RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639852.1

SZT2-216, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 5

Gene SZT2, Length 1,314 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-216ENST00000639852 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.29■■■□□ 2.76
SZT2-216ENST00000639852 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.78■■■□□ 2.2
SZT2-216ENST00000639852 ABCC9O60706 1549 aa28.45■■■□□ 2.14
SZT2-216ENST00000639852 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.18■■□□□ 1.94
SZT2-216ENST00000639852 NACADO15069 1562 aa27.09■■□□□ 1.93
SZT2-216ENST00000639852 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.97■■□□□ 1.91
SZT2-216ENST00000639852 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SZT2-216ENST00000639852 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.83■■□□□ 1.89
SZT2-216ENST00000639852 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.65■■□□□ 1.86
SZT2-216ENST00000639852 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.64■■□□□ 1.85
SZT2-216ENST00000639852 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
SZT2-216ENST00000639852 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.47■■□□□ 1.83
SZT2-216ENST00000639852 SCRIBQ14160 1630 aa26.33■■□□□ 1.81
SZT2-216ENST00000639852 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.32■■□□□ 1.8
SZT2-216ENST00000639852 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.04■■□□□ 1.76
SZT2-216ENST00000639852 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SZT2-216ENST00000639852 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.7■■□□□ 1.7
SZT2-216ENST00000639852 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.54■■□□□ 1.68
SZT2-216ENST00000639852 SMARCA4P51532 1647 aa25.13■■□□□ 1.61
SZT2-216ENST00000639852 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.04■■□□□ 1.6
SZT2-216ENST00000639852 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SZT2-216ENST00000639852 NCAPD3P42695 1498 aa25■■□□□ 1.59
SZT2-216ENST00000639852 SMARCA2P51531 1590 aa24.94■■□□□ 1.58
SZT2-216ENST00000639852 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.94■■□□□ 1.58
SZT2-216ENST00000639852 HMGXB3Q12766 1538 aa24.9■■□□□ 1.58
SZT2-216ENST00000639852 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.86■■□□□ 1.57
SZT2-216ENST00000639852 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SZT2-216ENST00000639852 WIZO95785 1651 aa24.65■■□□□ 1.54
SZT2-216ENST00000639852 NESP48681 1621 aa24.58■■□□□ 1.53
SZT2-216ENST00000639852 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SZT2-216ENST00000639852 ERCC6Q03468 1493 aa24.47■■□□□ 1.51
SZT2-216ENST00000639852 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.38■■□□□ 1.49
SZT2-216ENST00000639852 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SZT2-216ENST00000639852 CUX2O14529 1486 aa24.28■■□□□ 1.48
SZT2-216ENST00000639852 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.47
SZT2-216ENST00000639852 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.26■■□□□ 1.47
SZT2-216ENST00000639852 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.25■■□□□ 1.47
SZT2-216ENST00000639852 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
SZT2-216ENST00000639852 CFTRP13569 1480 aa24.1■■□□□ 1.45
SZT2-216ENST00000639852 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.05■■□□□ 1.44
SZT2-216ENST00000639852 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.03■■□□□ 1.44
SZT2-216ENST00000639852 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.02■■□□□ 1.44
SZT2-216ENST00000639852 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.01■■□□□ 1.43
SZT2-216ENST00000639852 WDR62O43379 1518 aa23.98■■□□□ 1.43
SZT2-216ENST00000639852 PRDM2Q13029 1718 aa23.88■■□□□ 1.41
SZT2-216ENST00000639852 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SZT2-216ENST00000639852 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.77■■□□□ 1.4
SZT2-216ENST00000639852 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SZT2-216ENST00000639852 TOPBP1Q92547 1522 aa23.63■■□□□ 1.37
SZT2-216ENST00000639852 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.57■■□□□ 1.36
SZT2-216ENST00000639852 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SZT2-216ENST00000639852 IFT140Q96RY7 1462 aa23.49■■□□□ 1.35
SZT2-216ENST00000639852 ABCC8Q09428 1581 aa23.48■■□□□ 1.35
SZT2-216ENST00000639852 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SZT2-216ENST00000639852 CUX1P39880 1505 aa23.4■■□□□ 1.34
SZT2-216ENST00000639852 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SZT2-216ENST00000639852 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SZT2-216ENST00000639852 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.35■■□□□ 1.33
SZT2-216ENST00000639852 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.34■■□□□ 1.33
SZT2-216ENST00000639852 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
SZT2-216ENST00000639852 SOGA1O94964 1423 aa23.25■■□□□ 1.31
SZT2-216ENST00000639852 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SZT2-216ENST00000639852 WDR97A6NE52 1622 aa23.19■■□□□ 1.3
SZT2-216ENST00000639852 OSCARQ8IYS5 282 aa23.15■■□□□ 1.3
SZT2-216ENST00000639852 SYNJ1O43426 1573 aa23.14■■□□□ 1.3
SZT2-216ENST00000639852 CHD1O14646 1710 aa23.12■■□□□ 1.29
SZT2-216ENST00000639852 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
SZT2-216ENST00000639852 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.1■■□□□ 1.29
SZT2-216ENST00000639852 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.1■■□□□ 1.29
SZT2-216ENST00000639852 TOP2BQ02880 1626 aa23.09■■□□□ 1.29
SZT2-216ENST00000639852 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.07■■□□□ 1.28
SZT2-216ENST00000639852 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.04■■□□□ 1.28
SZT2-216ENST00000639852 GRIN2BQ13224 1484 aa23.02■■□□□ 1.28
SZT2-216ENST00000639852 PBRM1Q86U86 1689 aa23.01■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 GAPVD1Q14C86 1478 aa23■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 FBLN2P98095 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
SZT2-216ENST00000639852 TRIM41Q8WV44 630 aa22.94■■□□□ 1.26
SZT2-216ENST00000639852 ARHGEF11O15085 1522 aa22.93■■□□□ 1.26
SZT2-216ENST00000639852 SYNJ2O15056 1496 aa22.92■■□□□ 1.26
SZT2-216ENST00000639852 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.87■■□□□ 1.25
SZT2-216ENST00000639852 ADAMTS12P58397 1594 aa22.86■■□□□ 1.25
SZT2-216ENST00000639852 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SZT2-216ENST00000639852 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
SZT2-216ENST00000639852 ARAP1Q96P48 1450 aa22.77■■□□□ 1.24
SZT2-216ENST00000639852 GRIN2AQ12879 1464 aa22.76■■□□□ 1.23
SZT2-216ENST00000639852 CEP170Q5SW79 1584 aa22.71■■□□□ 1.23
SZT2-216ENST00000639852 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.71■■□□□ 1.23
SZT2-216ENST00000639852 NUP160Q12769 1436 aa22.68■■□□□ 1.22
SZT2-216ENST00000639852 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.63■■□□□ 1.21
SZT2-216ENST00000639852 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.6■■□□□ 1.21
SZT2-216ENST00000639852 KIF27Q86VH2 1401 aa22.59■■□□□ 1.21
SZT2-216ENST00000639852 IGF1RP08069 1367 aa22.56■■□□□ 1.2
SZT2-216ENST00000639852 SHROOM2Q13796 1616 aa22.54■■□□□ 1.2
SZT2-216ENST00000639852 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.53■■□□□ 1.2
SZT2-216ENST00000639852 CUL7Q14999 1698 aa22.52■■□□□ 1.2
SZT2-216ENST00000639852 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms