RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545470.5

STK38L-212, Transcript of serine/threonine kinase 38 like, humanhuman

TSL 3

Gene STK38L, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK38L-212ENST00000545470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.68■■■■■ 6.82
STK38L-212ENST00000545470 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.52■■■■■ 5.84
STK38L-212ENST00000545470 ABCC9O60706 1549 aa50.72■■■■■ 5.71
STK38L-212ENST00000545470 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.62■■■■■ 5.37
STK38L-212ENST00000545470 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
STK38L-212ENST00000545470 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.36■■■■■ 5.33
STK38L-212ENST00000545470 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
STK38L-212ENST00000545470 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.94■■■■■ 5.26
STK38L-212ENST00000545470 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.65■■■■■ 5.22
STK38L-212ENST00000545470 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.64■■■■■ 5.22
STK38L-212ENST00000545470 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.28■■■■■ 5.16
STK38L-212ENST00000545470 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.15■■■■■ 5.14
STK38L-212ENST00000545470 SCRIBQ14160 1630 aa47.05■■■■■ 5.12
STK38L-212ENST00000545470 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.72■■■■■ 5.07
STK38L-212ENST00000545470 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.55■■■■■ 5.04
STK38L-212ENST00000545470 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
STK38L-212ENST00000545470 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.87■■■■■ 4.93
STK38L-212ENST00000545470 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.57■■■■■ 4.89
STK38L-212ENST00000545470 SMARCA4P51532 1647 aa44.9■■■■■ 4.78
STK38L-212ENST00000545470 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
STK38L-212ENST00000545470 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.66■■■■■ 4.74
STK38L-212ENST00000545470 NCAPD3P42695 1498 aa44.63■■■■■ 4.73
STK38L-212ENST00000545470 SMARCA2P51531 1590 aa44.62■■■■■ 4.73
STK38L-212ENST00000545470 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.48■■■■■ 4.71
STK38L-212ENST00000545470 HMGXB3Q12766 1538 aa44.47■■■■■ 4.71
STK38L-212ENST00000545470 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.38■■■■■ 4.69
STK38L-212ENST00000545470 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
STK38L-212ENST00000545470 WIZO95785 1651 aa44.06■■■■■ 4.64
STK38L-212ENST00000545470 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
STK38L-212ENST00000545470 NESP48681 1621 aa43.78■■■■■ 4.6
STK38L-212ENST00000545470 ERCC6Q03468 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
STK38L-212ENST00000545470 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.6■■■■■ 4.57
STK38L-212ENST00000545470 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
STK38L-212ENST00000545470 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.36■■■■■ 4.53
STK38L-212ENST00000545470 CUX2O14529 1486 aa43.34■■■■■ 4.53
STK38L-212ENST00000545470 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.32■■■■■ 4.53
STK38L-212ENST00000545470 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.26■■■■■ 4.52
STK38L-212ENST00000545470 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
STK38L-212ENST00000545470 CFTRP13569 1480 aa43.01■■■■■ 4.48
STK38L-212ENST00000545470 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.95■■■■■ 4.47
STK38L-212ENST00000545470 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.92■■■■■ 4.46
STK38L-212ENST00000545470 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.91■■■■■ 4.46
STK38L-212ENST00000545470 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.9■■■■■ 4.46
STK38L-212ENST00000545470 PRDM2Q13029 1718 aa42.87■■■■■ 4.45
STK38L-212ENST00000545470 WDR62O43379 1518 aa42.77■■■■■ 4.44
STK38L-212ENST00000545470 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
STK38L-212ENST00000545470 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
STK38L-212ENST00000545470 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.33■■■■■ 4.37
STK38L-212ENST00000545470 TOPBP1Q92547 1522 aa42.19■■■■■ 4.34
STK38L-212ENST00000545470 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.14■■■■■ 4.34
STK38L-212ENST00000545470 ABCC8Q09428 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
STK38L-212ENST00000545470 IFT140Q96RY7 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
STK38L-212ENST00000545470 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
STK38L-212ENST00000545470 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
STK38L-212ENST00000545470 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
STK38L-212ENST00000545470 CUX1P39880 1505 aa41.76■■■■■ 4.28
STK38L-212ENST00000545470 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
STK38L-212ENST00000545470 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.68■■■■■ 4.26
STK38L-212ENST00000545470 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.64■■■■■ 4.26
STK38L-212ENST00000545470 SOGA1O94964 1423 aa41.58■■■■■ 4.25
STK38L-212ENST00000545470 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
STK38L-212ENST00000545470 WDR97A6NE52 1622 aa41.42■■■■■ 4.22
STK38L-212ENST00000545470 OSCARQ8IYS5 282 aa41.41■■■■■ 4.22
STK38L-212ENST00000545470 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
STK38L-212ENST00000545470 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.35■■■■■ 4.21
STK38L-212ENST00000545470 CHD1O14646 1710 aa41.34■■■■■ 4.21
STK38L-212ENST00000545470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
STK38L-212ENST00000545470 SYNJ1O43426 1573 aa41.33■■■■■ 4.21
STK38L-212ENST00000545470 TOP2BQ02880 1626 aa41.32■■■■■ 4.2
STK38L-212ENST00000545470 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.21■■■■■ 4.19
STK38L-212ENST00000545470 PBRM1Q86U86 1689 aa41.21■■■■■ 4.19
STK38L-212ENST00000545470 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.2■■■■■ 4.19
STK38L-212ENST00000545470 GRIN2BQ13224 1484 aa41.16■■■■■ 4.18
STK38L-212ENST00000545470 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.15■■■■■ 4.18
STK38L-212ENST00000545470 FBLN2P98095 1184 aa41.14■■■■■ 4.18
STK38L-212ENST00000545470 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.13■■■■■ 4.17
STK38L-212ENST00000545470 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
STK38L-212ENST00000545470 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.95■■■■■ 4.15
STK38L-212ENST00000545470 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.95■■■■■ 4.15
STK38L-212ENST00000545470 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.95■■■■■ 4.15
STK38L-212ENST00000545470 SYNJ2O15056 1496 aa40.94■■■■■ 4.14
STK38L-212ENST00000545470 TRIM41Q8WV44 630 aa40.93■■■■■ 4.14
STK38L-212ENST00000545470 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
STK38L-212ENST00000545470 ARHGEF11O15085 1522 aa40.87■■■■■ 4.13
STK38L-212ENST00000545470 ADAMTS12P58397 1594 aa40.81■■■■■ 4.12
STK38L-212ENST00000545470 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.77■■■■■ 4.12
STK38L-212ENST00000545470 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.72■■■■■ 4.11
STK38L-212ENST00000545470 GRIN2AQ12879 1464 aa40.65■■■■■ 4.1
STK38L-212ENST00000545470 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.61■■■■■ 4.09
STK38L-212ENST00000545470 CEP170Q5SW79 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
STK38L-212ENST00000545470 ARAP1Q96P48 1450 aa40.51■■■■■ 4.08
STK38L-212ENST00000545470 KIF27Q86VH2 1401 aa40.49■■■■■ 4.07
STK38L-212ENST00000545470 NUP160Q12769 1436 aa40.44■■■■■ 4.06
STK38L-212ENST00000545470 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.44■■■■■ 4.06
STK38L-212ENST00000545470 CUL7Q14999 1698 aa40.37■■■■■ 4.05
STK38L-212ENST00000545470 IGF1RP08069 1367 aa40.29■■■■■ 4.04
STK38L-212ENST00000545470 SHROOM2Q13796 1616 aa40.24■■■■■ 4.03
STK38L-212ENST00000545470 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.22■■■■■ 4.03
STK38L-212ENST00000545470 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.21■■■■■ 4.03
STK38L-212ENST00000545470 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.4 ms