RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.65■■■■■ 4.74
PUF60-217ENST00000531951 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.5■■■■□ 3.91
PUF60-217ENST00000531951 ABCC9O60706 1549 aa37.78■■■■□ 3.64
PUF60-217ENST00000531951 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
PUF60-217ENST00000531951 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37■■■■□ 3.51
PUF60-217ENST00000531951 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.88■■■■□ 3.49
PUF60-217ENST00000531951 NACADO15069 1562 aa36.87■■■■□ 3.49
PUF60-217ENST00000531951 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.84■■■■□ 3.49
PUF60-217ENST00000531951 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.74■■■■□ 3.47
PUF60-217ENST00000531951 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.1■■■■□ 3.37
PUF60-217ENST00000531951 SCRIBQ14160 1630 aa36.02■■■■□ 3.36
PUF60-217ENST00000531951 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.63■■■■□ 3.29
PUF60-217ENST00000531951 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.62■■■■□ 3.29
PUF60-217ENST00000531951 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.253e-7■□□□□ 10.7
PUF60-217ENST00000531951 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.66■■■■□ 3.14
PUF60-217ENST00000531951 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
PUF60-217ENST00000531951 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
PUF60-217ENST00000531951 SMARCA4P51532 1647 aa34.55■■■■□ 3.12
PUF60-217ENST00000531951 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.42■■■■□ 3.1
PUF60-217ENST00000531951 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.29■■■■□ 3.08
PUF60-217ENST00000531951 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PUF60-217ENST00000531951 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.19■■■■□ 3.06
PUF60-217ENST00000531951 WIZO95785 1651 aa34.15■■■■□ 3.06
PUF60-217ENST00000531951 SMARCA2P51531 1590 aa34.13■■■■□ 3.05
PUF60-217ENST00000531951 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.08■■■■□ 3.05
PUF60-217ENST00000531951 NCAPD3P42695 1498 aa33.95■■■■□ 3.02
PUF60-217ENST00000531951 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.94■■■■□ 3.02
PUF60-217ENST00000531951 HMGXB3Q12766 1538 aa33.93■■■■□ 3.02
PUF60-217ENST00000531951 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
PUF60-217ENST00000531951 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PUF60-217ENST00000531951 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
PUF60-217ENST00000531951 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.34■■■□□ 2.93
PUF60-217ENST00000531951 PRDM2Q13029 1718 aa33.02■■■□□ 2.88
PUF60-217ENST00000531951 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.01■■■□□ 2.88
PUF60-217ENST00000531951 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.97■■■□□ 2.87
PUF60-217ENST00000531951 CFTRP13569 1480 aa32.97■■■□□ 2.87
PUF60-217ENST00000531951 NESP48681 1621 aa32.94■■■□□ 2.86
PUF60-217ENST00000531951 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.71■■■□□ 2.83
PUF60-217ENST00000531951 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.68■■■□□ 2.82
PUF60-217ENST00000531951 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.63■■■□□ 2.81
PUF60-217ENST00000531951 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.54■■■□□ 2.8
PUF60-217ENST00000531951 ERCC6Q03468 1493 aa32.5■■■□□ 2.79
PUF60-217ENST00000531951 ABCC8Q09428 1581 aa32.4■■■□□ 2.78
PUF60-217ENST00000531951 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
PUF60-217ENST00000531951 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.34■■■□□ 2.77
PUF60-217ENST00000531951 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.28■■■□□ 2.76
PUF60-217ENST00000531951 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
PUF60-217ENST00000531951 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
PUF60-217ENST00000531951 CUX1P39880 1505 aa32.26■■■□□ 2.75
PUF60-217ENST00000531951 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.25■■■□□ 2.75
PUF60-217ENST00000531951 WDR62O43379 1518 aa32.25■■■□□ 2.75
PUF60-217ENST00000531951 SYNJ1O43426 1573 aa32.24■■■□□ 2.75
PUF60-217ENST00000531951 TOP2BQ02880 1626 aa32.22■■■□□ 2.75
PUF60-217ENST00000531951 TOPBP1Q92547 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
PUF60-217ENST00000531951 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.05■■■□□ 2.72
PUF60-217ENST00000531951 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.01■■■□□ 2.71
PUF60-217ENST00000531951 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
PUF60-217ENST00000531951 TRIM41Q8WV44 630 aa31.94■■■□□ 2.7
PUF60-217ENST00000531951 CUX2O14529 1486 aa31.92■■■□□ 2.7
PUF60-217ENST00000531951 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
PUF60-217ENST00000531951 WDR97A6NE52 1622 aa31.86■■■□□ 2.69
PUF60-217ENST00000531951 IFT140Q96RY7 1462 aa31.81■■■□□ 2.68
PUF60-217ENST00000531951 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.81■■■□□ 2.68
PUF60-217ENST00000531951 SOGA1O94964 1423 aa31.81■■■□□ 2.68
PUF60-217ENST00000531951 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.75■■■□□ 2.67
PUF60-217ENST00000531951 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.62■■■□□ 2.65
PUF60-217ENST00000531951 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
PUF60-217ENST00000531951 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
PUF60-217ENST00000531951 PBRM1Q86U86 1689 aa31.54■■■□□ 2.64
PUF60-217ENST00000531951 KIF27Q86VH2 1401 aa31.53■■■□□ 2.64
PUF60-217ENST00000531951 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
PUF60-217ENST00000531951 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.5■■■□□ 2.63
PUF60-217ENST00000531951 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.631e-6■■■■■ 58
PUF60-217ENST00000531951 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.49■■■□□ 2.63
PUF60-217ENST00000531951 EEA1Q15075 1411 aa31.44■■■□□ 2.62
PUF60-217ENST00000531951 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.39■■■□□ 2.62
PUF60-217ENST00000531951 GRIN2BQ13224 1484 aa31.39■■■□□ 2.62
PUF60-217ENST00000531951 CUL7Q14999 1698 aa31.32■■■□□ 2.6
PUF60-217ENST00000531951 IGF1RP08069 1367 aa31.29■■■□□ 2.6
PUF60-217ENST00000531951 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PUF60-217ENST00000531951 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.26■■■□□ 2.59
PUF60-217ENST00000531951 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PUF60-217ENST00000531951 ADAMTS12P58397 1594 aa31.26■■■□□ 2.59
PUF60-217ENST00000531951 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.21■■■□□ 2.59
PUF60-217ENST00000531951 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.15■■■□□ 2.58
PUF60-217ENST00000531951 KIF21BO75037 1637 aa31.14■■■□□ 2.58
PUF60-217ENST00000531951 PRXQ9BXM0 1461 aa31.14■■■□□ 2.57
PUF60-217ENST00000531951 CHD1O14646 1710 aa31.13■■■□□ 2.57
PUF60-217ENST00000531951 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.12■■■□□ 2.57
PUF60-217ENST00000531951 SYNJ2O15056 1496 aa31.11■■■□□ 2.57
PUF60-217ENST00000531951 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.06■■■□□ 2.56
PUF60-217ENST00000531951 GRIN2AQ12879 1464 aa31.01■■■□□ 2.55
PUF60-217ENST00000531951 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
PUF60-217ENST00000531951 GOLGA3Q08378 1498 aa30.95■■■□□ 2.54
PUF60-217ENST00000531951 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.9■■■□□ 2.54
PUF60-217ENST00000531951 FBLN2P98095 1184 aa30.9■■■□□ 2.54
PUF60-217ENST00000531951 CEP170Q5SW79 1584 aa30.86■■■□□ 2.53
PUF60-217ENST00000531951 NUP160Q12769 1436 aa30.82■■■□□ 2.52
PUF60-217ENST00000531951 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.78■■■□□ 2.52
PUF60-217ENST00000531951 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.72■■■□□ 2.51
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