RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589446.5

SEH1L-206, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 655 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-206ENST00000589446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.35■■■■■ 4.37
SEH1L-206ENST00000589446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.83■■■■□ 3.65
SEH1L-206ENST00000589446 ABCC9O60706 1549 aa37.68■■■■□ 3.62
SEH1L-206ENST00000589446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36■■■■□ 3.35
SEH1L-206ENST00000589446 NACADO15069 1562 aa35.82■■■■□ 3.32
SEH1L-206ENST00000589446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.81■■■■□ 3.32
SEH1L-206ENST00000589446 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.44■■■■□ 3.26
SEH1L-206ENST00000589446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
SEH1L-206ENST00000589446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.15■■■■□ 3.22
SEH1L-206ENST00000589446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
SEH1L-206ENST00000589446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.04■■■■□ 3.2
SEH1L-206ENST00000589446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.9■■■■□ 3.18
SEH1L-206ENST00000589446 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.81■■■■□ 3.16
SEH1L-206ENST00000589446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.58■■■■□ 3.13
SEH1L-206ENST00000589446 SCRIBQ14160 1630 aa34.48■■■■□ 3.11
SEH1L-206ENST00000589446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
SEH1L-206ENST00000589446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.01■■■■□ 3.03
SEH1L-206ENST00000589446 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.98■■■■□ 3.03
SEH1L-206ENST00000589446 NCAPD3P42695 1498 aa33.1■■■□□ 2.89
SEH1L-206ENST00000589446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.99■■■□□ 2.87
SEH1L-206ENST00000589446 SMARCA2P51531 1590 aa32.93■■■□□ 2.86
SEH1L-206ENST00000589446 SMARCA4P51532 1647 aa32.92■■■□□ 2.86
SEH1L-206ENST00000589446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
SEH1L-206ENST00000589446 HMGXB3Q12766 1538 aa32.81■■■□□ 2.84
SEH1L-206ENST00000589446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
SEH1L-206ENST00000589446 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.64■■■□□ 2.82
SEH1L-206ENST00000589446 ERCC6Q03468 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
SEH1L-206ENST00000589446 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.58■■■□□ 2.81
SEH1L-206ENST00000589446 CUX2O14529 1486 aa32.48■■■□□ 2.79
SEH1L-206ENST00000589446 NESP48681 1621 aa32.38■■■□□ 2.77
SEH1L-206ENST00000589446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.27■■■□□ 2.76
SEH1L-206ENST00000589446 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.25■■■□□ 2.75
SEH1L-206ENST00000589446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.2■■■□□ 2.75
SEH1L-206ENST00000589446 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.14■■■□□ 2.74
SEH1L-206ENST00000589446 WIZO95785 1651 aa32.13■■■□□ 2.73
SEH1L-206ENST00000589446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
SEH1L-206ENST00000589446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
SEH1L-206ENST00000589446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.87■■■□□ 2.69
SEH1L-206ENST00000589446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
SEH1L-206ENST00000589446 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.81■■■□□ 2.68
SEH1L-206ENST00000589446 CFTRP13569 1480 aa31.77■■■□□ 2.68
SEH1L-206ENST00000589446 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.73■■■□□ 2.67
SEH1L-206ENST00000589446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.72■■■□□ 2.67
SEH1L-206ENST00000589446 WDR62O43379 1518 aa31.67■■■□□ 2.66
SEH1L-206ENST00000589446 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.51■■■□□ 2.63
SEH1L-206ENST00000589446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
SEH1L-206ENST00000589446 PRDM2Q13029 1718 aa31.24■■■□□ 2.59
SEH1L-206ENST00000589446 ABCC8Q09428 1581 aa31.18■■■□□ 2.58
SEH1L-206ENST00000589446 OSCARQ8IYS5 282 aa31.13■■■□□ 2.57
SEH1L-206ENST00000589446 IFT140Q96RY7 1462 aa31.13■■■□□ 2.57
SEH1L-206ENST00000589446 TOPBP1Q92547 1522 aa31.1■■■□□ 2.57
SEH1L-206ENST00000589446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31■■■□□ 2.55
SEH1L-206ENST00000589446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
SEH1L-206ENST00000589446 TRIM41Q8WV44 630 aa30.91■■■□□ 2.54
SEH1L-206ENST00000589446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SEH1L-206ENST00000589446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
SEH1L-206ENST00000589446 SOGA1O94964 1423 aa30.75■■■□□ 2.51
SEH1L-206ENST00000589446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.75■■■□□ 2.51
SEH1L-206ENST00000589446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
SEH1L-206ENST00000589446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
SEH1L-206ENST00000589446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.67■■■□□ 2.5
SEH1L-206ENST00000589446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SEH1L-206ENST00000589446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.63■■■□□ 2.49
SEH1L-206ENST00000589446 FBLN2P98095 1184 aa30.62■■■□□ 2.49
SEH1L-206ENST00000589446 CUX1P39880 1505 aa30.6■■■□□ 2.49
SEH1L-206ENST00000589446 WDR97A6NE52 1622 aa30.55■■■□□ 2.48
SEH1L-206ENST00000589446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SEH1L-206ENST00000589446 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.46■■■□□ 2.47
SEH1L-206ENST00000589446 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.46■■■□□ 2.47
SEH1L-206ENST00000589446 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.46■■■□□ 2.47
SEH1L-206ENST00000589446 ARHGEF11O15085 1522 aa30.45■■■□□ 2.47
SEH1L-206ENST00000589446 GRIN2BQ13224 1484 aa30.44■■■□□ 2.46
SEH1L-206ENST00000589446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.43■■■□□ 2.46
SEH1L-206ENST00000589446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SEH1L-206ENST00000589446 CHD1O14646 1710 aa30.39■■■□□ 2.46
SEH1L-206ENST00000589446 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.35■■■□□ 2.45
SEH1L-206ENST00000589446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
SEH1L-206ENST00000589446 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.34■■■□□ 2.45
SEH1L-206ENST00000589446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.33■■■□□ 2.45
SEH1L-206ENST00000589446 SYNJ2O15056 1496 aa30.31■■■□□ 2.44
SEH1L-206ENST00000589446 SYNJ1O43426 1573 aa30.24■■■□□ 2.43
SEH1L-206ENST00000589446 TOP2BQ02880 1626 aa30.18■■■□□ 2.42
SEH1L-206ENST00000589446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.16■■■□□ 2.42
SEH1L-206ENST00000589446 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.16■■■□□ 2.42
SEH1L-206ENST00000589446 ARAP1Q96P48 1450 aa30.14■■■□□ 2.42
SEH1L-206ENST00000589446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.13■■■□□ 2.41
SEH1L-206ENST00000589446 PBRM1Q86U86 1689 aa30.13■■■□□ 2.41
SEH1L-206ENST00000589446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.01■■■□□ 2.39
SEH1L-206ENST00000589446 GRIN2AQ12879 1464 aa30■■■□□ 2.39
SEH1L-206ENST00000589446 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SEH1L-206ENST00000589446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.96■■■□□ 2.39
SEH1L-206ENST00000589446 ADAMTS12P58397 1594 aa29.94■■■□□ 2.38
SEH1L-206ENST00000589446 NUP160Q12769 1436 aa29.9■■■□□ 2.38
SEH1L-206ENST00000589446 CEP170Q5SW79 1584 aa29.8■■■□□ 2.36
SEH1L-206ENST00000589446 KIF27Q86VH2 1401 aa29.74■■■□□ 2.35
SEH1L-206ENST00000589446 JPH4Q96JJ6 628 aa29.71■■■□□ 2.35
SEH1L-206ENST00000589446 IGF1RP08069 1367 aa29.68■■■□□ 2.34
SEH1L-206ENST00000589446 SHROOM2Q13796 1616 aa29.64■■■□□ 2.34
SEH1L-206ENST00000589446 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.64■■■□□ 2.33
SEH1L-206ENST00000589446 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms