RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585730.5

SEH1L-203, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 2

Gene SEH1L, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-203ENST00000585730 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.95■■■■■ 4.63
SEH1L-203ENST00000585730 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.23■■■■□ 3.87
SEH1L-203ENST00000585730 ABCC9O60706 1549 aa39.08■■■■□ 3.85
SEH1L-203ENST00000585730 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.26■■■■□ 3.56
SEH1L-203ENST00000585730 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.21■■■■□ 3.55
SEH1L-203ENST00000585730 NACADO15069 1562 aa37.07■■■■□ 3.52
SEH1L-203ENST00000585730 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.6■■■■□ 3.45
SEH1L-203ENST00000585730 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.43
SEH1L-203ENST00000585730 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
SEH1L-203ENST00000585730 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.39■■■■□ 3.42
SEH1L-203ENST00000585730 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.36■■■■□ 3.41
SEH1L-203ENST00000585730 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.26■■■■□ 3.4
SEH1L-203ENST00000585730 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.12■■■■□ 3.37
SEH1L-203ENST00000585730 SCRIBQ14160 1630 aa35.87■■■■□ 3.33
SEH1L-203ENST00000585730 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.64■■■■□ 3.3
SEH1L-203ENST00000585730 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.25■■■■□ 3.23
SEH1L-203ENST00000585730 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
SEH1L-203ENST00000585730 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.15■■■■□ 3.22
SEH1L-203ENST00000585730 NCAPD3P42695 1498 aa34.23■■■■□ 3.07
SEH1L-203ENST00000585730 SMARCA4P51532 1647 aa34.2■■■■□ 3.07
SEH1L-203ENST00000585730 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.19■■■■□ 3.06
SEH1L-203ENST00000585730 SMARCA2P51531 1590 aa34.1■■■■□ 3.05
SEH1L-203ENST00000585730 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
SEH1L-203ENST00000585730 HMGXB3Q12766 1538 aa33.97■■■■□ 3.03
SEH1L-203ENST00000585730 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
SEH1L-203ENST00000585730 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.89■■■■□ 3.02
SEH1L-203ENST00000585730 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.81■■■■□ 3
SEH1L-203ENST00000585730 ERCC6Q03468 1493 aa33.73■■■□□ 2.99
SEH1L-203ENST00000585730 NESP48681 1621 aa33.64■■■□□ 2.98
SEH1L-203ENST00000585730 WIZO95785 1651 aa33.49■■■□□ 2.95
SEH1L-203ENST00000585730 CUX2O14529 1486 aa33.48■■■□□ 2.95
SEH1L-203ENST00000585730 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.4■■■□□ 2.94
SEH1L-203ENST00000585730 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
SEH1L-203ENST00000585730 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.26■■■□□ 2.91
SEH1L-203ENST00000585730 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.25■■■□□ 2.91
SEH1L-203ENST00000585730 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.18■■■□□ 2.9
SEH1L-203ENST00000585730 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.16■■■□□ 2.9
SEH1L-203ENST00000585730 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
SEH1L-203ENST00000585730 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
SEH1L-203ENST00000585730 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.93■■■□□ 2.86
SEH1L-203ENST00000585730 CFTRP13569 1480 aa32.89■■■□□ 2.86
SEH1L-203ENST00000585730 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.87■■■□□ 2.85
SEH1L-203ENST00000585730 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.86■■■□□ 2.85
SEH1L-203ENST00000585730 WDR62O43379 1518 aa32.78■■■□□ 2.84
SEH1L-203ENST00000585730 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.74■■■□□ 2.83
SEH1L-203ENST00000585730 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
SEH1L-203ENST00000585730 PRDM2Q13029 1718 aa32.51■■■□□ 2.8
SEH1L-203ENST00000585730 TOPBP1Q92547 1522 aa32.26■■■□□ 2.75
SEH1L-203ENST00000585730 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
SEH1L-203ENST00000585730 ABCC8Q09428 1581 aa32.22■■■□□ 2.75
SEH1L-203ENST00000585730 IFT140Q96RY7 1462 aa32.19■■■□□ 2.74
SEH1L-203ENST00000585730 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.15■■■□□ 2.74
SEH1L-203ENST00000585730 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
SEH1L-203ENST00000585730 OSCARQ8IYS5 282 aa32.12■■■□□ 2.73
SEH1L-203ENST00000585730 TRIM41Q8WV44 630 aa31.96■■■□□ 2.71
SEH1L-203ENST00000585730 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
SEH1L-203ENST00000585730 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
SEH1L-203ENST00000585730 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.7
SEH1L-203ENST00000585730 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
SEH1L-203ENST00000585730 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.87■■■□□ 2.69
SEH1L-203ENST00000585730 SOGA1O94964 1423 aa31.87■■■□□ 2.69
SEH1L-203ENST00000585730 CUX1P39880 1505 aa31.81■■■□□ 2.68
SEH1L-203ENST00000585730 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.81■■■□□ 2.68
SEH1L-203ENST00000585730 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
SEH1L-203ENST00000585730 FBLN2P98095 1184 aa31.75■■■□□ 2.67
SEH1L-203ENST00000585730 CHD1O14646 1710 aa31.62■■■□□ 2.65
SEH1L-203ENST00000585730 WDR97A6NE52 1622 aa31.57■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.56■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 GRIN2BQ13224 1484 aa31.52■■■□□ 2.64
SEH1L-203ENST00000585730 ARHGEF11O15085 1522 aa31.5■■■□□ 2.63
SEH1L-203ENST00000585730 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.46■■■□□ 2.63
SEH1L-203ENST00000585730 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
SEH1L-203ENST00000585730 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.44■■■□□ 2.62
SEH1L-203ENST00000585730 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.44■■■□□ 2.62
SEH1L-203ENST00000585730 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.38■■■□□ 2.61
SEH1L-203ENST00000585730 SYNJ2O15056 1496 aa31.37■■■□□ 2.61
SEH1L-203ENST00000585730 TOP2BQ02880 1626 aa31.37■■■□□ 2.61
SEH1L-203ENST00000585730 PBRM1Q86U86 1689 aa31.36■■■□□ 2.61
SEH1L-203ENST00000585730 SYNJ1O43426 1573 aa31.35■■■□□ 2.61
SEH1L-203ENST00000585730 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.34■■■□□ 2.61
SEH1L-203ENST00000585730 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.32■■■□□ 2.6
SEH1L-203ENST00000585730 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.24■■■□□ 2.59
SEH1L-203ENST00000585730 ARAP1Q96P48 1450 aa31.21■■■□□ 2.59
SEH1L-203ENST00000585730 GRIN2AQ12879 1464 aa31.1■■■□□ 2.57
SEH1L-203ENST00000585730 ADAMTS12P58397 1594 aa31.09■■■□□ 2.57
SEH1L-203ENST00000585730 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.07■■■□□ 2.56
SEH1L-203ENST00000585730 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.04■■■□□ 2.56
SEH1L-203ENST00000585730 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
SEH1L-203ENST00000585730 NUP160Q12769 1436 aa30.96■■■□□ 2.55
SEH1L-203ENST00000585730 CEP170Q5SW79 1584 aa30.96■■■□□ 2.55
SEH1L-203ENST00000585730 KIF27Q86VH2 1401 aa30.84■■■□□ 2.53
SEH1L-203ENST00000585730 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.83■■■□□ 2.53
SEH1L-203ENST00000585730 IGF1RP08069 1367 aa30.79■■■□□ 2.52
SEH1L-203ENST00000585730 JPH4Q96JJ6 628 aa30.75■■■□□ 2.51
SEH1L-203ENST00000585730 SHROOM2Q13796 1616 aa30.74■■■□□ 2.51
SEH1L-203ENST00000585730 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
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