RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576922.5

CNTROB-215, Transcript of centrobin, centriole duplication and spindle assembly protein, humanhuman

TSL 5

Gene CNTROB, Length 1,468 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROB-215ENST00000576922 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.57■■■■□ 3.92
CNTROB-215ENST00000576922 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.17■■■■□ 3.22
CNTROB-215ENST00000576922 ABCC9O60706 1549 aa34.55■■■■□ 3.12
CNTROB-215ENST00000576922 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.24■■■□□ 2.91
CNTROB-215ENST00000576922 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.18■■■□□ 2.9
CNTROB-215ENST00000576922 NACADO15069 1562 aa33.11■■■□□ 2.89
CNTROB-215ENST00000576922 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CNTROB-215ENST00000576922 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.85■■■□□ 2.85
CNTROB-215ENST00000576922 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.7■■■□□ 2.83
CNTROB-215ENST00000576922 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.34■■■□□ 2.77
CNTROB-215ENST00000576922 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.3■■■□□ 2.76
CNTROB-215ENST00000576922 SCRIBQ14160 1630 aa32.13■■■□□ 2.73
CNTROB-215ENST00000576922 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.13■■■□□ 2.73
CNTROB-215ENST00000576922 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.79■■■□□ 2.68
CNTROB-215ENST00000576922 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.74■■■□□ 2.67
CNTROB-215ENST00000576922 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CNTROB-215ENST00000576922 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.21■■■□□ 2.59
CNTROB-215ENST00000576922 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.04■■■□□ 2.56
CNTROB-215ENST00000576922 SMARCA4P51532 1647 aa30.7■■■□□ 2.51
CNTROB-215ENST00000576922 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CNTROB-215ENST00000576922 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.57■■■□□ 2.48
CNTROB-215ENST00000576922 NCAPD3P42695 1498 aa30.55■■■□□ 2.48
CNTROB-215ENST00000576922 SMARCA2P51531 1590 aa30.53■■■□□ 2.48
CNTROB-215ENST00000576922 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.5■■■□□ 2.47
CNTROB-215ENST00000576922 HMGXB3Q12766 1538 aa30.39■■■□□ 2.46
CNTROB-215ENST00000576922 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.37■■■□□ 2.45
CNTROB-215ENST00000576922 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CNTROB-215ENST00000576922 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CNTROB-215ENST00000576922 WIZO95785 1651 aa30.16■■■□□ 2.42
CNTROB-215ENST00000576922 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CNTROB-215ENST00000576922 NESP48681 1621 aa29.86■■■□□ 2.37
CNTROB-215ENST00000576922 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CNTROB-215ENST00000576922 ERCC6Q03468 1493 aa29.81■■■□□ 2.36
CNTROB-215ENST00000576922 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.76■■■□□ 2.35
CNTROB-215ENST00000576922 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.69■■■□□ 2.34
CNTROB-215ENST00000576922 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.61■■■□□ 2.33
CNTROB-215ENST00000576922 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.53■■■□□ 2.32
CNTROB-215ENST00000576922 CFTRP13569 1480 aa29.48■■■□□ 2.31
CNTROB-215ENST00000576922 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.46■■■□□ 2.31
CNTROB-215ENST00000576922 CUX2O14529 1486 aa29.46■■■□□ 2.31
CNTROB-215ENST00000576922 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CNTROB-215ENST00000576922 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.35■■■□□ 2.29
CNTROB-215ENST00000576922 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.32■■■□□ 2.28
CNTROB-215ENST00000576922 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.28■■■□□ 2.28
CNTROB-215ENST00000576922 PRDM2Q13029 1718 aa29.19■■■□□ 2.26
CNTROB-215ENST00000576922 WDR62O43379 1518 aa29.15■■■□□ 2.26
CNTROB-215ENST00000576922 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CNTROB-215ENST00000576922 ABCC8Q09428 1581 aa28.87■■■□□ 2.21
CNTROB-215ENST00000576922 TOPBP1Q92547 1522 aa28.86■■■□□ 2.21
CNTROB-215ENST00000576922 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.81■■■□□ 2.2
CNTROB-215ENST00000576922 IFT140Q96RY7 1462 aa28.7■■■□□ 2.18
CNTROB-215ENST00000576922 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.65■■■□□ 2.18
CNTROB-215ENST00000576922 CUX1P39880 1505 aa28.61■■■□□ 2.17
CNTROB-215ENST00000576922 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CNTROB-215ENST00000576922 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
CNTROB-215ENST00000576922 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CNTROB-215ENST00000576922 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.54■■■□□ 2.16
CNTROB-215ENST00000576922 SOGA1O94964 1423 aa28.53■■■□□ 2.16
CNTROB-215ENST00000576922 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CNTROB-215ENST00000576922 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.51■■■□□ 2.15
CNTROB-215ENST00000576922 SYNJ1O43426 1573 aa28.45■■■□□ 2.15
CNTROB-215ENST00000576922 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CNTROB-215ENST00000576922 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.141e-9■■■■■ 35.5
CNTROB-215ENST00000576922 TOP2BQ02880 1626 aa28.42■■■□□ 2.14
CNTROB-215ENST00000576922 TRIM41Q8WV44 630 aa28.41■■■□□ 2.14
CNTROB-215ENST00000576922 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.4■■■□□ 2.14
CNTROB-215ENST00000576922 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.39■■■□□ 2.14
CNTROB-215ENST00000576922 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CNTROB-215ENST00000576922 OSCARQ8IYS5 282 aa28.29■■■□□ 2.12
CNTROB-215ENST00000576922 WDR97A6NE52 1622 aa28.29■■■□□ 2.12
CNTROB-215ENST00000576922 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.25■■■□□ 2.11
CNTROB-215ENST00000576922 GRIN2BQ13224 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
CNTROB-215ENST00000576922 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.18■■■□□ 2.1
CNTROB-215ENST00000576922 FBLN2P98095 1184 aa28.18■■■□□ 2.1
CNTROB-215ENST00000576922 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.15■■■□□ 2.1
CNTROB-215ENST00000576922 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.11■■■□□ 2.09
CNTROB-215ENST00000576922 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CNTROB-215ENST00000576922 PBRM1Q86U86 1689 aa28.08■■■□□ 2.09
CNTROB-215ENST00000576922 CHD1O14646 1710 aa28.08■■■□□ 2.09
CNTROB-215ENST00000576922 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CNTROB-215ENST00000576922 SYNJ2O15056 1496 aa28■■■□□ 2.07
CNTROB-215ENST00000576922 KIF27Q86VH2 1401 aa27.96■■■□□ 2.07
CNTROB-215ENST00000576922 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.91■■■□□ 2.06
CNTROB-215ENST00000576922 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.87■■■□□ 2.05
CNTROB-215ENST00000576922 ADAMTS12P58397 1594 aa27.86■■■□□ 2.05
CNTROB-215ENST00000576922 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CNTROB-215ENST00000576922 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.85■■■□□ 2.05
CNTROB-215ENST00000576922 GRIN2AQ12879 1464 aa27.81■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 EEA1Q15075 1411 aa27.8■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 ARHGEF11O15085 1522 aa27.78■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.78■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.77■■■□□ 2.04
CNTROB-215ENST00000576922 IGF1RP08069 1367 aa27.76■■■□□ 2.03
CNTROB-215ENST00000576922 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.73■■■□□ 2.03
CNTROB-215ENST00000576922 NUP160Q12769 1436 aa27.67■■■□□ 2.02
CNTROB-215ENST00000576922 CEP170Q5SW79 1584 aa27.65■■■□□ 2.02
CNTROB-215ENST00000576922 CUL7Q14999 1698 aa27.64■■■□□ 2.02
CNTROB-215ENST00000576922 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.63■■■□□ 2.01
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