RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531419.5

SLC39A13-210, Transcript of solute carrier family 39 member 13, humanhuman

TSL 5

Gene SLC39A13, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A13-210ENST00000531419 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.81■■■■■ 6.04
SLC39A13-210ENST00000531419 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.17■■■■■ 5.14
SLC39A13-210ENST00000531419 ABCC9O60706 1549 aa46.68■■■■■ 5.06
SLC39A13-210ENST00000531419 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.67■■■■■ 4.74
SLC39A13-210ENST00000531419 NACADO15069 1562 aa44.48■■■■■ 4.71
SLC39A13-210ENST00000531419 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.38■■■■■ 4.7
SLC39A13-210ENST00000531419 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.04■■■■■ 4.64
SLC39A13-210ENST00000531419 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
SLC39A13-210ENST00000531419 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.66■■■■■ 4.58
SLC39A13-210ENST00000531419 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.59■■■■■ 4.57
SLC39A13-210ENST00000531419 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.53■■■■■ 4.56
SLC39A13-210ENST00000531419 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.29■■■■■ 4.52
SLC39A13-210ENST00000531419 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.27■■■■■ 4.52
SLC39A13-210ENST00000531419 SCRIBQ14160 1630 aa43.02■■■■■ 4.48
SLC39A13-210ENST00000531419 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.83■■■■■ 4.45
SLC39A13-210ENST00000531419 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
SLC39A13-210ENST00000531419 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.18■■■■■ 4.34
SLC39A13-210ENST00000531419 CECR2Q9BXF3 1484 aa42■■■■■ 4.31
SLC39A13-210ENST00000531419 SMARCA4P51532 1647 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC39A13-210ENST00000531419 NCAPD3P42695 1498 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC39A13-210ENST00000531419 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41■■■■■ 4.15
SLC39A13-210ENST00000531419 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
SLC39A13-210ENST00000531419 SMARCA2P51531 1590 aa40.93■■■■■ 4.14
SLC39A13-210ENST00000531419 HMGXB3Q12766 1538 aa40.8■■■■■ 4.12
SLC39A13-210ENST00000531419 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.69■■■■■ 4.1
SLC39A13-210ENST00000531419 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.68■■■■■ 4.1
SLC39A13-210ENST00000531419 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
SLC39A13-210ENST00000531419 ERCC6Q03468 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC39A13-210ENST00000531419 WIZO95785 1651 aa40.22■■■■■ 4.03
SLC39A13-210ENST00000531419 NESP48681 1621 aa40.22■■■■■ 4.03
SLC39A13-210ENST00000531419 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.05■■■■■ 4
SLC39A13-210ENST00000531419 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
SLC39A13-210ENST00000531419 CUX2O14529 1486 aa40.03■■■■■ 4
SLC39A13-210ENST00000531419 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC39A13-210ENST00000531419 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.82■■■■□ 3.97
SLC39A13-210ENST00000531419 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
SLC39A13-210ENST00000531419 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
SLC39A13-210ENST00000531419 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC39A13-210ENST00000531419 CFTRP13569 1480 aa39.49■■■■□ 3.91
SLC39A13-210ENST00000531419 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.44■■■■□ 3.9
SLC39A13-210ENST00000531419 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.4■■■■□ 3.9
SLC39A13-210ENST00000531419 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.39■■■■□ 3.9
SLC39A13-210ENST00000531419 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.38■■■■□ 3.9
SLC39A13-210ENST00000531419 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.31■■■■□ 3.88
SLC39A13-210ENST00000531419 WDR62O43379 1518 aa39.31■■■■□ 3.88
SLC39A13-210ENST00000531419 PRDM2Q13029 1718 aa39.11■■■■□ 3.85
SLC39A13-210ENST00000531419 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
SLC39A13-210ENST00000531419 TOPBP1Q92547 1522 aa38.69■■■■□ 3.78
SLC39A13-210ENST00000531419 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
SLC39A13-210ENST00000531419 ABCC8Q09428 1581 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC39A13-210ENST00000531419 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC39A13-210ENST00000531419 IFT140Q96RY7 1462 aa38.59■■■■□ 3.77
SLC39A13-210ENST00000531419 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
SLC39A13-210ENST00000531419 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
SLC39A13-210ENST00000531419 OSCARQ8IYS5 282 aa38.29■■■■□ 3.72
SLC39A13-210ENST00000531419 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
SLC39A13-210ENST00000531419 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
SLC39A13-210ENST00000531419 CUX1P39880 1505 aa38.2■■■■□ 3.71
SLC39A13-210ENST00000531419 SOGA1O94964 1423 aa38.18■■■■□ 3.7
SLC39A13-210ENST00000531419 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.17■■■■□ 3.7
SLC39A13-210ENST00000531419 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.17■■■■□ 3.7
SLC39A13-210ENST00000531419 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.16■■■■□ 3.72e-8■■■■■ 42.3
SLC39A13-210ENST00000531419 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
SLC39A13-210ENST00000531419 WDR97A6NE52 1622 aa37.98■■■■□ 3.67
SLC39A13-210ENST00000531419 TRIM41Q8WV44 630 aa37.91■■■■□ 3.66
SLC39A13-210ENST00000531419 CHD1O14646 1710 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC39A13-210ENST00000531419 FBLN2P98095 1184 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC39A13-210ENST00000531419 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.8■■■■□ 3.64
SLC39A13-210ENST00000531419 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.79■■■■□ 3.64
SLC39A13-210ENST00000531419 GRIN2BQ13224 1484 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC39A13-210ENST00000531419 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC39A13-210ENST00000531419 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 TOP2BQ02880 1626 aa37.73■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.73■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.72■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 SYNJ1O43426 1573 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC39A13-210ENST00000531419 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
SLC39A13-210ENST00000531419 ARHGEF11O15085 1522 aa37.66■■■■□ 3.62
SLC39A13-210ENST00000531419 PBRM1Q86U86 1689 aa37.65■■■■□ 3.62
SLC39A13-210ENST00000531419 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.65■■■■□ 3.62
SLC39A13-210ENST00000531419 SYNJ2O15056 1496 aa37.6■■■■□ 3.61
SLC39A13-210ENST00000531419 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.46■■■■□ 3.59
SLC39A13-210ENST00000531419 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.35■■■■□ 3.57
SLC39A13-210ENST00000531419 ADAMTS12P58397 1594 aa37.34■■■■□ 3.57
SLC39A13-210ENST00000531419 ARAP1Q96P48 1450 aa37.32■■■■□ 3.56
SLC39A13-210ENST00000531419 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.31■■■■□ 3.56
SLC39A13-210ENST00000531419 GRIN2AQ12879 1464 aa37.3■■■■□ 3.56
SLC39A13-210ENST00000531419 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.27■■■■□ 3.56
SLC39A13-210ENST00000531419 NUP160Q12769 1436 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC39A13-210ENST00000531419 CEP170Q5SW79 1584 aa37.12■■■■□ 3.53
SLC39A13-210ENST00000531419 KIF27Q86VH2 1401 aa37.05■■■■□ 3.52
SLC39A13-210ENST00000531419 IGF1RP08069 1367 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC39A13-210ENST00000531419 SHROOM2Q13796 1616 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC39A13-210ENST00000531419 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.9■■■■□ 3.5
SLC39A13-210ENST00000531419 CUL7Q14999 1698 aa36.87■■■■□ 3.49
SLC39A13-210ENST00000531419 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
SLC39A13-210ENST00000531419 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.8■■■■□ 3.48
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