RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.59■□□□□ 0.73
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.23■□□□□ 0.19
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.71■□□□□ 0.1
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMARCA2P51531 1590 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.91□□□□□ -0.02
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HMGXB3Q12766 1538 aa14.85□□□□□ -0.03
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CUX2O14529 1486 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NESP48681 1621 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.45□□□□□ -0.1
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR62O43379 1518 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ABCC8Q09428 1581 aa14.22□□□□□ -0.13
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SYNJ1O43426 1573 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CUX1P39880 1505 aa14.12□□□□□ -0.15
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.11□□□□□ -0.15
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TOPBP1Q92547 1522 aa14.08□□□□□ -0.16
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IFT140Q96RY7 1462 aa14.03□□□□□ -0.16
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.02□□□□□ -0.16
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SOGA1O94964 1423 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EEA1Q15075 1411 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OSCARQ8IYS5 282 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIF27Q86VH2 1401 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CHD1O14646 1710 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR97A6NE52 1622 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.86□□□□□ -0.19
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.86□□□□□ -0.19
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.84□□□□□ -0.19
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.83□□□□□ -0.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGF1RP08069 1367 aa13.78□□□□□ -0.2
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ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PBRM1Q86U86 1689 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GRIN2BQ13224 1484 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBLN2P98095 1184 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIF21BO75037 1637 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CUL7Q14999 1698 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRXQ9BXM0 1461 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.7□□□□□ -0.22
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GOLGA3Q08378 1498 aa13.69□□□□□ -0.22
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.68□□□□□ -0.22
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