RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552947.1

ATG101-206, Transcript of autophagy related 101, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG101, Length 1,312 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101-206ENST00000552947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.59■■■■■ 4.25
ATG101-206ENST00000552947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.71■■■■□ 3.47
ATG101-206ENST00000552947 ABCC9O60706 1549 aa36.16■■■■□ 3.38
ATG101-206ENST00000552947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
ATG101-206ENST00000552947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.56■■■■□ 3.12
ATG101-206ENST00000552947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.43■■■■□ 3.1
ATG101-206ENST00000552947 NACADO15069 1562 aa34.4■■■■□ 3.1
ATG101-206ENST00000552947 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.38■■■■□ 3.09
ATG101-206ENST00000552947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.32■■■■□ 3.09
ATG101-206ENST00000552947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.31■■■■□ 3.08
ATG101-206ENST00000552947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.59■■■□□ 2.97
ATG101-206ENST00000552947 SCRIBQ14160 1630 aa33.58■■■□□ 2.97
ATG101-206ENST00000552947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.45■■■□□ 2.95
ATG101-206ENST00000552947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.25■■■□□ 2.91
ATG101-206ENST00000552947 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.22■■■□□ 2.91
ATG101-206ENST00000552947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.63■■■□□ 2.81
ATG101-206ENST00000552947 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.63■■■□□ 2.81
ATG101-206ENST00000552947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
ATG101-206ENST00000552947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ATG101-206ENST00000552947 SMARCA4P51532 1647 aa32.16■■■□□ 2.74
ATG101-206ENST00000552947 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.08■■■□□ 2.73
ATG101-206ENST00000552947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
ATG101-206ENST00000552947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.88■■■□□ 2.69
ATG101-206ENST00000552947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.85■■■□□ 2.69
ATG101-206ENST00000552947 SMARCA2P51531 1590 aa31.84■■■□□ 2.69
ATG101-206ENST00000552947 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.81■■■□□ 2.68
ATG101-206ENST00000552947 NCAPD3P42695 1498 aa31.74■■■□□ 2.67
ATG101-206ENST00000552947 WIZO95785 1651 aa31.73■■■□□ 2.67
ATG101-206ENST00000552947 HMGXB3Q12766 1538 aa31.64■■■□□ 2.66
ATG101-206ENST00000552947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
ATG101-206ENST00000552947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
ATG101-206ENST00000552947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
ATG101-206ENST00000552947 CUX2O14529 1486 aa31.36■■■□□ 2.61
ATG101-206ENST00000552947 ERCC6Q03468 1493 aa31.28■■■□□ 2.6
ATG101-206ENST00000552947 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.08■■■□□ 2.57
ATG101-206ENST00000552947 NESP48681 1621 aa30.92■■■□□ 2.54
ATG101-206ENST00000552947 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.86■■■□□ 2.53
ATG101-206ENST00000552947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.81■■■□□ 2.52
ATG101-206ENST00000552947 CFTRP13569 1480 aa30.78■■■□□ 2.52
ATG101-206ENST00000552947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
ATG101-206ENST00000552947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.61■■■□□ 2.49
ATG101-206ENST00000552947 PRDM2Q13029 1718 aa30.53■■■□□ 2.48
ATG101-206ENST00000552947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.51■■■□□ 2.47
ATG101-206ENST00000552947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.5■■■□□ 2.47
ATG101-206ENST00000552947 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.43■■■□□ 2.46
ATG101-206ENST00000552947 TRIM41Q8WV44 630 aa30.32■■■□□ 2.44
ATG101-206ENST00000552947 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.27■■■□□ 2.44
ATG101-206ENST00000552947 WDR62O43379 1518 aa30.19■■■□□ 2.42
ATG101-206ENST00000552947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ATG101-206ENST00000552947 ABCC8Q09428 1581 aa30.12■■■□□ 2.41
ATG101-206ENST00000552947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
ATG101-206ENST00000552947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.09■■■□□ 2.41
ATG101-206ENST00000552947 TOPBP1Q92547 1522 aa30.08■■■□□ 2.41
ATG101-206ENST00000552947 CUX1P39880 1505 aa30.06■■■□□ 2.4
ATG101-206ENST00000552947 SYNJ1O43426 1573 aa29.97■■■□□ 2.39
ATG101-206ENST00000552947 TOP2BQ02880 1626 aa29.94■■■□□ 2.38
ATG101-206ENST00000552947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.92■■■□□ 2.38
ATG101-206ENST00000552947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.89■■■□□ 2.37
ATG101-206ENST00000552947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ATG101-206ENST00000552947 OSCARQ8IYS5 282 aa29.83■■■□□ 2.37
ATG101-206ENST00000552947 IFT140Q96RY7 1462 aa29.77■■■□□ 2.36
ATG101-206ENST00000552947 SOGA1O94964 1423 aa29.76■■■□□ 2.35
ATG101-206ENST00000552947 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.75■■■□□ 2.35
ATG101-206ENST00000552947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.74■■■□□ 2.35
ATG101-206ENST00000552947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
ATG101-206ENST00000552947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.61■■■□□ 2.33
ATG101-206ENST00000552947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ATG101-206ENST00000552947 WDR97A6NE52 1622 aa29.57■■■□□ 2.32
ATG101-206ENST00000552947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
ATG101-206ENST00000552947 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.51■■■□□ 2.32
ATG101-206ENST00000552947 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.51■■■□□ 2.32
ATG101-206ENST00000552947 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.51■■■□□ 2.32
ATG101-206ENST00000552947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
ATG101-206ENST00000552947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ATG101-206ENST00000552947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.43■■■□□ 2.3
ATG101-206ENST00000552947 KIF27Q86VH2 1401 aa29.43■■■□□ 2.3
ATG101-206ENST00000552947 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG101-206ENST00000552947 ARHGEF11O15085 1522 aa29.38■■■□□ 2.29
ATG101-206ENST00000552947 GRIN2BQ13224 1484 aa29.35■■■□□ 2.29
ATG101-206ENST00000552947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG101-206ENST00000552947 PBRM1Q86U86 1689 aa29.28■■■□□ 2.28
ATG101-206ENST00000552947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.26■■■□□ 2.27
ATG101-206ENST00000552947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.25■■■□□ 2.27
ATG101-206ENST00000552947 EEA1Q15075 1411 aa29.24■■■□□ 2.27
ATG101-206ENST00000552947 IGF1RP08069 1367 aa29.21■■■□□ 2.27
ATG101-206ENST00000552947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ATG101-206ENST00000552947 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.19■■■□□ 2.26
ATG101-206ENST00000552947 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
ATG101-206ENST00000552947 ADAMTS12P58397 1594 aa29.13■■■□□ 2.25
ATG101-206ENST00000552947 CHD1O14646 1710 aa29.13■■■□□ 2.25
ATG101-206ENST00000552947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.12■■■□□ 2.25
ATG101-206ENST00000552947 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.11■■■□□ 2.25
ATG101-206ENST00000552947 CUL7Q14999 1698 aa29.1■■■□□ 2.25
ATG101-206ENST00000552947 SYNJ2O15056 1496 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG101-206ENST00000552947 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.07■■■□□ 2.24
ATG101-206ENST00000552947 ARAP1Q96P48 1450 aa29.06■■■□□ 2.24
ATG101-206ENST00000552947 FBLN2P98095 1184 aa29.04■■■□□ 2.24
ATG101-206ENST00000552947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
ATG101-206ENST00000552947 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
ATG101-206ENST00000552947 PRXQ9BXM0 1461 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms