RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640718.1

AC011416.4-204, humanhuman

TSL 5

Gene AC011416.4, Length 1,428 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC011416.4-204ENST00000640718 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
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AC011416.4-204ENST00000640718 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.71■■■□□ 2.83
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AC011416.4-204ENST00000640718 ABCC9O60706 1549 aa28.29■■■□□ 2.12
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AC011416.4-204ENST00000640718 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.01■■□□□ 1.91
AC011416.4-204ENST00000640718 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.99■■□□□ 1.91
AC011416.4-204ENST00000640718 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.96■■□□□ 1.91
AC011416.4-204ENST00000640718 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.82■■□□□ 1.88
AC011416.4-204ENST00000640718 SCRIBQ14160 1630 aa26.59■■□□□ 1.85
AC011416.4-204ENST00000640718 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.51■■□□□ 1.83
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AC011416.4-204ENST00000640718 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
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AC011416.4-204ENST00000640718 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.86■■□□□ 1.73
AC011416.4-204ENST00000640718 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
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AC011416.4-204ENST00000640718 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.61■■□□□ 1.69
AC011416.4-204ENST00000640718 ADRA2BP18089 450 aa25.58■■□□□ 1.69
AC011416.4-204ENST00000640718 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.55■■□□□ 1.68
AC011416.4-204ENST00000640718 SMARCA4P51532 1647 aa25.4■■□□□ 1.66
AC011416.4-204ENST00000640718 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
AC011416.4-204ENST00000640718 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.29■■□□□ 1.64
AC011416.4-204ENST00000640718 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.16■■□□□ 1.62
AC011416.4-204ENST00000640718 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.1■■□□□ 1.61
AC011416.4-204ENST00000640718 SMARCA2P51531 1590 aa25.08■■□□□ 1.61
AC011416.4-204ENST00000640718 WIZO95785 1651 aa25.07■■□□□ 1.6
AC011416.4-204ENST00000640718 NCAPD3P42695 1498 aa25.07■■□□□ 1.6
AC011416.4-204ENST00000640718 HMGXB3Q12766 1538 aa25.01■■□□□ 1.59
AC011416.4-204ENST00000640718 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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AC011416.4-204ENST00000640718 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.42■■□□□ 1.5
AC011416.4-204ENST00000640718 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.34■■□□□ 1.49
AC011416.4-204ENST00000640718 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.33■■□□□ 1.49
AC011416.4-204ENST00000640718 ERCC6Q03468 1493 aa24.27■■□□□ 1.48
AC011416.4-204ENST00000640718 CFTRP13569 1480 aa24.26■■□□□ 1.47
AC011416.4-204ENST00000640718 MSH5O43196 834 aa24.26■■□□□ 1.47
AC011416.4-204ENST00000640718 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
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AC011416.4-204ENST00000640718 TOPBP1Q92547 1522 aa23.78■■□□□ 1.4
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AC011416.4-204ENST00000640718 CUX1P39880 1505 aa23.71■■□□□ 1.39
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AC011416.4-204ENST00000640718 SYNJ1O43426 1573 aa23.59■■□□□ 1.37
AC011416.4-204ENST00000640718 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.57■■□□□ 1.36
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AC011416.4-204ENST00000640718 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.53■■□□□ 1.36
AC011416.4-204ENST00000640718 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.53■■□□□ 1.36
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AC011416.4-204ENST00000640718 TOP2BQ02880 1626 aa23.5■■□□□ 1.35
AC011416.4-204ENST00000640718 IFT140Q96RY7 1462 aa23.5■■□□□ 1.35
AC011416.4-204ENST00000640718 WDR97A6NE52 1622 aa23.46■■□□□ 1.35
AC011416.4-204ENST00000640718 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AC011416.4-204ENST00000640718 SOGA1O94964 1423 aa23.42■■□□□ 1.34
AC011416.4-204ENST00000640718 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
AC011416.4-204ENST00000640718 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
AC011416.4-204ENST00000640718 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
AC011416.4-204ENST00000640718 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.29■■□□□ 1.32
AC011416.4-204ENST00000640718 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.28■■□□□ 1.32
AC011416.4-204ENST00000640718 PBRM1Q86U86 1689 aa23.25■■□□□ 1.31
AC011416.4-204ENST00000640718 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AC011416.4-204ENST00000640718 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.17■■□□□ 1.3
AC011416.4-204ENST00000640718 CHD1O14646 1710 aa23.17■■□□□ 1.3
AC011416.4-204ENST00000640718 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.16■■□□□ 1.3
AC011416.4-204ENST00000640718 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
AC011416.4-204ENST00000640718 GRIN2BQ13224 1484 aa23.12■■□□□ 1.29
AC011416.4-204ENST00000640718 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.08■■□□□ 1.28
AC011416.4-204ENST00000640718 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
AC011416.4-204ENST00000640718 ADAMTS12P58397 1594 aa23.03■■□□□ 1.28
AC011416.4-204ENST00000640718 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23■■□□□ 1.27
AC011416.4-204ENST00000640718 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23■■□□□ 1.27
AC011416.4-204ENST00000640718 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.99■■□□□ 1.27
AC011416.4-204ENST00000640718 TRIM41Q8WV44 630 aa22.99■■□□□ 1.27
AC011416.4-204ENST00000640718 SYNJ2O15056 1496 aa22.97■■□□□ 1.27
AC011416.4-204ENST00000640718 FBLN2P98095 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
AC011416.4-204ENST00000640718 KIF27Q86VH2 1401 aa22.95■■□□□ 1.26
AC011416.4-204ENST00000640718 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
AC011416.4-204ENST00000640718 OSCARQ8IYS5 282 aa22.9■■□□□ 1.26
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