RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636281.1

AC008163.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC008163.1, Length 1,455 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008163.1-201ENST00000636281 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
AC008163.1-201ENST00000636281 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
AC008163.1-201ENST00000636281 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
AC008163.1-201ENST00000636281 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
AC008163.1-201ENST00000636281 FOXD1Q16676 465 aa19.83■□□□□ 0.76
AC008163.1-201ENST00000636281 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.67■□□□□ 0.74
AC008163.1-201ENST00000636281 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.97■□□□□ 0.63
AC008163.1-201ENST00000636281 ADRA2BP18089 450 aa18.95■□□□□ 0.62
AC008163.1-201ENST00000636281 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
AC008163.1-201ENST00000636281 MSH5O43196 834 aa18.29■□□□□ 0.52
AC008163.1-201ENST00000636281 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.33■□□□□ 0.37
AC008163.1-201ENST00000636281 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 POTEDQ86YR6 584 aa17■□□□□ 0.31
AC008163.1-201ENST00000636281 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.99■□□□□ 0.31
AC008163.1-201ENST00000636281 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.86■□□□□ 0.29
AC008163.1-201ENST00000636281 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
AC008163.1-201ENST00000636281 KCNA4P22459 653 aa16.78■□□□□ 0.28
AC008163.1-201ENST00000636281 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
AC008163.1-201ENST00000636281 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
AC008163.1-201ENST00000636281 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
AC008163.1-201ENST00000636281 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.29■□□□□ 0.2
AC008163.1-201ENST00000636281 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.07■□□□□ 0.16
AC008163.1-201ENST00000636281 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
AC008163.1-201ENST00000636281 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
AC008163.1-201ENST00000636281 SLC4A2P04920 1241 aa15.73■□□□□ 0.11
AC008163.1-201ENST00000636281 RNF39Q9H2S5 420 aa15.69■□□□□ 0.1
AC008163.1-201ENST00000636281 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
AC008163.1-201ENST00000636281 ZBTB22O15209 634 aa15.46■□□□□ 0.06
AC008163.1-201ENST00000636281 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
AC008163.1-201ENST00000636281 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.46■□□□□ 0.06
AC008163.1-201ENST00000636281 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
AC008163.1-201ENST00000636281 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
AC008163.1-201ENST00000636281 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.32■□□□□ 0.04
AC008163.1-201ENST00000636281 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
AC008163.1-201ENST00000636281 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
AC008163.1-201ENST00000636281 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.2■□□□□ 0.02
AC008163.1-201ENST00000636281 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
AC008163.1-201ENST00000636281 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
AC008163.1-201ENST00000636281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.11■□□□□ 0.01
AC008163.1-201ENST00000636281 CAPN15O75808 1086 aa15.1■□□□□ 0.01
AC008163.1-201ENST00000636281 APLP2Q06481 763 aa15.08■□□□□ 0
AC008163.1-201ENST00000636281 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
AC008163.1-201ENST00000636281 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
AC008163.1-201ENST00000636281 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
AC008163.1-201ENST00000636281 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.89□□□□□ -0.03
AC008163.1-201ENST00000636281 DSG3P32926 999 aa14.89□□□□□ -0.03
AC008163.1-201ENST00000636281 ABCB7O75027 752 aa14.82□□□□□ -0.04
AC008163.1-201ENST00000636281 POLA2Q14181 598 aa14.69□□□□□ -0.06
AC008163.1-201ENST00000636281 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
AC008163.1-201ENST00000636281 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
AC008163.1-201ENST00000636281 FBLN2P98095 1184 aa14.28□□□□□ -0.12
AC008163.1-201ENST00000636281 OSCARQ8IYS5 282 aa14.24□□□□□ -0.13
AC008163.1-201ENST00000636281 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
AC008163.1-201ENST00000636281 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.01□□□□□ -0.17
AC008163.1-201ENST00000636281 SPDYE6P0CI01 402 aa14.01□□□□□ -0.17
AC008163.1-201ENST00000636281 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.01□□□□□ -0.17
AC008163.1-201ENST00000636281 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
AC008163.1-201ENST00000636281 AKT1S1Q96B36 256 aa13.94□□□□□ -0.18
AC008163.1-201ENST00000636281 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.91□□□□□ -0.18
AC008163.1-201ENST00000636281 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.87□□□□□ -0.19
AC008163.1-201ENST00000636281 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
AC008163.1-201ENST00000636281 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
AC008163.1-201ENST00000636281 FKBP8Q14318 412 aa13.75□□□□□ -0.21
AC008163.1-201ENST00000636281 PITPNM1O00562 1244 aa13.7□□□□□ -0.22
AC008163.1-201ENST00000636281 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.66□□□□□ -0.22
AC008163.1-201ENST00000636281 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
AC008163.1-201ENST00000636281 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.62□□□□□ -0.23
AC008163.1-201ENST00000636281 PROM2Q8N271 834 aa13.61□□□□□ -0.23
AC008163.1-201ENST00000636281 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.59□□□□□ -0.23
AC008163.1-201ENST00000636281 ABCC9O60706 1549 aa13.51□□□□□ -0.25
AC008163.1-201ENST00000636281 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.46□□□□□ -0.25
AC008163.1-201ENST00000636281 PRR29P0C7W0 189 aa13.45□□□□□ -0.26
AC008163.1-201ENST00000636281 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
AC008163.1-201ENST00000636281 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.45□□□□□ -0.26
AC008163.1-201ENST00000636281 POTEHQ6S545 545 aa13.42□□□□□ -0.26
AC008163.1-201ENST00000636281 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
AC008163.1-201ENST00000636281 CHADLQ6NUI6 762 aa13.34□□□□□ -0.27
AC008163.1-201ENST00000636281 CREBZFQ9NS37 354 aa13.28□□□□□ -0.28
AC008163.1-201ENST00000636281 FBXO3Q9UK99 471 aa13.23□□□□□ -0.29
AC008163.1-201ENST00000636281 MIER1Q8N108 512 aa13.16□□□□□ -0.3
AC008163.1-201ENST00000636281 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
AC008163.1-201ENST00000636281 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.13□□□□□ -0.31
AC008163.1-201ENST00000636281 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
AC008163.1-201ENST00000636281 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
AC008163.1-201ENST00000636281 HAX1O00165 279 aa13.06□□□□□ -0.32
AC008163.1-201ENST00000636281 PLEKHG5O94827 1062 aa13.06□□□□□ -0.32
AC008163.1-201ENST00000636281 C19orf67A6NJJ6 358 aa13□□□□□ -0.33
AC008163.1-201ENST00000636281 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
AC008163.1-201ENST00000636281 EVX2Q03828 476 aa12.99□□□□□ -0.33
AC008163.1-201ENST00000636281 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
AC008163.1-201ENST00000636281 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
AC008163.1-201ENST00000636281 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
AC008163.1-201ENST00000636281 KLHL34Q8N239 644 aa12.92□□□□□ -0.34
AC008163.1-201ENST00000636281 RASEFQ8IZ41 740 aa12.87□□□□□ -0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 NUBP1P53384 320 aa12.86□□□□□ -0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.85□□□□□ -0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.84□□□□□ -0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
AC008163.1-201ENST00000636281 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms