RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558930.1

ADAMTS17-204, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 4

Gene ADAMTS17, Length 220 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-204ENST00000558930 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.88■■■■■ 6.38
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ADAMTS17-204ENST00000558930 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.55■■■■■ 5.52
ADAMTS17-204ENST00000558930 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.41■■■■■ 5.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.31■■■■■ 5.16
ADAMTS17-204ENST00000558930 NACADO15069 1562 aa46.97■■■■■ 5.11
ADAMTS17-204ENST00000558930 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.34■■■■■ 5.01
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ADAMTS17-204ENST00000558930 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.23■■■■■ 4.99
ADAMTS17-204ENST00000558930 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.01■■■■■ 4.96
ADAMTS17-204ENST00000558930 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.5■■■■■ 4.87
ADAMTS17-204ENST00000558930 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.41■■■■■ 4.86
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ADAMTS17-204ENST00000558930 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.13■■■■■ 4.82
ADAMTS17-204ENST00000558930 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
ADAMTS17-204ENST00000558930 SCRIBQ14160 1630 aa44.97■■■■■ 4.79
ADAMTS17-204ENST00000558930 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
ADAMTS17-204ENST00000558930 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.94■■■■■ 4.62
ADAMTS17-204ENST00000558930 CUX2O14529 1486 aa43.4■■■■■ 4.54
ADAMTS17-204ENST00000558930 NCAPD3P42695 1498 aa43.37■■■■■ 4.53
ADAMTS17-204ENST00000558930 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.5
ADAMTS17-204ENST00000558930 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.11■■■■■ 4.49
ADAMTS17-204ENST00000558930 HMGXB3Q12766 1538 aa43.01■■■■■ 4.48
ADAMTS17-204ENST00000558930 SMARCA2P51531 1590 aa42.99■■■■■ 4.47
ADAMTS17-204ENST00000558930 SMARCA4P51532 1647 aa42.92■■■■■ 4.46
ADAMTS17-204ENST00000558930 NESP48681 1621 aa42.73■■■■■ 4.43
ADAMTS17-204ENST00000558930 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
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ADAMTS17-204ENST00000558930 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.6■■■■■ 4.41
ADAMTS17-204ENST00000558930 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
ADAMTS17-204ENST00000558930 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
ADAMTS17-204ENST00000558930 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.23■■■■■ 4.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.22■■■■■ 4.35
ADAMTS17-204ENST00000558930 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.19■■■■■ 4.34
ADAMTS17-204ENST00000558930 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.98■■■■■ 4.31
ADAMTS17-204ENST00000558930 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.88■■■■■ 4.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 WDR62O43379 1518 aa41.82■■■■■ 4.29
ADAMTS17-204ENST00000558930 WIZO95785 1651 aa41.67■■■■■ 4.26
ADAMTS17-204ENST00000558930 TRIM41Q8WV44 630 aa41.64■■■■■ 4.26
ADAMTS17-204ENST00000558930 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.6■■■■■ 4.25
ADAMTS17-204ENST00000558930 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.48■■■■■ 4.23
ADAMTS17-204ENST00000558930 CFTRP13569 1480 aa41.41■■■■■ 4.22
ADAMTS17-204ENST00000558930 OSCARQ8IYS5 282 aa41.24■■■■■ 4.19
ADAMTS17-204ENST00000558930 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
ADAMTS17-204ENST00000558930 PRDM2Q13029 1718 aa40.93■■■■■ 4.14
ADAMTS17-204ENST00000558930 IFT140Q96RY7 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
ADAMTS17-204ENST00000558930 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.77■■■■■ 4.12
ADAMTS17-204ENST00000558930 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.77■■■■■ 4.12
ADAMTS17-204ENST00000558930 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.77■■■■■ 4.12
ADAMTS17-204ENST00000558930 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
ADAMTS17-204ENST00000558930 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.68■■■■■ 4.1
ADAMTS17-204ENST00000558930 TOPBP1Q92547 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
ADAMTS17-204ENST00000558930 ARHGEF11O15085 1522 aa40.61■■■■■ 4.09
ADAMTS17-204ENST00000558930 ABCC8Q09428 1581 aa40.59■■■■■ 4.09
ADAMTS17-204ENST00000558930 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
ADAMTS17-204ENST00000558930 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.46■■■■■ 4.07
ADAMTS17-204ENST00000558930 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
ADAMTS17-204ENST00000558930 CHD1O14646 1710 aa40.28■■■■■ 4.04
ADAMTS17-204ENST00000558930 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
ADAMTS17-204ENST00000558930 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.25■■■■■ 4.03
ADAMTS17-204ENST00000558930 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.03
ADAMTS17-204ENST00000558930 ARAP1Q96P48 1450 aa40.16■■■■■ 4.02
ADAMTS17-204ENST00000558930 FBLN2P98095 1184 aa40.04■■■■■ 4
ADAMTS17-204ENST00000558930 WDR97A6NE52 1622 aa40■■■■□ 3.99
ADAMTS17-204ENST00000558930 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.99■■■■□ 3.99
ADAMTS17-204ENST00000558930 SOGA1O94964 1423 aa39.98■■■■□ 3.99
ADAMTS17-204ENST00000558930 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
ADAMTS17-204ENST00000558930 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
ADAMTS17-204ENST00000558930 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.88■■■■□ 3.97
ADAMTS17-204ENST00000558930 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.88■■■■□ 3.97
ADAMTS17-204ENST00000558930 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.84■■■■□ 3.97
ADAMTS17-204ENST00000558930 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
ADAMTS17-204ENST00000558930 SYNJ1O43426 1573 aa39.8■■■■□ 3.96
ADAMTS17-204ENST00000558930 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
ADAMTS17-204ENST00000558930 GRIN2BQ13224 1484 aa39.74■■■■□ 3.95
ADAMTS17-204ENST00000558930 CUX1P39880 1505 aa39.71■■■■□ 3.95
ADAMTS17-204ENST00000558930 SYNJ2O15056 1496 aa39.68■■■■□ 3.94
ADAMTS17-204ENST00000558930 PBRM1Q86U86 1689 aa39.5■■■■□ 3.91
ADAMTS17-204ENST00000558930 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
ADAMTS17-204ENST00000558930 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.41■■■■□ 3.9
ADAMTS17-204ENST00000558930 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
ADAMTS17-204ENST00000558930 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
ADAMTS17-204ENST00000558930 GRIN2AQ12879 1464 aa39.22■■■■□ 3.87
ADAMTS17-204ENST00000558930 NUP160Q12769 1436 aa39.14■■■■□ 3.86
ADAMTS17-204ENST00000558930 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.13■■■■□ 3.85
ADAMTS17-204ENST00000558930 ADAMTS12P58397 1594 aa39.12■■■■□ 3.85
ADAMTS17-204ENST00000558930 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.12■■■■□ 3.85
ADAMTS17-204ENST00000558930 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
ADAMTS17-204ENST00000558930 SHROOM2Q13796 1616 aa39.03■■■■□ 3.84
ADAMTS17-204ENST00000558930 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39■■■■□ 3.83
ADAMTS17-204ENST00000558930 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.98■■■■□ 3.83
ADAMTS17-204ENST00000558930 TOP2BQ02880 1626 aa38.97■■■■□ 3.83
ADAMTS17-204ENST00000558930 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.93■■■■□ 3.82
ADAMTS17-204ENST00000558930 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
ADAMTS17-204ENST00000558930 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.75■■■■□ 3.79
ADAMTS17-204ENST00000558930 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
ADAMTS17-204ENST00000558930 JPH4Q96JJ6 628 aa38.66■■■■□ 3.78
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