RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.076e-19■■□□□ 11.6
RPS6KC1-208ENST00000614059 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.049e-18■■■■■ 145.2
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.365e-17■■■■■ 33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.537e-17■■■□□ 17.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.32e-14■■■□□ 18.8
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.295e-12■■■■□ 23.9
RPS6KC1-208ENST00000614059 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.593e-10■■■■□ 23.6
RPS6KC1-208ENST00000614059 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.183e-10■■■■■ 31
RPS6KC1-208ENST00000614059 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP13.93□□□□□ -0.184e-10■■■■■ 32.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.06□□□□□ -0.165e-10■■■■■ 37.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.256e-9■■■■□ 24.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.179e-8■■■■□ 20.8
RPS6KC1-208ENST00000614059 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 22.3
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.092e-7■■□□□ 12.3
RPS6KC1-208ENST00000614059 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.282e-7■■□□□ 14.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.013e-7■■■□□ 14.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.584e-7■□□□□ 10.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 107.6
RPS6KC1-208ENST00000614059 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 35
RPS6KC1-208ENST00000614059 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.446e-7■□□□□ 8.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.26e-7■■□□□ 12.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.139e-7■□□□□ 9.9
RPS6KC1-208ENST00000614059 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 17.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 22.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 17.3
RPS6KC1-208ENST00000614059 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 27.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 92.8
RPS6KC1-208ENST00000614059 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 60.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 23.8
RPS6KC1-208ENST00000614059 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 17.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 45.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 19.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 8.9
RPS6KC1-208ENST00000614059 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 24.7
RPS6KC1-208ENST00000614059 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 23
RPS6KC1-208ENST00000614059 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 17.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 20.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 13.9
RPS6KC1-208ENST00000614059 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.284e-6■■■□□ 15
RPS6KC1-208ENST00000614059 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 22.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.495e-6■■■■□ 19.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 25.5
RPS6KC1-208ENST00000614059 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 24.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 8.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.74□□□□□ -0.056e-6■■□□□ 12.4
RPS6KC1-208ENST00000614059 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.017e-6■■□□□ 12.2
RPS6KC1-208ENST00000614059 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.549e-6■■■■■ 50.1
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