RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587761.1

SEH1L-204, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-204ENST00000587761 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.21■■■■□ 3.23
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SEH1L-204ENST00000587761 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.28■■■□□ 2.44
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SEH1L-204ENST00000587761 NACADO15069 1562 aa30.04■■■□□ 2.4
SEH1L-204ENST00000587761 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.87■■■□□ 2.37
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SEH1L-204ENST00000587761 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.59■■■□□ 2.33
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SEH1L-204ENST00000587761 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.81■■■□□ 2.2
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SEH1L-204ENST00000587761 SCRIBQ14160 1630 aa28.78■■■□□ 2.2
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SEH1L-204ENST00000587761 SMARCA4P51532 1647 aa27.47■■□□□ 1.99
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SEH1L-204ENST00000587761 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
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SEH1L-204ENST00000587761 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.99■■□□□ 1.91
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SEH1L-204ENST00000587761 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.92■■□□□ 1.9
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SEH1L-204ENST00000587761 WDR62O43379 1518 aa26.7■■□□□ 1.86
SEH1L-204ENST00000587761 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.6■■□□□ 1.85
SEH1L-204ENST00000587761 TRIM41Q8WV44 630 aa26.58■■□□□ 1.85
SEH1L-204ENST00000587761 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.56■■□□□ 1.84
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SEH1L-204ENST00000587761 OSCARQ8IYS5 282 aa26.42■■□□□ 1.82
SEH1L-204ENST00000587761 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
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SEH1L-204ENST00000587761 IFT140Q96RY7 1462 aa26.11■■□□□ 1.77
SEH1L-204ENST00000587761 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SEH1L-204ENST00000587761 TOPBP1Q92547 1522 aa26.03■■□□□ 1.76
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SEH1L-204ENST00000587761 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
SEH1L-204ENST00000587761 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
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SEH1L-204ENST00000587761 ARHGEF11O15085 1522 aa25.89■■□□□ 1.74
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SEH1L-204ENST00000587761 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
SEH1L-204ENST00000587761 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SEH1L-204ENST00000587761 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.79■■□□□ 1.72
SEH1L-204ENST00000587761 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SEH1L-204ENST00000587761 FBLN2P98095 1184 aa25.72■■□□□ 1.71
SEH1L-204ENST00000587761 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
SEH1L-204ENST00000587761 SOGA1O94964 1423 aa25.67■■□□□ 1.7
SEH1L-204ENST00000587761 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.66■■□□□ 1.7
SEH1L-204ENST00000587761 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
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SEH1L-204ENST00000587761 WDR97A6NE52 1622 aa25.55■■□□□ 1.68
SEH1L-204ENST00000587761 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.53■■□□□ 1.68
SEH1L-204ENST00000587761 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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SEH1L-204ENST00000587761 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SEH1L-204ENST00000587761 CUX1P39880 1505 aa25.47■■□□□ 1.67
SEH1L-204ENST00000587761 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.45■■□□□ 1.66
SEH1L-204ENST00000587761 GRIN2BQ13224 1484 aa25.45■■□□□ 1.66
SEH1L-204ENST00000587761 SYNJ1O43426 1573 aa25.42■■□□□ 1.66
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SEH1L-204ENST00000587761 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.33■■□□□ 1.65
SEH1L-204ENST00000587761 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
SEH1L-204ENST00000587761 PBRM1Q86U86 1689 aa25.23■■□□□ 1.63
SEH1L-204ENST00000587761 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.19■■□□□ 1.62
SEH1L-204ENST00000587761 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
SEH1L-204ENST00000587761 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SEH1L-204ENST00000587761 GRIN2AQ12879 1464 aa25.1■■□□□ 1.61
SEH1L-204ENST00000587761 NUP160Q12769 1436 aa25.05■■□□□ 1.6
SEH1L-204ENST00000587761 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.02■■□□□ 1.6
SEH1L-204ENST00000587761 ADAMTS12P58397 1594 aa25.01■■□□□ 1.59
SEH1L-204ENST00000587761 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.01■■□□□ 1.59
SEH1L-204ENST00000587761 TOP2BQ02880 1626 aa25■■□□□ 1.59
SEH1L-204ENST00000587761 CEP170Q5SW79 1584 aa24.99■■□□□ 1.59
SEH1L-204ENST00000587761 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.97■■□□□ 1.59
SEH1L-204ENST00000587761 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.94■■□□□ 1.58
SEH1L-204ENST00000587761 SHROOM2Q13796 1616 aa24.93■■□□□ 1.58
SEH1L-204ENST00000587761 JPH4Q96JJ6 628 aa24.86■■□□□ 1.57
SEH1L-204ENST00000587761 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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