RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551836.5

CRIP2-210, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CRIP2, Length 627 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-210ENST00000551836 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.8■■■■■ 7.16
CRIP2-210ENST00000551836 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.31■■■■■ 6.12
CRIP2-210ENST00000551836 ABCC9O60706 1549 aa52.35■■■■■ 5.97
CRIP2-210ENST00000551836 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.27■■■■■ 5.64
CRIP2-210ENST00000551836 NACADO15069 1562 aa50.17■■■■■ 5.62
CRIP2-210ENST00000551836 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.88■■■■■ 5.58
CRIP2-210ENST00000551836 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.84■■■■■ 5.57
CRIP2-210ENST00000551836 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
CRIP2-210ENST00000551836 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.51■■■■■ 5.52
CRIP2-210ENST00000551836 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.13■■■■■ 5.46
CRIP2-210ENST00000551836 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.84■■■■■ 5.41
CRIP2-210ENST00000551836 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.81■■■■■ 5.4
CRIP2-210ENST00000551836 SCRIBQ14160 1630 aa48.57■■■■■ 5.37
CRIP2-210ENST00000551836 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.32■■■■■ 5.33
CRIP2-210ENST00000551836 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
CRIP2-210ENST00000551836 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
CRIP2-210ENST00000551836 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.37■■■■■ 5.17
CRIP2-210ENST00000551836 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.09■■■■■ 5.13
CRIP2-210ENST00000551836 SMARCA4P51532 1647 aa46.46■■■■■ 5.03
CRIP2-210ENST00000551836 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
CRIP2-210ENST00000551836 NCAPD3P42695 1498 aa46.31■■■■■ 5
CRIP2-210ENST00000551836 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.28■■■■■ 5
CRIP2-210ENST00000551836 SMARCA2P51531 1590 aa46.2■■■■■ 4.99
CRIP2-210ENST00000551836 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.09■■■■■ 4.97
CRIP2-210ENST00000551836 HMGXB3Q12766 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
CRIP2-210ENST00000551836 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.05■■■■■ 4.96
CRIP2-210ENST00000551836 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
CRIP2-210ENST00000551836 WIZO95785 1651 aa45.54■■■■■ 4.88
CRIP2-210ENST00000551836 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
CRIP2-210ENST00000551836 NESP48681 1621 aa45.25■■■■■ 4.83
CRIP2-210ENST00000551836 ERCC6Q03468 1493 aa45.12■■■■■ 4.81
CRIP2-210ENST00000551836 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.11■■■■■ 4.81
CRIP2-210ENST00000551836 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
CRIP2-210ENST00000551836 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.91■■■■■ 4.78
CRIP2-210ENST00000551836 CUX2O14529 1486 aa44.81■■■■■ 4.76
CRIP2-210ENST00000551836 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.78■■■■■ 4.76
CRIP2-210ENST00000551836 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.7■■■■■ 4.75
CRIP2-210ENST00000551836 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
CRIP2-210ENST00000551836 CFTRP13569 1480 aa44.61■■■■■ 4.73
CRIP2-210ENST00000551836 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.53■■■■■ 4.72
CRIP2-210ENST00000551836 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.4■■■■■ 4.7
CRIP2-210ENST00000551836 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.38■■■■■ 4.69
CRIP2-210ENST00000551836 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.36■■■■■ 4.69
CRIP2-210ENST00000551836 WDR62O43379 1518 aa44.26■■■■■ 4.68
CRIP2-210ENST00000551836 PRDM2Q13029 1718 aa44.23■■■■■ 4.67
CRIP2-210ENST00000551836 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
CRIP2-210ENST00000551836 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
CRIP2-210ENST00000551836 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.72■■■■■ 4.59
CRIP2-210ENST00000551836 TOPBP1Q92547 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
CRIP2-210ENST00000551836 ABCC8Q09428 1581 aa43.63■■■■■ 4.57
CRIP2-210ENST00000551836 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.6■■■■■ 4.57
CRIP2-210ENST00000551836 IFT140Q96RY7 1462 aa43.46■■■■■ 4.55
CRIP2-210ENST00000551836 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
CRIP2-210ENST00000551836 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
CRIP2-210ENST00000551836 CUX1P39880 1505 aa43.25■■■■■ 4.51
CRIP2-210ENST00000551836 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
CRIP2-210ENST00000551836 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.13■■■■■ 4.49
CRIP2-210ENST00000551836 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
CRIP2-210ENST00000551836 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.07■■■■■ 4.49
CRIP2-210ENST00000551836 SOGA1O94964 1423 aa43.06■■■■■ 4.48
CRIP2-210ENST00000551836 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.98■■■■■ 4.47
CRIP2-210ENST00000551836 WDR97A6NE52 1622 aa42.89■■■■■ 4.46
CRIP2-210ENST00000551836 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
CRIP2-210ENST00000551836 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.84■■■■■ 4.45
CRIP2-210ENST00000551836 OSCARQ8IYS5 282 aa42.83■■■■■ 4.45
CRIP2-210ENST00000551836 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.81■■■■■ 4.44
CRIP2-210ENST00000551836 TOP2BQ02880 1626 aa42.8■■■■■ 4.44
CRIP2-210ENST00000551836 SYNJ1O43426 1573 aa42.78■■■■■ 4.44
CRIP2-210ENST00000551836 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.72■■■■■ 4.43
CRIP2-210ENST00000551836 GRIN2BQ13224 1484 aa42.62■■■■■ 4.41
CRIP2-210ENST00000551836 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.6■■■■■ 4.41
CRIP2-210ENST00000551836 CHD1O14646 1710 aa42.6■■■■■ 4.41
CRIP2-210ENST00000551836 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.59■■■■■ 4.41
CRIP2-210ENST00000551836 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.57■■■■■ 4.41
CRIP2-210ENST00000551836 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
CRIP2-210ENST00000551836 PBRM1Q86U86 1689 aa42.51■■■■■ 4.39
CRIP2-210ENST00000551836 FBLN2P98095 1184 aa42.42■■■■■ 4.38
CRIP2-210ENST00000551836 SYNJ2O15056 1496 aa42.38■■■■■ 4.38
CRIP2-210ENST00000551836 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
CRIP2-210ENST00000551836 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
CRIP2-210ENST00000551836 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
CRIP2-210ENST00000551836 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
CRIP2-210ENST00000551836 ARHGEF11O15085 1522 aa42.2■■■■■ 4.35
CRIP2-210ENST00000551836 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.2■■■■■ 4.35
CRIP2-210ENST00000551836 ADAMTS12P58397 1594 aa42.19■■■■■ 4.34
CRIP2-210ENST00000551836 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.19■■■■■ 4.34
CRIP2-210ENST00000551836 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.09■■■■■ 4.33
CRIP2-210ENST00000551836 TRIM41Q8WV44 630 aa42.08■■■■■ 4.33
CRIP2-210ENST00000551836 GRIN2AQ12879 1464 aa42.08■■■■■ 4.33
CRIP2-210ENST00000551836 KIF27Q86VH2 1401 aa41.95■■■■■ 4.31
CRIP2-210ENST00000551836 NUP160Q12769 1436 aa41.93■■■■■ 4.3
CRIP2-210ENST00000551836 CEP170Q5SW79 1584 aa41.89■■■■■ 4.3
CRIP2-210ENST00000551836 ARAP1Q96P48 1450 aa41.87■■■■■ 4.29
CRIP2-210ENST00000551836 IGF1RP08069 1367 aa41.84■■■■■ 4.29
CRIP2-210ENST00000551836 CUL7Q14999 1698 aa41.75■■■■■ 4.27
CRIP2-210ENST00000551836 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.74■■■■■ 4.27
CRIP2-210ENST00000551836 SHROOM2Q13796 1616 aa41.66■■■■■ 4.26
CRIP2-210ENST00000551836 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.59■■■■■ 4.25
CRIP2-210ENST00000551836 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.56■■■■■ 4.24
CRIP2-210ENST00000551836 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.56■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms