RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586852.5

PTPRH-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRH, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-204ENST00000586852 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.87■■■■□ 3.81
PTPRH-204ENST00000586852 ABCC9O60706 1549 aa34.88■■■■□ 3.17
PTPRH-204ENST00000586852 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.76■■■■□ 3.15
PTPRH-204ENST00000586852 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.17■■■□□ 2.9
PTPRH-204ENST00000586852 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.03■■■□□ 2.88
PTPRH-204ENST00000586852 NACADO15069 1562 aa32.96■■■□□ 2.87
PTPRH-204ENST00000586852 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.75■■■□□ 2.83
PTPRH-204ENST00000586852 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.57■■■□□ 2.8
PTPRH-204ENST00000586852 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.51■■■□□ 2.8
PTPRH-204ENST00000586852 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRH-204ENST00000586852 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PTPRH-204ENST00000586852 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.13■■■□□ 2.73
PTPRH-204ENST00000586852 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.1■■■□□ 2.73
PTPRH-204ENST00000586852 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.78■■■□□ 2.68
PTPRH-204ENST00000586852 SCRIBQ14160 1630 aa31.71■■■□□ 2.67
PTPRH-204ENST00000586852 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRH-204ENST00000586852 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRH-204ENST00000586852 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
PTPRH-204ENST00000586852 NCAPD3P42695 1498 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRH-204ENST00000586852 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRH-204ENST00000586852 SMARCA2P51531 1590 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPRH-204ENST00000586852 SMARCA4P51532 1647 aa30.25■■■□□ 2.43
PTPRH-204ENST00000586852 HMGXB3Q12766 1538 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRH-204ENST00000586852 ERCC6Q03468 1493 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRH-204ENST00000586852 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PTPRH-204ENST00000586852 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRH-204ENST00000586852 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PTPRH-204ENST00000586852 CUX2O14529 1486 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRH-204ENST00000586852 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRH-204ENST00000586852 NESP48681 1621 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRH-204ENST00000586852 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRH-204ENST00000586852 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.72■■■□□ 2.35
PTPRH-204ENST00000586852 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRH-204ENST00000586852 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRH-204ENST00000586852 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRH-204ENST00000586852 WIZO95785 1651 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRH-204ENST00000586852 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRH-204ENST00000586852 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PTPRH-204ENST00000586852 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRH-204ENST00000586852 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPRH-204ENST00000586852 CFTRP13569 1480 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRH-204ENST00000586852 WDR62O43379 1518 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRH-204ENST00000586852 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRH-204ENST00000586852 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PTPRH-204ENST00000586852 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRH-204ENST00000586852 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PTPRH-204ENST00000586852 OSCARQ8IYS5 282 aa28.84■■■□□ 2.21
PTPRH-204ENST00000586852 TRIM41Q8WV44 630 aa28.83■■■□□ 2.21
PTPRH-204ENST00000586852 PRDM2Q13029 1718 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRH-204ENST00000586852 IFT140Q96RY7 1462 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRH-204ENST00000586852 ABCC8Q09428 1581 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRH-204ENST00000586852 TOPBP1Q92547 1522 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRH-204ENST00000586852 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PTPRH-204ENST00000586852 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRH-204ENST00000586852 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.131e-6■■■■□ 20.4
PTPRH-204ENST00000586852 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-204ENST00000586852 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PTPRH-204ENST00000586852 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-204ENST00000586852 SOGA1O94964 1423 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-204ENST00000586852 FBLN2P98095 1184 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-204ENST00000586852 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRH-204ENST00000586852 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRH-204ENST00000586852 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PTPRH-204ENST00000586852 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRH-204ENST00000586852 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRH-204ENST00000586852 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRH-204ENST00000586852 ARHGEF11O15085 1522 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRH-204ENST00000586852 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRH-204ENST00000586852 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRH-204ENST00000586852 CUX1P39880 1505 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRH-204ENST00000586852 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PTPRH-204ENST00000586852 CHD1O14646 1710 aa28.07■■■□□ 2.08
PTPRH-204ENST00000586852 WDR97A6NE52 1622 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRH-204ENST00000586852 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRH-204ENST00000586852 GRIN2BQ13224 1484 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRH-204ENST00000586852 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PTPRH-204ENST00000586852 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.91■■■□□ 2.06
PTPRH-204ENST00000586852 ARAP1Q96P48 1450 aa27.91■■■□□ 2.06
PTPRH-204ENST00000586852 SYNJ2O15056 1496 aa27.9■■■□□ 2.06
PTPRH-204ENST00000586852 SYNJ1O43426 1573 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRH-204ENST00000586852 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PTPRH-204ENST00000586852 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRH-204ENST00000586852 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
PTPRH-204ENST00000586852 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRH-204ENST00000586852 PBRM1Q86U86 1689 aa27.72■■■□□ 2.03
PTPRH-204ENST00000586852 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRH-204ENST00000586852 TOP2BQ02880 1626 aa27.65■■■□□ 2.02
PTPRH-204ENST00000586852 GRIN2AQ12879 1464 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRH-204ENST00000586852 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRH-204ENST00000586852 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.58■■■□□ 2
PTPRH-204ENST00000586852 NUP160Q12769 1436 aa27.52■■■□□ 2
PTPRH-204ENST00000586852 ADAMTS12P58397 1594 aa27.52■■■□□ 2
PTPRH-204ENST00000586852 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRH-204ENST00000586852 CEP170Q5SW79 1584 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRH-204ENST00000586852 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.39■■□□□ 1.97
PTPRH-204ENST00000586852 JPH4Q96JJ6 628 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRH-204ENST00000586852 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PTPRH-204ENST00000586852 SHROOM2Q13796 1616 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRH-204ENST00000586852 KIF27Q86VH2 1401 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRH-204ENST00000586852 IGF1RP08069 1367 aa27.24■■□□□ 1.95
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