RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558062.5

CERS2-210, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CERS2, Length 896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-210ENST00000558062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.29■■■■□ 3.88
CERS2-210ENST00000558062 ABCC9O60706 1549 aa35.37■■■■□ 3.25
CERS2-210ENST00000558062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.1■■■■□ 3.21
CERS2-210ENST00000558062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.6■■■□□ 2.97
CERS2-210ENST00000558062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.48■■■□□ 2.95
CERS2-210ENST00000558062 NACADO15069 1562 aa33.38■■■□□ 2.93
CERS2-210ENST00000558062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.28■■■□□ 2.92
CERS2-210ENST00000558062 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.88
CERS2-210ENST00000558062 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.93■■■□□ 2.86
CERS2-210ENST00000558062 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
CERS2-210ENST00000558062 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.49■■■□□ 2.79
CERS2-210ENST00000558062 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.46■■■□□ 2.79
CERS2-210ENST00000558062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.42■■■□□ 2.78
CERS2-210ENST00000558062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.24■■■□□ 2.75
CERS2-210ENST00000558062 SCRIBQ14160 1630 aa32.04■■■□□ 2.72
CERS2-210ENST00000558062 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.91■■■□□ 2.7
CERS2-210ENST00000558062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.82■■■□□ 2.69
CERS2-210ENST00000558062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CERS2-210ENST00000558062 NCAPD3P42695 1498 aa30.9■■■□□ 2.54
CERS2-210ENST00000558062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.76■■■□□ 2.51
CERS2-210ENST00000558062 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.72■■■□□ 2.51
CERS2-210ENST00000558062 SMARCA2P51531 1590 aa30.64■■■□□ 2.5
CERS2-210ENST00000558062 ERCC6Q03468 1493 aa30.63■■■□□ 2.49
CERS2-210ENST00000558062 SMARCA4P51532 1647 aa30.55■■■□□ 2.48
CERS2-210ENST00000558062 CUX2O14529 1486 aa30.55■■■□□ 2.48
CERS2-210ENST00000558062 HMGXB3Q12766 1538 aa30.54■■■□□ 2.48
CERS2-210ENST00000558062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CERS2-210ENST00000558062 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CERS2-210ENST00000558062 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
CERS2-210ENST00000558062 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.28■■■□□ 2.44
CERS2-210ENST00000558062 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.23■■■□□ 2.43
CERS2-210ENST00000558062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.12■■■□□ 2.41
CERS2-210ENST00000558062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.09■■■□□ 2.41
CERS2-210ENST00000558062 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS2-210ENST00000558062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CERS2-210ENST00000558062 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.74■■■□□ 2.35
CERS2-210ENST00000558062 WIZO95785 1651 aa29.74■■■□□ 2.35
CERS2-210ENST00000558062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CERS2-210ENST00000558062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.69■■■□□ 2.34
CERS2-210ENST00000558062 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.61■■■□□ 2.33
CERS2-210ENST00000558062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.59■■■□□ 2.33
CERS2-210ENST00000558062 WDR62O43379 1518 aa29.59■■■□□ 2.33
CERS2-210ENST00000558062 CFTRP13569 1480 aa29.57■■■□□ 2.32
CERS2-210ENST00000558062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CERS2-210ENST00000558062 TRIM41Q8WV44 630 aa29.37■■■□□ 2.29
CERS2-210ENST00000558062 OSCARQ8IYS5 282 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS2-210ENST00000558062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CERS2-210ENST00000558062 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.23■■■□□ 2.27
CERS2-210ENST00000558062 IFT140Q96RY7 1462 aa29.07■■■□□ 2.24
CERS2-210ENST00000558062 ABCC8Q09428 1581 aa29.03■■■□□ 2.24
CERS2-210ENST00000558062 TOPBP1Q92547 1522 aa28.97■■■□□ 2.23
CERS2-210ENST00000558062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CERS2-210ENST00000558062 PRDM2Q13029 1718 aa28.85■■■□□ 2.21
CERS2-210ENST00000558062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.82■■■□□ 2.2
CERS2-210ENST00000558062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.196e-9■■■■□ 25.2
CERS2-210ENST00000558062 FBLN2P98095 1184 aa28.73■■■□□ 2.19
CERS2-210ENST00000558062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CERS2-210ENST00000558062 SOGA1O94964 1423 aa28.67■■■□□ 2.18
CERS2-210ENST00000558062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CERS2-210ENST00000558062 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.62■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 ARHGEF11O15085 1522 aa28.61■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.59■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.58■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.58■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.58■■■□□ 2.17
CERS2-210ENST00000558062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CERS2-210ENST00000558062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.49■■■□□ 2.15
CERS2-210ENST00000558062 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CERS2-210ENST00000558062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS2-210ENST00000558062 CUX1P39880 1505 aa28.39■■■□□ 2.14
CERS2-210ENST00000558062 GRIN2BQ13224 1484 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS2-210ENST00000558062 WDR97A6NE52 1622 aa28.38■■■□□ 2.13
CERS2-210ENST00000558062 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CERS2-210ENST00000558062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CERS2-210ENST00000558062 ARAP1Q96P48 1450 aa28.32■■■□□ 2.12
CERS2-210ENST00000558062 CHD1O14646 1710 aa28.32■■■□□ 2.12
CERS2-210ENST00000558062 SYNJ2O15056 1496 aa28.27■■■□□ 2.12
CERS2-210ENST00000558062 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.26■■■□□ 2.11
CERS2-210ENST00000558062 SYNJ1O43426 1573 aa28.23■■■□□ 2.11
CERS2-210ENST00000558062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.18■■■□□ 2.1
CERS2-210ENST00000558062 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
CERS2-210ENST00000558062 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.17■■■□□ 2.1
CERS2-210ENST00000558062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.98■■■□□ 2.07
CERS2-210ENST00000558062 GRIN2AQ12879 1464 aa27.96■■■□□ 2.07
CERS2-210ENST00000558062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.94■■■□□ 2.06
CERS2-210ENST00000558062 PBRM1Q86U86 1689 aa27.92■■■□□ 2.06
CERS2-210ENST00000558062 TOP2BQ02880 1626 aa27.9■■■□□ 2.06
CERS2-210ENST00000558062 NUP160Q12769 1436 aa27.89■■■□□ 2.06
CERS2-210ENST00000558062 ADAMTS12P58397 1594 aa27.82■■■□□ 2.04
CERS2-210ENST00000558062 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.81■■■□□ 2.04
CERS2-210ENST00000558062 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.81■■■□□ 2.04
CERS2-210ENST00000558062 JPH4Q96JJ6 628 aa27.77■■■□□ 2.04
CERS2-210ENST00000558062 CEP170Q5SW79 1584 aa27.74■■■□□ 2.03
CERS2-210ENST00000558062 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CERS2-210ENST00000558062 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS2-210ENST00000558062 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
CERS2-210ENST00000558062 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CERS2-210ENST00000558062 SHROOM2Q13796 1616 aa27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms