RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635443.1

QARS-242, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene QARS, Length 1,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARS-242ENST00000635443 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.71■■■□□ 2.51
QARS-242ENST00000635443 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.07■■□□□ 1.92
QARS-242ENST00000635443 ABCC9O60706 1549 aa25.92■■□□□ 1.74
QARS-242ENST00000635443 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
QARS-242ENST00000635443 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.62■■□□□ 1.69
QARS-242ENST00000635443 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.39■■□□□ 1.66
QARS-242ENST00000635443 NACADO15069 1562 aa25.29■■□□□ 1.64
QARS-242ENST00000635443 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.25■■□□□ 1.63
QARS-242ENST00000635443 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.22■■□□□ 1.63
QARS-242ENST00000635443 SCRIBQ14160 1630 aa24.82■■□□□ 1.56
QARS-242ENST00000635443 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.8■■□□□ 1.56
QARS-242ENST00000635443 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.6■■□□□ 1.53
QARS-242ENST00000635443 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.489e-8■■■■□ 20.2
QARS-242ENST00000635443 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.29■■□□□ 1.48
QARS-242ENST00000635443 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.83■■□□□ 1.41
QARS-242ENST00000635443 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
QARS-242ENST00000635443 SMARCA4P51532 1647 aa23.73■■□□□ 1.39
QARS-242ENST00000635443 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
QARS-242ENST00000635443 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
QARS-242ENST00000635443 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.67■■□□□ 1.38
QARS-242ENST00000635443 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
QARS-242ENST00000635443 WIZO95785 1651 aa23.51■■□□□ 1.35
QARS-242ENST00000635443 SMARCA2P51531 1590 aa23.48■■□□□ 1.35
QARS-242ENST00000635443 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.44■■□□□ 1.34
QARS-242ENST00000635443 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.4■■□□□ 1.34
QARS-242ENST00000635443 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.4■■□□□ 1.34
QARS-242ENST00000635443 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
QARS-242ENST00000635443 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
QARS-242ENST00000635443 NCAPD3P42695 1498 aa23.26■■□□□ 1.31
QARS-242ENST00000635443 HMGXB3Q12766 1538 aa23.25■■□□□ 1.31
QARS-242ENST00000635443 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.05■■□□□ 1.28
QARS-242ENST00000635443 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.98■■□□□ 1.27
QARS-242ENST00000635443 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
QARS-242ENST00000635443 CFTRP13569 1480 aa22.63■■□□□ 1.21
QARS-242ENST00000635443 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.63■■□□□ 1.21
QARS-242ENST00000635443 PRDM2Q13029 1718 aa22.62■■□□□ 1.21
QARS-242ENST00000635443 NESP48681 1621 aa22.57■■□□□ 1.2
QARS-242ENST00000635443 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.48■■□□□ 1.19
QARS-242ENST00000635443 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
QARS-242ENST00000635443 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.4■■□□□ 1.18
QARS-242ENST00000635443 ABCC8Q09428 1581 aa22.38■■□□□ 1.17
QARS-242ENST00000635443 ERCC6Q03468 1493 aa22.38■■□□□ 1.17
QARS-242ENST00000635443 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.37■■□□□ 1.17
QARS-242ENST00000635443 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.35■■□□□ 1.17
QARS-242ENST00000635443 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
QARS-242ENST00000635443 TRIM41Q8WV44 630 aa22.33■■□□□ 1.17
QARS-242ENST00000635443 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.21■■□□□ 1.15
QARS-242ENST00000635443 SYNJ1O43426 1573 aa22.21■■□□□ 1.15
QARS-242ENST00000635443 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.2■■□□□ 1.14
QARS-242ENST00000635443 TOP2BQ02880 1626 aa22.18■■□□□ 1.14
QARS-242ENST00000635443 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
QARS-242ENST00000635443 CUX1P39880 1505 aa22.18■■□□□ 1.14
QARS-242ENST00000635443 TOPBP1Q92547 1522 aa22.14■■□□□ 1.13
QARS-242ENST00000635443 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
QARS-242ENST00000635443 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
QARS-242ENST00000635443 WDR62O43379 1518 aa22.06■■□□□ 1.12
QARS-242ENST00000635443 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.05■■□□□ 1.12
QARS-242ENST00000635443 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
QARS-242ENST00000635443 SOGA1O94964 1423 aa21.95■■□□□ 1.1
QARS-242ENST00000635443 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.9■■□□□ 1.1
QARS-242ENST00000635443 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
QARS-242ENST00000635443 IFT140Q96RY7 1462 aa21.87■■□□□ 1.09
QARS-242ENST00000635443 CUX2O14529 1486 aa21.86■■□□□ 1.09
QARS-242ENST00000635443 KIF27Q86VH2 1401 aa21.85■■□□□ 1.09
QARS-242ENST00000635443 EEA1Q15075 1411 aa21.84■■□□□ 1.09
QARS-242ENST00000635443 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.83■■□□□ 1.09
QARS-242ENST00000635443 WDR97A6NE52 1622 aa21.8■■□□□ 1.08
QARS-242ENST00000635443 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
QARS-242ENST00000635443 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.75■■□□□ 1.07
QARS-242ENST00000635443 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
QARS-242ENST00000635443 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.71■■□□□ 1.07
QARS-242ENST00000635443 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
QARS-242ENST00000635443 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.69■■□□□ 1.06
QARS-242ENST00000635443 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
QARS-242ENST00000635443 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
QARS-242ENST00000635443 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
QARS-242ENST00000635443 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.068e-7■■■■□ 21.5
QARS-242ENST00000635443 GRIN2BQ13224 1484 aa21.61■■□□□ 1.05
QARS-242ENST00000635443 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.61■■□□□ 1.05
QARS-242ENST00000635443 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
QARS-242ENST00000635443 CUL7Q14999 1698 aa21.59■■□□□ 1.05
QARS-242ENST00000635443 IGF1RP08069 1367 aa21.57■■□□□ 1.04
QARS-242ENST00000635443 KIF21BO75037 1637 aa21.55■■□□□ 1.04
QARS-242ENST00000635443 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.53■■□□□ 1.04
QARS-242ENST00000635443 GOLGA3Q08378 1498 aa21.52■■□□□ 1.04
QARS-242ENST00000635443 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.5■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.49■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 ADAMTS12P58397 1594 aa21.48■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 PRXQ9BXM0 1461 aa21.47■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.47■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.46■■□□□ 1.03
QARS-242ENST00000635443 FBLN2P98095 1184 aa21.42■■□□□ 1.02
QARS-242ENST00000635443 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
QARS-242ENST00000635443 SYNJ2O15056 1496 aa21.39■■□□□ 1.01
QARS-242ENST00000635443 GRIN2AQ12879 1464 aa21.32■■□□□ 1
QARS-242ENST00000635443 CHD1O14646 1710 aa21.31■■□□□ 1
QARS-242ENST00000635443 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.31■■□□□ 1
QARS-242ENST00000635443 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms