RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590381.5

PQLC1-211, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PQLC1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-211ENST00000590381 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.7■■■■■ 5.55
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PQLC1-211ENST00000590381 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.51■■■■■ 5.52
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PQLC1-211ENST00000590381 IQGAP2Q13576 1575 aa49.11■■■■■ 5.45
PQLC1-211ENST00000590381 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.04■■■■■ 5.44
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PQLC1-211ENST00000590381 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49■■■■■ 5.43
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PQLC1-211ENST00000590381 ABCC2Q92887 1545 aa48.62■■■■■ 5.37
PQLC1-211ENST00000590381 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.57■■■■■ 5.37
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PQLC1-211ENST00000590381 ASXL2Q76L83 1435 aa48.43■■■■■ 5.34
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PQLC1-211ENST00000590381 KIF21BO75037 1637 aa48■■■■■ 5.27
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PQLC1-211ENST00000590381 KCNH8Q96L42 1107 aa47.91■■■■■ 5.26
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PQLC1-211ENST00000590381 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.83■■■■■ 5.25
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PQLC1-211ENST00000590381 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.75■■■■■ 5.23
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PQLC1-211ENST00000590381 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.13
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PQLC1-211ENST00000590381 CLIP1P30622 1438 aa46.84■■■■■ 5.09
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PQLC1-211ENST00000590381 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.82■■■■■ 5.09
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PQLC1-211ENST00000590381 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.68■■■■■ 5.06
PQLC1-211ENST00000590381 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.67■■■■■ 5.06
PQLC1-211ENST00000590381 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.64■■■■■ 5.06
PQLC1-211ENST00000590381 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.63■■■■■ 5.06
PQLC1-211ENST00000590381 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.63■■■■■ 5.05
PQLC1-211ENST00000590381 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.57■■■■■ 5.05
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PQLC1-211ENST00000590381 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.54■■■■■ 5.04
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