■■■■■ 6.54
CCDC88BA6NC98 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC55.88■■■■■ 6.54
CCDC88BA6NC98 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC55.71■■■■■ 6.51
CCDC88BA6NC98 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC55.7■■■■■ 6.51
CCDC88BA6NC98 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.66■■■■■ 6.5
CCDC88BA6NC98 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
CCDC88BA6NC98 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.51■■■■■ 6.48
CCDC88BA6NC98 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC55.07■■■■■ 6.41
CCDC88BA6NC98 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC55.05■■■■■ 6.4
CCDC88BA6NC98 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC55.02■■■■■ 6.4
CCDC88BA6NC98 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.4
CCDC88BA6NC98 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC54.88■■■■■ 6.38
CCDC88BA6NC98 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC54.67■■■■■ 6.34
CCDC88BA6NC98 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC54.59■■■■■ 6.33
CCDC88BA6NC98 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.42■■■■■ 6.3
CCDC88BA6NC98 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
CCDC88BA6NC98 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
CCDC88BA6NC98 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.27
CCDC88BA6NC98 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
CCDC88BA6NC98 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
CCDC88BA6NC98 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
CCDC88BA6NC98 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC53.9■■■■■ 6.22
CCDC88BA6NC98 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC53.78■■■■■ 6.2
CCDC88BA6NC98 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC53.74■■■■■ 6.19
CCDC88BA6NC98 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
CCDC88BA6NC98 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
CCDC88BA6NC98 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC53.45■■■■■ 6.15
CCDC88BA6NC98 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC53.45■■■■■ 6.15
CCDC88BA6NC98 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
CCDC88BA6NC98 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC53.35■■■■■ 6.13
CCDC88BA6NC98 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
CCDC88BA6NC98 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
CCDC88BA6NC98 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
CCDC88BA6NC98 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.14■■■■■ 6.1
CCDC88BA6NC98 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC53.12■■■■■ 6.09
CCDC88BA6NC98 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
CCDC88BA6NC98 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
CCDC88BA6NC98 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC53.04■■■■■ 6.08
CCDC88BA6NC98 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.08
CCDC88BA6NC98 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC53■■■■■ 6.07
CCDC88BA6NC98 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
CCDC88BA6NC98 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
CCDC88BA6NC98 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC52.86■■■■■ 6.05
CCDC88BA6NC98 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
CCDC88BA6NC98 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
CCDC88BA6NC98 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
CCDC88BA6NC98 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.74■■■■■ 6.03
CCDC88BA6NC98 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
CCDC88BA6NC98 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.64■■■■■ 6.02
CCDC88BA6NC98 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.6■■■■■ 6.01
CCDC88BA6NC98 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
CCDC88BA6NC98 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
CCDC88BA6NC98 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
CCDC88BA6NC98 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.56■■■■■ 6
CCDC88BA6NC98 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
CCDC88BA6NC98 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC52.56■■■■■ 6
CCDC88BA6NC98 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC52.54■■■■■ 6
CCDC88BA6NC98 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC52.51■■■■■ 6
CCDC88BA6NC98 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC52.5■■■■■ 5.99
CCDC88BA6NC98 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.5■■■■■ 5.99
CCDC88BA6NC98 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
CCDC88BA6NC98 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC52.46■■■■■ 5.99
CCDC88BA6NC98 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC52.43■■■■■ 5.98
CCDC88BA6NC98 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
CCDC88BA6NC98 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC52.3■■■■■ 5.96
CCDC88BA6NC98 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
CCDC88BA6NC98 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.24■■■■■ 5.95
CCDC88BA6NC98 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
CCDC88BA6NC98 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC52.2■■■■■ 5.95
CCDC88BA6NC98 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.19■■■■■ 5.95
CCDC88BA6NC98 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC52.16■■■■■ 5.94
CCDC88BA6NC98 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
CCDC88BA6NC98 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
CCDC88BA6NC98 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
CCDC88BA6NC98 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC51.94■■■■■ 5.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms