RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565963.5

AMDHD2-211, Transcript of amidohydrolase domain containing 2, humanhuman

TSL 5

Gene AMDHD2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMDHD2-211ENST00000565963 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.02■■■■■ 5.76
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AMDHD2-211ENST00000565963 ABCC9O60706 1549 aa44.61■■■■■ 4.73
AMDHD2-211ENST00000565963 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.91■■■■■ 4.46
AMDHD2-211ENST00000565963 NACADO15069 1562 aa42.8■■■■■ 4.44
AMDHD2-211ENST00000565963 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.71■■■■■ 4.43
AMDHD2-211ENST00000565963 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.46■■■■■ 4.39
AMDHD2-211ENST00000565963 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
AMDHD2-211ENST00000565963 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.21■■■■■ 4.35
AMDHD2-211ENST00000565963 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.06■■■■■ 4.32
AMDHD2-211ENST00000565963 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.62■■■■■ 4.25
AMDHD2-211ENST00000565963 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.58■■■■■ 4.25
AMDHD2-211ENST00000565963 SCRIBQ14160 1630 aa41.49■■■■■ 4.23
AMDHD2-211ENST00000565963 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.12■■■■■ 4.17
AMDHD2-211ENST00000565963 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.03■■■■■ 4.16
AMDHD2-211ENST00000565963 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
AMDHD2-211ENST00000565963 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.41■■■■■ 4.06
AMDHD2-211ENST00000565963 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.1■■■■■ 4.01
AMDHD2-211ENST00000565963 SMARCA4P51532 1647 aa39.68■■■■□ 3.94
AMDHD2-211ENST00000565963 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
AMDHD2-211ENST00000565963 NCAPD3P42695 1498 aa39.43■■■■□ 3.9
AMDHD2-211ENST00000565963 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.43■■■■□ 3.9
AMDHD2-211ENST00000565963 SMARCA2P51531 1590 aa39.43■■■■□ 3.9
AMDHD2-211ENST00000565963 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.31■■■■□ 3.88
AMDHD2-211ENST00000565963 HMGXB3Q12766 1538 aa39.27■■■■□ 3.88
AMDHD2-211ENST00000565963 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.26■■■■□ 3.88
AMDHD2-211ENST00000565963 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
AMDHD2-211ENST00000565963 WIZO95785 1651 aa38.96■■■■□ 3.83
AMDHD2-211ENST00000565963 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
AMDHD2-211ENST00000565963 NESP48681 1621 aa38.56■■■■□ 3.76
AMDHD2-211ENST00000565963 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.51■■■■□ 3.76
AMDHD2-211ENST00000565963 ERCC6Q03468 1493 aa38.49■■■■□ 3.75
AMDHD2-211ENST00000565963 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
AMDHD2-211ENST00000565963 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.28■■■■□ 3.72
AMDHD2-211ENST00000565963 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.22■■■■□ 3.71
AMDHD2-211ENST00000565963 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.2■■■■□ 3.71
AMDHD2-211ENST00000565963 CUX2O14529 1486 aa38.15■■■■□ 3.7
AMDHD2-211ENST00000565963 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
AMDHD2-211ENST00000565963 CFTRP13569 1480 aa38.02■■■■□ 3.68
AMDHD2-211ENST00000565963 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.01■■■■□ 3.67
AMDHD2-211ENST00000565963 PRDM2Q13029 1718 aa37.94■■■■□ 3.66
AMDHD2-211ENST00000565963 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.86■■■■□ 3.65
AMDHD2-211ENST00000565963 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.85■■■■□ 3.65
AMDHD2-211ENST00000565963 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.81■■■■□ 3.64
AMDHD2-211ENST00000565963 WDR62O43379 1518 aa37.71■■■■□ 3.63
AMDHD2-211ENST00000565963 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
AMDHD2-211ENST00000565963 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
AMDHD2-211ENST00000565963 ABCC8Q09428 1581 aa37.27■■■■□ 3.56
AMDHD2-211ENST00000565963 TOPBP1Q92547 1522 aa37.25■■■■□ 3.55
AMDHD2-211ENST00000565963 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.21■■■■□ 3.55
AMDHD2-211ENST00000565963 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.12■■■■□ 3.53
AMDHD2-211ENST00000565963 IFT140Q96RY7 1462 aa37.05■■■■□ 3.52
AMDHD2-211ENST00000565963 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
AMDHD2-211ENST00000565963 CUX1P39880 1505 aa36.89■■■■□ 3.5
AMDHD2-211ENST00000565963 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
AMDHD2-211ENST00000565963 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
AMDHD2-211ENST00000565963 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.81■■■■□ 3.48
AMDHD2-211ENST00000565963 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
AMDHD2-211ENST00000565963 SOGA1O94964 1423 aa36.76■■■■□ 3.47
AMDHD2-211ENST00000565963 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.74■■■■□ 3.47
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AMDHD2-211ENST00000565963 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.62■■■■□ 3.45
AMDHD2-211ENST00000565963 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
AMDHD2-211ENST00000565963 TOP2BQ02880 1626 aa36.58■■■■□ 3.45
AMDHD2-211ENST00000565963 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
AMDHD2-211ENST00000565963 SYNJ1O43426 1573 aa36.53■■■■□ 3.44
AMDHD2-211ENST00000565963 OSCARQ8IYS5 282 aa36.53■■■■□ 3.44
AMDHD2-211ENST00000565963 CHD1O14646 1710 aa36.45■■■■□ 3.43
AMDHD2-211ENST00000565963 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.44■■■■□ 3.42
AMDHD2-211ENST00000565963 PBRM1Q86U86 1689 aa36.41■■■■□ 3.42
AMDHD2-211ENST00000565963 GRIN2BQ13224 1484 aa36.35■■■■□ 3.41
AMDHD2-211ENST00000565963 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.34■■■■□ 3.41
AMDHD2-211ENST00000565963 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.34■■■■□ 3.41
AMDHD2-211ENST00000565963 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.32■■■■□ 3.41
AMDHD2-211ENST00000565963 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
AMDHD2-211ENST00000565963 FBLN2P98095 1184 aa36.27■■■■□ 3.4
AMDHD2-211ENST00000565963 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
AMDHD2-211ENST00000565963 SYNJ2O15056 1496 aa36.13■■■■□ 3.37
AMDHD2-211ENST00000565963 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.03■■■■□ 3.36
AMDHD2-211ENST00000565963 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
AMDHD2-211ENST00000565963 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
AMDHD2-211ENST00000565963 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.02■■■■□ 3.36
AMDHD2-211ENST00000565963 ADAMTS12P58397 1594 aa36■■■■□ 3.35
AMDHD2-211ENST00000565963 ARHGEF11O15085 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
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AMDHD2-211ENST00000565963 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.91■■■■□ 3.34
AMDHD2-211ENST00000565963 GRIN2AQ12879 1464 aa35.88■■■■□ 3.33
AMDHD2-211ENST00000565963 TRIM41Q8WV44 630 aa35.86■■■■□ 3.33
AMDHD2-211ENST00000565963 KIF27Q86VH2 1401 aa35.84■■■■□ 3.33
AMDHD2-211ENST00000565963 CEP170Q5SW79 1584 aa35.73■■■■□ 3.31
AMDHD2-211ENST00000565963 CUL7Q14999 1698 aa35.72■■■■□ 3.31
AMDHD2-211ENST00000565963 NUP160Q12769 1436 aa35.71■■■■□ 3.31
AMDHD2-211ENST00000565963 IGF1RP08069 1367 aa35.67■■■■□ 3.3
AMDHD2-211ENST00000565963 ARAP1Q96P48 1450 aa35.61■■■■□ 3.29
AMDHD2-211ENST00000565963 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.59■■■■□ 3.29
AMDHD2-211ENST00000565963 SHROOM2Q13796 1616 aa35.53■■■■□ 3.28
AMDHD2-211ENST00000565963 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.5■■■■□ 3.27
AMDHD2-211ENST00000565963 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.47■■■■□ 3.27
AMDHD2-211ENST00000565963 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.41■■■■□ 3.26
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