RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588251.1

SEH1L-205, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 3

Gene SEH1L, Length 789 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-205ENST00000588251 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.47■■■■■ 4.23
SEH1L-205ENST00000588251 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.86■■■■□ 3.49
SEH1L-205ENST00000588251 ABCC9O60706 1549 aa36.57■■■■□ 3.44
SEH1L-205ENST00000588251 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.98■■■■□ 3.19
SEH1L-205ENST00000588251 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.92■■■■□ 3.18
SEH1L-205ENST00000588251 NACADO15069 1562 aa34.81■■■■□ 3.16
SEH1L-205ENST00000588251 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.47■■■■□ 3.11
SEH1L-205ENST00000588251 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
SEH1L-205ENST00000588251 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.23■■■■□ 3.07
SEH1L-205ENST00000588251 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.22■■■■□ 3.07
SEH1L-205ENST00000588251 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.07■■■■□ 3.05
SEH1L-205ENST00000588251 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.97■■■■□ 3.03
SEH1L-205ENST00000588251 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.91■■■■□ 3.02
SEH1L-205ENST00000588251 SCRIBQ14160 1630 aa33.73■■■□□ 2.99
SEH1L-205ENST00000588251 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.43■■■□□ 2.94
SEH1L-205ENST00000588251 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
SEH1L-205ENST00000588251 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.99■■■□□ 2.87
SEH1L-205ENST00000588251 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.87■■■□□ 2.85
SEH1L-205ENST00000588251 SMARCA4P51532 1647 aa32.2■■■□□ 2.75
SEH1L-205ENST00000588251 NCAPD3P42695 1498 aa32.19■■■□□ 2.74
SEH1L-205ENST00000588251 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.17■■■□□ 2.74
SEH1L-205ENST00000588251 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
SEH1L-205ENST00000588251 SMARCA2P51531 1590 aa32.04■■■□□ 2.72
SEH1L-205ENST00000588251 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.98■■■□□ 2.71
SEH1L-205ENST00000588251 HMGXB3Q12766 1538 aa31.92■■■□□ 2.7
SEH1L-205ENST00000588251 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SEH1L-205ENST00000588251 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.85■■■□□ 2.69
SEH1L-205ENST00000588251 WIZO95785 1651 aa31.59■■■□□ 2.65
SEH1L-205ENST00000588251 NESP48681 1621 aa31.56■■■□□ 2.64
SEH1L-205ENST00000588251 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
SEH1L-205ENST00000588251 ERCC6Q03468 1493 aa31.52■■■□□ 2.64
SEH1L-205ENST00000588251 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.32■■■□□ 2.6
SEH1L-205ENST00000588251 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.28■■■□□ 2.6
SEH1L-205ENST00000588251 CUX2O14529 1486 aa31.24■■■□□ 2.59
SEH1L-205ENST00000588251 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
SEH1L-205ENST00000588251 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.2■■■□□ 2.59
SEH1L-205ENST00000588251 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.05■■■□□ 2.56
SEH1L-205ENST00000588251 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SEH1L-205ENST00000588251 CFTRP13569 1480 aa30.98■■■□□ 2.55
SEH1L-205ENST00000588251 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.93■■■□□ 2.54
SEH1L-205ENST00000588251 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.89■■■□□ 2.53
SEH1L-205ENST00000588251 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.87■■■□□ 2.53
SEH1L-205ENST00000588251 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.84■■■□□ 2.53
SEH1L-205ENST00000588251 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.77■■■□□ 2.52
SEH1L-205ENST00000588251 WDR62O43379 1518 aa30.74■■■□□ 2.51
SEH1L-205ENST00000588251 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
SEH1L-205ENST00000588251 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
SEH1L-205ENST00000588251 PRDM2Q13029 1718 aa30.53■■■□□ 2.48
SEH1L-205ENST00000588251 TOPBP1Q92547 1522 aa30.34■■■□□ 2.45
SEH1L-205ENST00000588251 ABCC8Q09428 1581 aa30.28■■■□□ 2.44
SEH1L-205ENST00000588251 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.24■■■□□ 2.43
SEH1L-205ENST00000588251 IFT140Q96RY7 1462 aa30.22■■■□□ 2.43
SEH1L-205ENST00000588251 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SEH1L-205ENST00000588251 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SEH1L-205ENST00000588251 OSCARQ8IYS5 282 aa30.02■■■□□ 2.4
SEH1L-205ENST00000588251 CUX1P39880 1505 aa30.01■■■□□ 2.39
SEH1L-205ENST00000588251 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30■■■□□ 2.39
SEH1L-205ENST00000588251 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
SEH1L-205ENST00000588251 SOGA1O94964 1423 aa29.99■■■□□ 2.39
SEH1L-205ENST00000588251 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SEH1L-205ENST00000588251 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.95■■■□□ 2.39
SEH1L-205ENST00000588251 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SEH1L-205ENST00000588251 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SEH1L-205ENST00000588251 FBLN2P98095 1184 aa29.76■■■□□ 2.35
SEH1L-205ENST00000588251 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
SEH1L-205ENST00000588251 TRIM41Q8WV44 630 aa29.68■■■□□ 2.34
SEH1L-205ENST00000588251 WDR97A6NE52 1622 aa29.66■■■□□ 2.34
SEH1L-205ENST00000588251 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.65■■■□□ 2.34
SEH1L-205ENST00000588251 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.63■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 GRIN2BQ13224 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 SYNJ1O43426 1573 aa29.62■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 TOP2BQ02880 1626 aa29.62■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.6■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 CHD1O14646 1710 aa29.59■■■□□ 2.33
SEH1L-205ENST00000588251 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.57■■■□□ 2.32
SEH1L-205ENST00000588251 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SEH1L-205ENST00000588251 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.49■■■□□ 2.31
SEH1L-205ENST00000588251 SYNJ2O15056 1496 aa29.46■■■□□ 2.31
SEH1L-205ENST00000588251 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.45■■■□□ 2.31
SEH1L-205ENST00000588251 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.45■■■□□ 2.31
SEH1L-205ENST00000588251 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.45■■■□□ 2.31
SEH1L-205ENST00000588251 PBRM1Q86U86 1689 aa29.44■■■□□ 2.3
SEH1L-205ENST00000588251 ARHGEF11O15085 1522 aa29.44■■■□□ 2.3
SEH1L-205ENST00000588251 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.32■■■□□ 2.28
SEH1L-205ENST00000588251 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.3■■■□□ 2.28
SEH1L-205ENST00000588251 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.24■■■□□ 2.27
SEH1L-205ENST00000588251 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.24■■■□□ 2.27
SEH1L-205ENST00000588251 GRIN2AQ12879 1464 aa29.23■■■□□ 2.27
SEH1L-205ENST00000588251 ADAMTS12P58397 1594 aa29.23■■■□□ 2.27
SEH1L-205ENST00000588251 ARAP1Q96P48 1450 aa29.2■■■□□ 2.26
SEH1L-205ENST00000588251 NUP160Q12769 1436 aa29.12■■■□□ 2.25
SEH1L-205ENST00000588251 KIF27Q86VH2 1401 aa29.11■■■□□ 2.25
SEH1L-205ENST00000588251 IGF1RP08069 1367 aa29.1■■■□□ 2.25
SEH1L-205ENST00000588251 CEP170Q5SW79 1584 aa29.09■■■□□ 2.25
SEH1L-205ENST00000588251 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.95■■■□□ 2.22
SEH1L-205ENST00000588251 JPH4Q96JJ6 628 aa28.94■■■□□ 2.22
SEH1L-205ENST00000588251 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.9■■■□□ 2.22
SEH1L-205ENST00000588251 SHROOM2Q13796 1616 aa28.87■■■□□ 2.21
SEH1L-205ENST00000588251 CUL7Q14999 1698 aa28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms