RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545736.2

CORO1B-208, Transcript of coronin 1B, humanhuman

TSL 2

Gene CORO1B, Length 1,037 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1B-208ENST00000545736 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.92■■■■■ 5.26
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CORO1B-208ENST00000545736 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.54■■■■■ 4.08
CORO1B-208ENST00000545736 NACADO15069 1562 aa40.37■■■■■ 4.05
CORO1B-208ENST00000545736 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.12■■■■■ 4.01
CORO1B-208ENST00000545736 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
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CORO1B-208ENST00000545736 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.61■■■■□ 3.93
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CORO1B-208ENST00000545736 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.45■■■■□ 3.91
CORO1B-208ENST00000545736 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.44■■■■□ 3.9
CORO1B-208ENST00000545736 SCRIBQ14160 1630 aa39.07■■■■□ 3.85
CORO1B-208ENST00000545736 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.86■■■■□ 3.81
CORO1B-208ENST00000545736 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
CORO1B-208ENST00000545736 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.37■■■■□ 3.73
CORO1B-208ENST00000545736 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.15■■■■□ 3.7
CORO1B-208ENST00000545736 SMARCA4P51532 1647 aa37.32■■■■□ 3.56
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CORO1B-208ENST00000545736 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.22■■■■□ 3.55
CORO1B-208ENST00000545736 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
CORO1B-208ENST00000545736 SMARCA2P51531 1590 aa37.12■■■■□ 3.53
CORO1B-208ENST00000545736 HMGXB3Q12766 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
CORO1B-208ENST00000545736 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.96■■■■□ 3.51
CORO1B-208ENST00000545736 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.95■■■■□ 3.51
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CORO1B-208ENST00000545736 WIZO95785 1651 aa36.54■■■■□ 3.44
CORO1B-208ENST00000545736 ERCC6Q03468 1493 aa36.54■■■■□ 3.44
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CORO1B-208ENST00000545736 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.36■■■■□ 3.41
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CORO1B-208ENST00000545736 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.13■■■■□ 3.37
CORO1B-208ENST00000545736 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.08■■■■□ 3.37
CORO1B-208ENST00000545736 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
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CORO1B-208ENST00000545736 CFTRP13569 1480 aa35.84■■■■□ 3.33
CORO1B-208ENST00000545736 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.8■■■■□ 3.32
CORO1B-208ENST00000545736 WDR62O43379 1518 aa35.74■■■■□ 3.31
CORO1B-208ENST00000545736 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.73■■■■□ 3.31
CORO1B-208ENST00000545736 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
CORO1B-208ENST00000545736 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.66■■■■□ 3.3
CORO1B-208ENST00000545736 PRDM2Q13029 1718 aa35.57■■■■□ 3.29
CORO1B-208ENST00000545736 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CORO1B-208ENST00000545736 TOPBP1Q92547 1522 aa35.13■■■■□ 3.21
CORO1B-208ENST00000545736 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
CORO1B-208ENST00000545736 ABCC8Q09428 1581 aa35■■■■□ 3.19
CORO1B-208ENST00000545736 IFT140Q96RY7 1462 aa35■■■■□ 3.19
CORO1B-208ENST00000545736 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
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CORO1B-208ENST00000545736 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CORO1B-208ENST00000545736 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
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CORO1B-208ENST00000545736 CUX1P39880 1505 aa34.71■■■■□ 3.15
CORO1B-208ENST00000545736 OSCARQ8IYS5 282 aa34.7■■■■□ 3.15
CORO1B-208ENST00000545736 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.66■■■■□ 3.14
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CORO1B-208ENST00000545736 SOGA1O94964 1423 aa34.59■■■■□ 3.13
CORO1B-208ENST00000545736 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CORO1B-208ENST00000545736 CHD1O14646 1710 aa34.47■■■■□ 3.11
CORO1B-208ENST00000545736 WDR97A6NE52 1622 aa34.45■■■■□ 3.11
CORO1B-208ENST00000545736 TRIM41Q8WV44 630 aa34.41■■■■□ 3.1
CORO1B-208ENST00000545736 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-208ENST00000545736 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-208ENST00000545736 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-208ENST00000545736 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.33■■■■□ 3.09
CORO1B-208ENST00000545736 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.26■■■■□ 3.08
CORO1B-208ENST00000545736 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.26■■■■□ 3.08
CORO1B-208ENST00000545736 GRIN2BQ13224 1484 aa34.26■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 ARHGEF11O15085 1522 aa34.25■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 SYNJ1O43426 1573 aa34.24■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 TOP2BQ02880 1626 aa34.24■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 FBLN2P98095 1184 aa34.24■■■■□ 3.07
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CORO1B-208ENST00000545736 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.22■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.21■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.2■■■■□ 3.07
CORO1B-208ENST00000545736 SYNJ2O15056 1496 aa34.11■■■■□ 3.05
CORO1B-208ENST00000545736 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.08■■■■□ 3.05
CORO1B-208ENST00000545736 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CORO1B-208ENST00000545736 ARAP1Q96P48 1450 aa33.96■■■■□ 3.03
CORO1B-208ENST00000545736 ADAMTS12P58397 1594 aa33.93■■■■□ 3.02
CORO1B-208ENST00000545736 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.88■■■■□ 3.01
CORO1B-208ENST00000545736 GRIN2AQ12879 1464 aa33.85■■■■□ 3.01
CORO1B-208ENST00000545736 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.83■■■■□ 3.01
CORO1B-208ENST00000545736 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.78■■■■□ 3
CORO1B-208ENST00000545736 CEP170Q5SW79 1584 aa33.75■■■□□ 2.99
CORO1B-208ENST00000545736 NUP160Q12769 1436 aa33.73■■■□□ 2.99
CORO1B-208ENST00000545736 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.6■■■□□ 2.97
CORO1B-208ENST00000545736 SHROOM2Q13796 1616 aa33.57■■■□□ 2.97
CORO1B-208ENST00000545736 KIF27Q86VH2 1401 aa33.51■■■□□ 2.95
CORO1B-208ENST00000545736 IGF1RP08069 1367 aa33.47■■■□□ 2.95
CORO1B-208ENST00000545736 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.44■■■□□ 2.94
CORO1B-208ENST00000545736 CUL7Q14999 1698 aa33.43■■■□□ 2.94
CORO1B-208ENST00000545736 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
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