RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630685.2

PCBP1-AS1-364, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 633 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.49■■■□□ 2.95
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FOXD1Q16676 465 aa27.38■■□□□ 1.97
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.07■■□□□ 1.92
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.97■■□□□ 1.75
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ADRA2BP18089 450 aa25.93■■□□□ 1.74
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 MSH5O43196 834 aa25.55■■□□□ 1.68
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 POTEDQ86YR6 584 aa23.85■■□□□ 1.41
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.73■■□□□ 1.39
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.51■■□□□ 1.35
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.22■■□□□ 1.31
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 KCNA4P22459 653 aa22.66■■□□□ 1.22
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.44■■□□□ 1.18
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.21■■□□□ 1.15
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.083e-8■■□□□ 13.5
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 RNF39Q9H2S5 420 aa21.78■■□□□ 1.08
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SLC4A2P04920 1241 aa21.45■■□□□ 1.02
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.07■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 APLP2Q06481 763 aa21.01■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CAPN15O75808 1086 aa20.81■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ZBTB22O15209 634 aa20.8■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 DSG3P32926 999 aa20.56■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.45■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.41■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.39■□□□□ 0.85
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ABCB7O75027 752 aa20.32■□□□□ 0.84
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 POLA2Q14181 598 aa20.19■□□□□ 0.82
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PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FBLN2P98095 1184 aa19.67■□□□□ 0.74
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PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SPDYE6P0CI01 402 aa19.35■□□□□ 0.69
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SPDYE2Q495Y8 402 aa19.35■□□□□ 0.69
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 AKT1S1Q96B36 256 aa19.35■□□□□ 0.69
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.12■□□□□ 0.65
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.98■□□□□ 0.63
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.89■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PITPNM1O00562 1244 aa18.87■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.86■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 POTEHQ6S545 545 aa18.84■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.71■□□□□ 0.59
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.62■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.6■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PROM2Q8N271 834 aa18.55■□□□□ 0.56
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PRR29P0C7W0 189 aa18.54■□□□□ 0.56
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FKBP8Q14318 412 aa18.48■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CHADLQ6NUI6 762 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CREBZFQ9NS37 354 aa18.16■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 HAX1O00165 279 aa18.15■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FBXO3Q9UK99 471 aa18.09■□□□□ 0.49
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.02■□□□□ 0.48
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PLEKHG5O94827 1062 aa18.02■□□□□ 0.48
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 MIER1Q8N108 512 aa17.96■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.91■□□□□ 0.46
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 EVX2Q03828 476 aa17.84■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 CLCN6P51797 869 aa17.71■□□□□ 0.43
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.69■□□□□ 0.42
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 GABBR2O75899 941 aa17.58■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 KLHL34Q8N239 644 aa17.54■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 NUBP1P53384 320 aa17.53■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 RASEFQ8IZ41 740 aa17.52■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-364ENST00000630685 FAM212AQ96EL1 285 aa17.47■□□□□ 0.39
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