RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-223ENST00000538860 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.82■■■■□ 3.32
ADD1-223ENST00000538860 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.75■■■□□ 2.67
ADD1-223ENST00000538860 ABCC9O60706 1549 aa30.87■■■□□ 2.53
ADD1-223ENST00000538860 NACADO15069 1562 aa29.9■■■□□ 2.38
ADD1-223ENST00000538860 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.86■■■□□ 2.37
ADD1-223ENST00000538860 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ADD1-223ENST00000538860 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.84■■■□□ 2.37
ADD1-223ENST00000538860 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.78■■■□□ 2.36
ADD1-223ENST00000538860 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.74■■■□□ 2.35
ADD1-223ENST00000538860 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.05■■■□□ 2.24
ADD1-223ENST00000538860 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29■■■□□ 2.23
ADD1-223ENST00000538860 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.9■■■□□ 2.22
ADD1-223ENST00000538860 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
ADD1-223ENST00000538860 SCRIBQ14160 1630 aa28.85■■■□□ 2.21
ADD1-223ENST00000538860 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.78■■■□□ 2.2
ADD1-223ENST00000538860 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ADD1-223ENST00000538860 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.96■■■□□ 2.07
ADD1-223ENST00000538860 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.83■■■□□ 2.05
ADD1-223ENST00000538860 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
ADD1-223ENST00000538860 SMARCA4P51532 1647 aa27.7■■■□□ 2.02
ADD1-223ENST00000538860 NCAPD3P42695 1498 aa27.64■■■□□ 2.01
ADD1-223ENST00000538860 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.59■■■□□ 2.01
ADD1-223ENST00000538860 SMARCA2P51531 1590 aa27.57■■■□□ 2
ADD1-223ENST00000538860 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.55■■■□□ 2
ADD1-223ENST00000538860 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.53■■■□□ 2
ADD1-223ENST00000538860 HMGXB3Q12766 1538 aa27.44■■□□□ 1.98
ADD1-223ENST00000538860 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ADD1-223ENST00000538860 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ADD1-223ENST00000538860 WIZO95785 1651 aa27.19■■□□□ 1.94
ADD1-223ENST00000538860 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.18■■□□□ 1.94
ADD1-223ENST00000538860 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ADD1-223ENST00000538860 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.81■■□□□ 1.88
ADD1-223ENST00000538860 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.8■■□□□ 1.88
ADD1-223ENST00000538860 NESP48681 1621 aa26.74■■□□□ 1.87
ADD1-223ENST00000538860 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.7■■□□□ 1.87
ADD1-223ENST00000538860 CFTRP13569 1480 aa26.67■■□□□ 1.86
ADD1-223ENST00000538860 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.66■■□□□ 1.86
ADD1-223ENST00000538860 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ADD1-223ENST00000538860 ERCC6Q03468 1493 aa26.62■■□□□ 1.85
ADD1-223ENST00000538860 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.42■■□□□ 1.82
ADD1-223ENST00000538860 CUX2O14529 1486 aa26.41■■□□□ 1.82
ADD1-223ENST00000538860 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.37■■□□□ 1.81
ADD1-223ENST00000538860 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.37■■□□□ 1.81
ADD1-223ENST00000538860 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
ADD1-223ENST00000538860 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.31■■□□□ 1.8
ADD1-223ENST00000538860 PRDM2Q13029 1718 aa26.29■■□□□ 1.8
ADD1-223ENST00000538860 WDR62O43379 1518 aa26.23■■□□□ 1.79
ADD1-223ENST00000538860 ABCC8Q09428 1581 aa26.13■■□□□ 1.77
ADD1-223ENST00000538860 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
ADD1-223ENST00000538860 TOPBP1Q92547 1522 aa26.01■■□□□ 1.75
ADD1-223ENST00000538860 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.98■■□□□ 1.75
ADD1-223ENST00000538860 IFT140Q96RY7 1462 aa25.86■■□□□ 1.73
ADD1-223ENST00000538860 CUX1P39880 1505 aa25.83■■□□□ 1.72
ADD1-223ENST00000538860 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ADD1-223ENST00000538860 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
ADD1-223ENST00000538860 TRIM41Q8WV44 630 aa25.76■■□□□ 1.71
ADD1-223ENST00000538860 SOGA1O94964 1423 aa25.74■■□□□ 1.71
ADD1-223ENST00000538860 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.72■■□□□ 1.71
ADD1-223ENST00000538860 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
ADD1-223ENST00000538860 TOP2BQ02880 1626 aa25.66■■□□□ 1.7
ADD1-223ENST00000538860 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
ADD1-223ENST00000538860 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.64■■□□□ 1.7
ADD1-223ENST00000538860 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.64■■□□□ 1.69
ADD1-223ENST00000538860 WDR97A6NE52 1622 aa25.6■■□□□ 1.69
ADD1-223ENST00000538860 SYNJ1O43426 1573 aa25.59■■□□□ 1.69
ADD1-223ENST00000538860 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.56■■□□□ 1.68
ADD1-223ENST00000538860 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
ADD1-223ENST00000538860 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ADD1-223ENST00000538860 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ADD1-223ENST00000538860 GRIN2BQ13224 1484 aa25.42■■□□□ 1.66
ADD1-223ENST00000538860 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.42■■□□□ 1.66
ADD1-223ENST00000538860 OSCARQ8IYS5 282 aa25.37■■□□□ 1.65
ADD1-223ENST00000538860 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.37■■□□□ 1.65
ADD1-223ENST00000538860 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
ADD1-223ENST00000538860 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.28■■□□□ 1.64
ADD1-223ENST00000538860 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.26■■□□□ 1.63
ADD1-223ENST00000538860 KIF27Q86VH2 1401 aa25.25■■□□□ 1.63
ADD1-223ENST00000538860 SYNJ2O15056 1496 aa25.23■■□□□ 1.63
ADD1-223ENST00000538860 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ADD1-223ENST00000538860 PBRM1Q86U86 1689 aa25.22■■□□□ 1.63
ADD1-223ENST00000538860 FBLN2P98095 1184 aa25.19■■□□□ 1.62
ADD1-223ENST00000538860 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.17■■□□□ 1.62
ADD1-223ENST00000538860 IGF1RP08069 1367 aa25.16■■□□□ 1.62
ADD1-223ENST00000538860 CHD1O14646 1710 aa25.11■■□□□ 1.61
ADD1-223ENST00000538860 ADAMTS12P58397 1594 aa25.1■■□□□ 1.61
ADD1-223ENST00000538860 GRIN2AQ12879 1464 aa25.06■■□□□ 1.6
ADD1-223ENST00000538860 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.03■■□□□ 1.6
ADD1-223ENST00000538860 NUP160Q12769 1436 aa24.99■■□□□ 1.59
ADD1-223ENST00000538860 CUL7Q14999 1698 aa24.98■■□□□ 1.59
ADD1-223ENST00000538860 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.98■■□□□ 1.59
ADD1-223ENST00000538860 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.96■■□□□ 1.59
ADD1-223ENST00000538860 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.94■■□□□ 1.58
ADD1-223ENST00000538860 EEA1Q15075 1411 aa24.9■■□□□ 1.58
ADD1-223ENST00000538860 CEP170Q5SW79 1584 aa24.87■■□□□ 1.57
ADD1-223ENST00000538860 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.86■■□□□ 1.57
ADD1-223ENST00000538860 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.86■■□□□ 1.57
ADD1-223ENST00000538860 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.86■■□□□ 1.57
ADD1-223ENST00000538860 ARHGEF11O15085 1522 aa24.84■■□□□ 1.57
ADD1-223ENST00000538860 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.83■■□□□ 1.57
ADD1-223ENST00000538860 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms