RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.66■■■■■ 5.7
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ADAMTS17-205ENST00000558960 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.45■■■■■ 4.39
ADAMTS17-205ENST00000558960 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.39■■■■■ 4.38
ADAMTS17-205ENST00000558960 NACADO15069 1562 aa42.35■■■■■ 4.37
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.13■■■■■ 4.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.95■■■■■ 4.31
ADAMTS17-205ENST00000558960 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.25■■■■■ 4.19
ADAMTS17-205ENST00000558960 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCRIBQ14160 1630 aa41.01■■■■■ 4.16
ADAMTS17-205ENST00000558960 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.98■■■■■ 4.15
ADAMTS17-205ENST00000558960 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
ADAMTS17-205ENST00000558960 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.32■■■■■ 4.05
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ADAMTS17-205ENST00000558960 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.77■■■■□ 3.96
ADAMTS17-205ENST00000558960 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.56■■■■□ 3.92
ADAMTS17-205ENST00000558960 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
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ADAMTS17-205ENST00000558960 NCAPD3P42695 1498 aa39.09■■■■□ 3.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.08■■■■□ 3.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SMARCA2P51531 1590 aa39.08■■■■□ 3.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.99■■■■□ 3.83
ADAMTS17-205ENST00000558960 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.9■■■■□ 3.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 HMGXB3Q12766 1538 aa38.85■■■■□ 3.81
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ADAMTS17-205ENST00000558960 WIZO95785 1651 aa38.55■■■■□ 3.76
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ADAMTS17-205ENST00000558960 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.03■■■■□ 3.68
ADAMTS17-205ENST00000558960 NESP48681 1621 aa38.03■■■■□ 3.68
ADAMTS17-205ENST00000558960 ERCC6Q03468 1493 aa37.98■■■■□ 3.67
ADAMTS17-205ENST00000558960 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.97■■■■□ 3.67
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.86■■■■□ 3.65
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.77■■■■□ 3.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 CFTRP13569 1480 aa37.71■■■■□ 3.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CUX2O14529 1486 aa37.56■■■■□ 3.6
ADAMTS17-205ENST00000558960 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.56■■■■□ 3.6
ADAMTS17-205ENST00000558960 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.49■■■■□ 3.59
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.45■■■■□ 3.59
ADAMTS17-205ENST00000558960 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
ADAMTS17-205ENST00000558960 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.38■■■■□ 3.57
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRDM2Q13029 1718 aa37.34■■■■□ 3.57
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR62O43379 1518 aa37.2■■■■□ 3.55
ADAMTS17-205ENST00000558960 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
ADAMTS17-205ENST00000558960 ABCC8Q09428 1581 aa37■■■■□ 3.51
ADAMTS17-205ENST00000558960 TOPBP1Q92547 1522 aa36.88■■■■□ 3.49
ADAMTS17-205ENST00000558960 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.84■■■■□ 3.49
ADAMTS17-205ENST00000558960 IFT140Q96RY7 1462 aa36.69■■■■□ 3.46
ADAMTS17-205ENST00000558960 CUX1P39880 1505 aa36.57■■■■□ 3.44
ADAMTS17-205ENST00000558960 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
ADAMTS17-205ENST00000558960 SOGA1O94964 1423 aa36.5■■■■□ 3.43
ADAMTS17-205ENST00000558960 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
ADAMTS17-205ENST00000558960 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
ADAMTS17-205ENST00000558960 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
ADAMTS17-205ENST00000558960 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.39■■■■□ 3.42
ADAMTS17-205ENST00000558960 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.39■■■■□ 3.42
ADAMTS17-205ENST00000558960 TOP2BQ02880 1626 aa36.3■■■■□ 3.4
ADAMTS17-205ENST00000558960 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.28■■■■□ 3.4
ADAMTS17-205ENST00000558960 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
ADAMTS17-205ENST00000558960 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
ADAMTS17-205ENST00000558960 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ADAMTS17-205ENST00000558960 SYNJ1O43426 1573 aa36.23■■■■□ 3.39
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR97A6NE52 1622 aa36.23■■■■□ 3.39
ADAMTS17-205ENST00000558960 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.16■■■■□ 3.38
ADAMTS17-205ENST00000558960 OSCARQ8IYS5 282 aa36.11■■■■□ 3.37
ADAMTS17-205ENST00000558960 GRIN2BQ13224 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
ADAMTS17-205ENST00000558960 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.05■■■■□ 3.36
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBLN2P98095 1184 aa35.95■■■■□ 3.35
ADAMTS17-205ENST00000558960 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.94■■■■□ 3.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.92■■■■□ 3.34
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 PBRM1Q86U86 1689 aa35.86■■■■□ 3.33
ADAMTS17-205ENST00000558960 SYNJ2O15056 1496 aa35.79■■■■□ 3.32
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHD1O14646 1710 aa35.78■■■■□ 3.32
ADAMTS17-205ENST00000558960 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.74■■■■□ 3.31
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRIM41Q8WV44 630 aa35.73■■■■□ 3.31
ADAMTS17-205ENST00000558960 KIF27Q86VH2 1401 aa35.73■■■■□ 3.31
ADAMTS17-205ENST00000558960 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.66■■■■□ 3.3
ADAMTS17-205ENST00000558960 ADAMTS12P58397 1594 aa35.59■■■■□ 3.29
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ADAMTS17-205ENST00000558960 GRIN2AQ12879 1464 aa35.54■■■■□ 3.28
ADAMTS17-205ENST00000558960 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.42■■■■□ 3.26
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ADAMTS17-205ENST00000558960 NUP160Q12769 1436 aa35.38■■■■□ 3.25
ADAMTS17-205ENST00000558960 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.37■■■■□ 3.25
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
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ADAMTS17-205ENST00000558960 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
ADAMTS17-205ENST00000558960 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.34■■■■□ 3.25
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP170Q5SW79 1584 aa35.3■■■■□ 3.24
ADAMTS17-205ENST00000558960 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.28■■■■□ 3.24
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.25■■■■□ 3.23
ADAMTS17-205ENST00000558960 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.15■■■■□ 3.22
ADAMTS17-205ENST00000558960 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.14■■■■□ 3.22
ADAMTS17-205ENST00000558960 JPH4Q96JJ6 628 aa35.13■■■■□ 3.21
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