RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.61■■■□□ 2.81
SENP3-209ENST00000610454 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.12■■■□□ 2.25
SENP3-209ENST00000610454 ABCC9O60706 1549 aa28.6■■■□□ 2.17
SENP3-209ENST00000610454 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.49■■□□□ 1.99
SENP3-209ENST00000610454 NACADO15069 1562 aa27.39■■□□□ 1.98
SENP3-209ENST00000610454 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.39■■□□□ 1.98
SENP3-209ENST00000610454 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
SENP3-209ENST00000610454 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SENP3-209ENST00000610454 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.98■■□□□ 1.91
SENP3-209ENST00000610454 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.84■■□□□ 1.89
SENP3-209ENST00000610454 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
SENP3-209ENST00000610454 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.57■■□□□ 1.84
SENP3-209ENST00000610454 SCRIBQ14160 1630 aa26.56■■□□□ 1.84
SENP3-209ENST00000610454 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.36■■□□□ 1.81
SENP3-209ENST00000610454 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.27■■□□□ 1.8
SENP3-209ENST00000610454 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SENP3-209ENST00000610454 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.87■■□□□ 1.73
SENP3-209ENST00000610454 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
SENP3-209ENST00000610454 SMARCA4P51532 1647 aa25.37■■□□□ 1.65
SENP3-209ENST00000610454 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SENP3-209ENST00000610454 SMARCA2P51531 1590 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP3-209ENST00000610454 NCAPD3P42695 1498 aa25.23■■□□□ 1.63
SENP3-209ENST00000610454 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.23■■□□□ 1.63
SENP3-209ENST00000610454 HMGXB3Q12766 1538 aa25.14■■□□□ 1.62
SENP3-209ENST00000610454 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.12■■□□□ 1.61
SENP3-209ENST00000610454 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.09■■□□□ 1.61
SENP3-209ENST00000610454 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SENP3-209ENST00000610454 WIZO95785 1651 aa24.88■■□□□ 1.57
SENP3-209ENST00000610454 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SENP3-209ENST00000610454 ERCC6Q03468 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-209ENST00000610454 NESP48681 1621 aa24.68■■□□□ 1.54
SENP3-209ENST00000610454 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.65■■□□□ 1.54
SENP3-209ENST00000610454 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SENP3-209ENST00000610454 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.51■■□□□ 1.51
SENP3-209ENST00000610454 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.5■■□□□ 1.51
SENP3-209ENST00000610454 CUX2O14529 1486 aa24.47■■□□□ 1.51
SENP3-209ENST00000610454 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.43■■□□□ 1.5
SENP3-209ENST00000610454 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SENP3-209ENST00000610454 CFTRP13569 1480 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-209ENST00000610454 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.29■■□□□ 1.48
SENP3-209ENST00000610454 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP3-209ENST00000610454 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP3-209ENST00000610454 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.24■■□□□ 1.47
SENP3-209ENST00000610454 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
SENP3-209ENST00000610454 WDR62O43379 1518 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP3-209ENST00000610454 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SENP3-209ENST00000610454 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SENP3-209ENST00000610454 ABCC8Q09428 1581 aa23.87■■□□□ 1.41
SENP3-209ENST00000610454 TOPBP1Q92547 1522 aa23.84■■□□□ 1.41
SENP3-209ENST00000610454 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.83■■□□□ 1.41
SENP3-209ENST00000610454 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.82■■□□□ 1.4
SENP3-209ENST00000610454 IFT140Q96RY7 1462 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-209ENST00000610454 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SENP3-209ENST00000610454 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SENP3-209ENST00000610454 CUX1P39880 1505 aa23.59■■□□□ 1.37
SENP3-209ENST00000610454 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
SENP3-209ENST00000610454 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SENP3-209ENST00000610454 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.56■■□□□ 1.36
SENP3-209ENST00000610454 SOGA1O94964 1423 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-209ENST00000610454 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.5■■□□□ 1.35
SENP3-209ENST00000610454 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
SENP3-209ENST00000610454 WDR97A6NE52 1622 aa23.44■■□□□ 1.34
SENP3-209ENST00000610454 OSCARQ8IYS5 282 aa23.43■■□□□ 1.34
SENP3-209ENST00000610454 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
SENP3-209ENST00000610454 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SENP3-209ENST00000610454 TOP2BQ02880 1626 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-209ENST00000610454 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.38■■□□□ 1.33
SENP3-209ENST00000610454 SYNJ1O43426 1573 aa23.35■■□□□ 1.33
SENP3-209ENST00000610454 CHD1O14646 1710 aa23.31■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.31■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 FBLN2P98095 1184 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 GRIN2BQ13224 1484 aa23.29■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.28■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 PBRM1Q86U86 1689 aa23.27■■□□□ 1.32
SENP3-209ENST00000610454 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-209ENST00000610454 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-209ENST00000610454 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SENP3-209ENST00000610454 SYNJ2O15056 1496 aa23.16■■□□□ 1.3
SENP3-209ENST00000610454 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 TRIM41Q8WV44 630 aa23.07■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.05■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 ADAMTS12P58397 1594 aa23.05■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 ARHGEF11O15085 1522 aa23.04■■□□□ 1.28
SENP3-209ENST00000610454 CLASP1Q7Z460 1538 aa23■■□□□ 1.27
SENP3-209ENST00000610454 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP3-209ENST00000610454 GRIN2AQ12879 1464 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP3-209ENST00000610454 KIF27Q86VH2 1401 aa22.96■■□□□ 1.27
SENP3-209ENST00000610454 CEP170Q5SW79 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
SENP3-209ENST00000610454 CUL7Q14999 1698 aa22.86■■□□□ 1.25
SENP3-209ENST00000610454 NUP160Q12769 1436 aa22.85■■□□□ 1.25
SENP3-209ENST00000610454 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.84■■□□□ 1.25
SENP3-209ENST00000610454 ARAP1Q96P48 1450 aa22.83■■□□□ 1.25
SENP3-209ENST00000610454 IGF1RP08069 1367 aa22.81■■□□□ 1.24
SENP3-209ENST00000610454 SHROOM2Q13796 1616 aa22.71■■□□□ 1.23
SENP3-209ENST00000610454 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.71■■□□□ 1.23
SENP3-209ENST00000610454 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.71■■□□□ 1.23
SENP3-209ENST00000610454 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.65■■□□□ 1.22
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