RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585234.5

ANKRD12-209, Transcript of ankyrin repeat domain 12, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD12, Length 313 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD12-209ENST00000585234 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.49■■■■□ 3.43
ANKRD12-209ENST00000585234 ABCC9O60706 1549 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKRD12-209ENST00000585234 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.94■■■□□ 2.86
ANKRD12-209ENST00000585234 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD12-209ENST00000585234 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.71■■■□□ 2.67
ANKRD12-209ENST00000585234 NACADO15069 1562 aa31.34■■■□□ 2.61
ANKRD12-209ENST00000585234 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.23■■■□□ 2.59
ANKRD12-209ENST00000585234 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD12-209ENST00000585234 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.83■■■□□ 2.53
ANKRD12-209ENST00000585234 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.74■■■□□ 2.51
ANKRD12-209ENST00000585234 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.71■■■□□ 2.51
ANKRD12-209ENST00000585234 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
ANKRD12-209ENST00000585234 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.33■■■□□ 2.45
ANKRD12-209ENST00000585234 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.27■■■□□ 2.44
ANKRD12-209ENST00000585234 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.1■■■□□ 2.41
ANKRD12-209ENST00000585234 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ANKRD12-209ENST00000585234 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ANKRD12-209ENST00000585234 SCRIBQ14160 1630 aa30.01■■■□□ 2.39
ANKRD12-209ENST00000585234 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD12-209ENST00000585234 CUX2O14529 1486 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD12-209ENST00000585234 ERCC6Q03468 1493 aa29.1■■■□□ 2.25
ANKRD12-209ENST00000585234 NCAPD3P42695 1498 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD12-209ENST00000585234 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD12-209ENST00000585234 SMARCA2P51531 1590 aa28.68■■■□□ 2.18
ANKRD12-209ENST00000585234 NESP48681 1621 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD12-209ENST00000585234 HMGXB3Q12766 1538 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD12-209ENST00000585234 SMARCA4P51532 1647 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD12-209ENST00000585234 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ANKRD12-209ENST00000585234 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ANKRD12-209ENST00000585234 TRIM41Q8WV44 630 aa28.38■■■□□ 2.13
ANKRD12-209ENST00000585234 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ANKRD12-209ENST00000585234 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.37■■■□□ 2.13
ANKRD12-209ENST00000585234 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD12-209ENST00000585234 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD12-209ENST00000585234 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.2■■■□□ 2.11
ANKRD12-209ENST00000585234 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD12-209ENST00000585234 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.09■■■□□ 2.09
ANKRD12-209ENST00000585234 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.05■■■□□ 2.08
ANKRD12-209ENST00000585234 WDR62O43379 1518 aa27.96■■■□□ 2.07
ANKRD12-209ENST00000585234 OSCARQ8IYS5 282 aa27.86■■■□□ 2.05
ANKRD12-209ENST00000585234 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKRD12-209ENST00000585234 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD12-209ENST00000585234 WIZO95785 1651 aa27.7■■■□□ 2.02
ANKRD12-209ENST00000585234 CFTRP13569 1480 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD12-209ENST00000585234 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
ANKRD12-209ENST00000585234 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD12-209ENST00000585234 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD12-209ENST00000585234 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD12-209ENST00000585234 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
ANKRD12-209ENST00000585234 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD12-209ENST00000585234 ARHGEF11O15085 1522 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD12-209ENST00000585234 IFT140Q96RY7 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD12-209ENST00000585234 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD12-209ENST00000585234 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD12-209ENST00000585234 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ANKRD12-209ENST00000585234 PRDM2Q13029 1718 aa27.14■■□□□ 1.94
ANKRD12-209ENST00000585234 TOPBP1Q92547 1522 aa27.13■■□□□ 1.93
ANKRD12-209ENST00000585234 ABCC8Q09428 1581 aa27.09■■□□□ 1.93
ANKRD12-209ENST00000585234 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.06■■□□□ 1.92
ANKRD12-209ENST00000585234 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ANKRD12-209ENST00000585234 FBLN2P98095 1184 aa27.03■■□□□ 1.92
ANKRD12-209ENST00000585234 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
ANKRD12-209ENST00000585234 ARAP1Q96P48 1450 aa27■■□□□ 1.91
ANKRD12-209ENST00000585234 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.97■■□□□ 1.91
ANKRD12-209ENST00000585234 CHD1O14646 1710 aa26.93■■□□□ 1.9
ANKRD12-209ENST00000585234 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ANKRD12-209ENST00000585234 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ANKRD12-209ENST00000585234 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
ANKRD12-209ENST00000585234 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ANKRD12-209ENST00000585234 SOGA1O94964 1423 aa26.74■■□□□ 1.87
ANKRD12-209ENST00000585234 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.74■■□□□ 1.87
ANKRD12-209ENST00000585234 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ANKRD12-209ENST00000585234 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD12-209ENST00000585234 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
ANKRD12-209ENST00000585234 SYNJ1O43426 1573 aa26.64■■□□□ 1.86
ANKRD12-209ENST00000585234 WDR97A6NE52 1622 aa26.6■■□□□ 1.85
ANKRD12-209ENST00000585234 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ANKRD12-209ENST00000585234 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD12-209ENST00000585234 GRIN2BQ13224 1484 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD12-209ENST00000585234 SYNJ2O15056 1496 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD12-209ENST00000585234 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
ANKRD12-209ENST00000585234 CUX1P39880 1505 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD12-209ENST00000585234 PBRM1Q86U86 1689 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD12-209ENST00000585234 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD12-209ENST00000585234 GRIN2AQ12879 1464 aa26.19■■□□□ 1.78
ANKRD12-209ENST00000585234 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.19■■□□□ 1.78
ANKRD12-209ENST00000585234 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.19■■□□□ 1.78
ANKRD12-209ENST00000585234 CEP170Q5SW79 1584 aa26.14■■□□□ 1.78
ANKRD12-209ENST00000585234 NUP160Q12769 1436 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD12-209ENST00000585234 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
ANKRD12-209ENST00000585234 ADAMTS12P58397 1594 aa26.05■■□□□ 1.76
ANKRD12-209ENST00000585234 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.04■■□□□ 1.76
ANKRD12-209ENST00000585234 SHROOM2Q13796 1616 aa26.01■■□□□ 1.75
ANKRD12-209ENST00000585234 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ANKRD12-209ENST00000585234 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD12-209ENST00000585234 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
ANKRD12-209ENST00000585234 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD12-209ENST00000585234 JPH4Q96JJ6 628 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD12-209ENST00000585234 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD12-209ENST00000585234 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms