RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582131.1

HEXDC-210, Transcript of hexosaminidase D, humanhuman

TSL 5

Gene HEXDC, Length 942 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEXDC-210ENST00000582131 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.51■■■■■ 7.28
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HEXDC-210ENST00000582131 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.74■■■■■ 5.71
HEXDC-210ENST00000582131 NACADO15069 1562 aa50.67■■■■■ 5.7
HEXDC-210ENST00000582131 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.53■■■■■ 5.68
HEXDC-210ENST00000582131 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
HEXDC-210ENST00000582131 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.33■■■■■ 5.65
HEXDC-210ENST00000582131 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.07■■■■■ 5.61
HEXDC-210ENST00000582131 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.65■■■■■ 5.54
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HEXDC-210ENST00000582131 SCRIBQ14160 1630 aa49.13■■■■■ 5.46
HEXDC-210ENST00000582131 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.69■■■■■ 5.39
HEXDC-210ENST00000582131 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.49■■■■■ 5.35
HEXDC-210ENST00000582131 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
HEXDC-210ENST00000582131 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.75■■■■■ 5.23
HEXDC-210ENST00000582131 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.42■■■■■ 5.18
HEXDC-210ENST00000582131 SMARCA4P51532 1647 aa47■■■■■ 5.11
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HEXDC-210ENST00000582131 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.73■■■■■ 5.07
HEXDC-210ENST00000582131 SMARCA2P51531 1590 aa46.7■■■■■ 5.07
HEXDC-210ENST00000582131 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.62■■■■■ 5.05
HEXDC-210ENST00000582131 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.54■■■■■ 5.04
HEXDC-210ENST00000582131 HMGXB3Q12766 1538 aa46.51■■■■■ 5.04
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HEXDC-210ENST00000582131 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.54■■■■■ 4.88
HEXDC-210ENST00000582131 ERCC6Q03468 1493 aa45.49■■■■■ 4.87
HEXDC-210ENST00000582131 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.34■■■■■ 4.85
HEXDC-210ENST00000582131 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.2■■■■■ 4.83
HEXDC-210ENST00000582131 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.15■■■■■ 4.82
HEXDC-210ENST00000582131 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.08■■■■■ 4.81
HEXDC-210ENST00000582131 CFTRP13569 1480 aa45.07■■■■■ 4.81
HEXDC-210ENST00000582131 CUX2O14529 1486 aa45.06■■■■■ 4.8
HEXDC-210ENST00000582131 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
HEXDC-210ENST00000582131 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.84■■■■■ 4.77
HEXDC-210ENST00000582131 PRDM2Q13029 1718 aa44.82■■■■■ 4.77
HEXDC-210ENST00000582131 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.8■■■■■ 4.76
HEXDC-210ENST00000582131 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
HEXDC-210ENST00000582131 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.76■■■■■ 4.76
HEXDC-210ENST00000582131 WDR62O43379 1518 aa44.63■■■■■ 4.73
HEXDC-210ENST00000582131 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
HEXDC-210ENST00000582131 TOPBP1Q92547 1522 aa44.12■■■■■ 4.65
HEXDC-210ENST00000582131 ABCC8Q09428 1581 aa44.12■■■■■ 4.65
HEXDC-210ENST00000582131 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.08■■■■■ 4.65
HEXDC-210ENST00000582131 IFT140Q96RY7 1462 aa43.86■■■■■ 4.61
HEXDC-210ENST00000582131 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.76■■■■■ 4.6
HEXDC-210ENST00000582131 CUX1P39880 1505 aa43.75■■■■■ 4.59
HEXDC-210ENST00000582131 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
HEXDC-210ENST00000582131 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
HEXDC-210ENST00000582131 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
HEXDC-210ENST00000582131 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.62■■■■■ 4.57
HEXDC-210ENST00000582131 SOGA1O94964 1423 aa43.54■■■■■ 4.56
HEXDC-210ENST00000582131 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.53■■■■■ 4.56
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HEXDC-210ENST00000582131 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.42■■■■■ 4.54
HEXDC-210ENST00000582131 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.543e-6■□□□□ 10.3
HEXDC-210ENST00000582131 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.38■■■■■ 4.54
HEXDC-210ENST00000582131 TOP2BQ02880 1626 aa43.37■■■■■ 4.53
HEXDC-210ENST00000582131 SYNJ1O43426 1573 aa43.34■■■■■ 4.53
HEXDC-210ENST00000582131 WDR97A6NE52 1622 aa43.33■■■■■ 4.53
HEXDC-210ENST00000582131 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
HEXDC-210ENST00000582131 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.2■■■■■ 4.51
HEXDC-210ENST00000582131 OSCARQ8IYS5 282 aa43.14■■■■■ 4.5
HEXDC-210ENST00000582131 GRIN2BQ13224 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
HEXDC-210ENST00000582131 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.05■■■■■ 4.48
HEXDC-210ENST00000582131 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.05■■■■■ 4.48
HEXDC-210ENST00000582131 CHD1O14646 1710 aa43.02■■■■■ 4.48
HEXDC-210ENST00000582131 PBRM1Q86U86 1689 aa43.02■■■■■ 4.48
HEXDC-210ENST00000582131 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.01■■■■■ 4.48
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HEXDC-210ENST00000582131 FBLN2P98095 1184 aa42.88■■■■■ 4.45
HEXDC-210ENST00000582131 SYNJ2O15056 1496 aa42.79■■■■■ 4.44
HEXDC-210ENST00000582131 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
HEXDC-210ENST00000582131 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.68■■■■■ 4.42
HEXDC-210ENST00000582131 ADAMTS12P58397 1594 aa42.65■■■■■ 4.42
HEXDC-210ENST00000582131 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.54■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 KIF27Q86VH2 1401 aa42.53■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.52■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 GRIN2AQ12879 1464 aa42.51■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HEXDC-210ENST00000582131 ARHGEF11O15085 1522 aa42.47■■■■■ 4.39
HEXDC-210ENST00000582131 IGF1RP08069 1367 aa42.35■■■■■ 4.37
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HEXDC-210ENST00000582131 CEP170Q5SW79 1584 aa42.31■■■■■ 4.36
HEXDC-210ENST00000582131 TRIM41Q8WV44 630 aa42.3■■■■■ 4.36
HEXDC-210ENST00000582131 CUL7Q14999 1698 aa42.3■■■■■ 4.36
HEXDC-210ENST00000582131 ARAP1Q96P48 1450 aa42.12■■■■■ 4.33
HEXDC-210ENST00000582131 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.1■■■■■ 4.33
HEXDC-210ENST00000582131 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.1■■■■■ 4.33
HEXDC-210ENST00000582131 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.05■■■■■ 4.32
HEXDC-210ENST00000582131 SHROOM2Q13796 1616 aa42.05■■■■■ 4.32
HEXDC-210ENST00000582131 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.92■■■■■ 4.3
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