RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.059e-18■■■■■ 145.2
RPS6KC1-207ENST00000543470 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 107.6
RPS6KC1-207ENST00000543470 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 92.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 60.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.889e-6■■■■■ 50.1
RPS6KC1-207ENST00000543470 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 45.7
RPS6KC1-207ENST00000543470 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.095e-10■■■■■ 37.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 35
RPS6KC1-207ENST00000543470 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.295e-17■■■■■ 33
RPS6KC1-207ENST00000543470 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 32.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.33□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 31
RPS6KC1-207ENST00000543470 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 27.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.055e-6■■■■□ 25.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 24.7
RPS6KC1-207ENST00000543470 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.255e-6■■■■□ 24.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.26e-9■■■■□ 24.1
RPS6KC1-207ENST00000543470 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.245e-12■■■■□ 23.9
RPS6KC1-207ENST00000543470 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 23.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.543e-10■■■■□ 23.6
RPS6KC1-207ENST00000543470 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 23
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.7
RPS6KC1-207ENST00000543470 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 22.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.012e-7■■■■□ 22.3
RPS6KC1-207ENST00000543470 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.299e-8■■■■□ 20.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 20.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 19.7
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 19.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.99■□□□□ 0.632e-14■■■□□ 18.8
RPS6KC1-207ENST00000543470 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 17.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.553e-6■■■□□ 17.5
RPS6KC1-207ENST00000543470 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 17.3
RPS6KC1-207ENST00000543470 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 17.1
RPS6KC1-207ENST00000543470 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.487e-17■■■□□ 17.1
RPS6KC1-207ENST00000543470 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.184e-6■■■□□ 15
RPS6KC1-207ENST00000543470 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.163e-7■■■□□ 14.7
RPS6KC1-207ENST00000543470 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.112e-7■■□□□ 14.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 04e-6■■□□□ 13.9
RPS6KC1-207ENST00000543470 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP15.11■□□□□ 0.016e-6■■□□□ 12.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.182e-7■■□□□ 12.3
RPS6KC1-207ENST00000543470 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.087e-6■■□□□ 12.2
RPS6KC1-207ENST00000543470 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.296e-7■■□□□ 12.1
RPS6KC1-207ENST00000543470 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.066e-19■■□□□ 11.6
RPS6KC1-207ENST00000543470 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.694e-7■□□□□ 10.7
RPS6KC1-207ENST00000543470 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.239e-7■□□□□ 9.9
RPS6KC1-207ENST00000543470 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 8.9
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 8.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.536e-7■□□□□ 8.1
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