RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-215ENST00000602164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.5■■■■■ 8.08
USF2-215ENST00000602164 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.25■■■■■ 6.92
USF2-215ENST00000602164 ABCC9O60706 1549 aa56.91■■■■■ 6.7
USF2-215ENST00000602164 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.76■■■■■ 6.36
USF2-215ENST00000602164 NACADO15069 1562 aa54.72■■■■■ 6.35
USF2-215ENST00000602164 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.6■■■■■ 6.33
USF2-215ENST00000602164 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.47■■■■■ 6.31
USF2-215ENST00000602164 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.45■■■■■ 6.31
USF2-215ENST00000602164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.23■■■■■ 6.27
USF2-215ENST00000602164 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.59■■■■■ 6.17
USF2-215ENST00000602164 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.21■■■■■ 6.11
USF2-215ENST00000602164 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.13■■■■■ 6.1
USF2-215ENST00000602164 SCRIBQ14160 1630 aa53.1■■■■■ 6.09
USF2-215ENST00000602164 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.61■■■■■ 6.01
USF2-215ENST00000602164 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.25■■■■■ 5.95
USF2-215ENST00000602164 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.74■■■■■ 5.87
USF2-215ENST00000602164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.52■■■■■ 5.84
USF2-215ENST00000602164 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.14■■■■■ 5.78
USF2-215ENST00000602164 SMARCA4P51532 1647 aa50.84■■■■■ 5.73
USF2-215ENST00000602164 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.74■■■■■ 5.71
USF2-215ENST00000602164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.53■■■■■ 5.68
USF2-215ENST00000602164 NCAPD3P42695 1498 aa50.51■■■■■ 5.68
USF2-215ENST00000602164 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.49■■■■■ 5.67
USF2-215ENST00000602164 SMARCA2P51531 1590 aa50.45■■■■■ 5.67
USF2-215ENST00000602164 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.38■■■■■ 5.66
USF2-215ENST00000602164 HMGXB3Q12766 1538 aa50.29■■■■■ 5.64
USF2-215ENST00000602164 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.08■■■■■ 5.61
USF2-215ENST00000602164 WIZO95785 1651 aa49.93■■■■■ 5.58
USF2-215ENST00000602164 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.9■■■■■ 5.58
USF2-215ENST00000602164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
USF2-215ENST00000602164 NESP48681 1621 aa49.29■■■■■ 5.48
USF2-215ENST00000602164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.16■■■■■ 5.46
USF2-215ENST00000602164 CADPSQ9ULU8 1353 aa49■■■■■ 5.43
USF2-215ENST00000602164 ERCC6Q03468 1493 aa48.99■■■■■ 5.43
USF2-215ENST00000602164 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.8■■■■■ 5.4
USF2-215ENST00000602164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.76■■■■■ 5.4
USF2-215ENST00000602164 CFTRP13569 1480 aa48.75■■■■■ 5.4
USF2-215ENST00000602164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.72■■■■■ 5.39
USF2-215ENST00000602164 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
USF2-215ENST00000602164 CUX2O14529 1486 aa48.55■■■■■ 5.36
USF2-215ENST00000602164 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
USF2-215ENST00000602164 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.44■■■■■ 5.35
USF2-215ENST00000602164 PRDM2Q13029 1718 aa48.4■■■■■ 5.34
USF2-215ENST00000602164 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.37■■■■■ 5.33
USF2-215ENST00000602164 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.32■■■■■ 5.33
USF2-215ENST00000602164 WDR62O43379 1518 aa48.21■■■■■ 5.31
USF2-215ENST00000602164 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
USF2-215ENST00000602164 TOPBP1Q92547 1522 aa47.7■■■■■ 5.23
USF2-215ENST00000602164 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.65■■■■■ 5.22
USF2-215ENST00000602164 ABCC8Q09428 1581 aa47.63■■■■■ 5.22
USF2-215ENST00000602164 CUX1P39880 1505 aa47.37■■■■■ 5.17
USF2-215ENST00000602164 IFT140Q96RY7 1462 aa47.37■■■■■ 5.17
USF2-215ENST00000602164 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
USF2-215ENST00000602164 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
USF2-215ENST00000602164 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
USF2-215ENST00000602164 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.18■■■■■ 5.14
USF2-215ENST00000602164 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.08■■■■■ 5.13
USF2-215ENST00000602164 SOGA1O94964 1423 aa47.03■■■■■ 5.12
USF2-215ENST00000602164 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
USF2-215ENST00000602164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47■■■■■ 5.11
USF2-215ENST00000602164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.99■■■■■ 5.11
USF2-215ENST00000602164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.97■■■■■ 5.11
USF2-215ENST00000602164 SYNJ1O43426 1573 aa46.96■■■■■ 5.11
USF2-215ENST00000602164 TOP2BQ02880 1626 aa46.95■■■■■ 5.11
USF2-215ENST00000602164 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.89■■■■■ 5.13e-9■■■■■ 36.3
USF2-215ENST00000602164 WDR97A6NE52 1622 aa46.87■■■■■ 5.09
USF2-215ENST00000602164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
USF2-215ENST00000602164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.74■■■■■ 5.07
USF2-215ENST00000602164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.58■■■■■ 5.05
USF2-215ENST00000602164 GRIN2BQ13224 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
USF2-215ENST00000602164 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.51■■■■■ 5.04
USF2-215ENST00000602164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.47■■■■■ 5.03
USF2-215ENST00000602164 PBRM1Q86U86 1689 aa46.46■■■■■ 5.03
USF2-215ENST00000602164 OSCARQ8IYS5 282 aa46.43■■■■■ 5.02
USF2-215ENST00000602164 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
USF2-215ENST00000602164 CHD1O14646 1710 aa46.4■■■■■ 5.02
USF2-215ENST00000602164 SYNJ2O15056 1496 aa46.22■■■■■ 4.99
USF2-215ENST00000602164 FBLN2P98095 1184 aa46.17■■■■■ 4.98
USF2-215ENST00000602164 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.16■■■■■ 4.98
USF2-215ENST00000602164 ADAMTS12P58397 1594 aa46.13■■■■■ 4.97
USF2-215ENST00000602164 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
USF2-215ENST00000602164 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.99■■■■■ 4.95
USF2-215ENST00000602164 KIF27Q86VH2 1401 aa45.99■■■■■ 4.95
USF2-215ENST00000602164 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.95■■■■■ 4.95
USF2-215ENST00000602164 GRIN2AQ12879 1464 aa45.94■■■■■ 4.95
USF2-215ENST00000602164 IGF1RP08069 1367 aa45.84■■■■■ 4.93
USF2-215ENST00000602164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.81■■■■■ 4.92
USF2-215ENST00000602164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.81■■■■■ 4.92
USF2-215ENST00000602164 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.81■■■■■ 4.92
USF2-215ENST00000602164 ARHGEF11O15085 1522 aa45.8■■■■■ 4.92
USF2-215ENST00000602164 NUP160Q12769 1436 aa45.77■■■■■ 4.92
USF2-215ENST00000602164 TRIM41Q8WV44 630 aa45.77■■■■■ 4.92
USF2-215ENST00000602164 CEP170Q5SW79 1584 aa45.75■■■■■ 4.91
USF2-215ENST00000602164 CUL7Q14999 1698 aa45.74■■■■■ 4.91
USF2-215ENST00000602164 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.65■■■■■ 4.9
USF2-215ENST00000602164 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.53■■■■■ 4.88
USF2-215ENST00000602164 ARAP1Q96P48 1450 aa45.46■■■■■ 4.87
USF2-215ENST00000602164 SHROOM2Q13796 1616 aa45.45■■■■■ 4.87
USF2-215ENST00000602164 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.32■■■■■ 4.85
USF2-215ENST00000602164 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.32■■■■■ 4.85
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