RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528026.5

TM7SF2-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF2, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-211ENST00000528026 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.26■■■■■ 5.16
TM7SF2-211ENST00000528026 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.08■■■■■ 4.33
TM7SF2-211ENST00000528026 ABCC9O60706 1549 aa41.34■■■■■ 4.21
TM7SF2-211ENST00000528026 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
TM7SF2-211ENST00000528026 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.62■■■■□ 3.93
TM7SF2-211ENST00000528026 NACADO15069 1562 aa39.58■■■■□ 3.93
TM7SF2-211ENST00000528026 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
TM7SF2-211ENST00000528026 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.25■■■■□ 3.87
TM7SF2-211ENST00000528026 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.06■■■■□ 3.84
TM7SF2-211ENST00000528026 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.79■■■■□ 3.8
TM7SF2-211ENST00000528026 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.6■■■■□ 3.77
TM7SF2-211ENST00000528026 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.47■■■■□ 3.75
TM7SF2-211ENST00000528026 SCRIBQ14160 1630 aa38.45■■■■□ 3.75
TM7SF2-211ENST00000528026 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.08■■■■□ 3.69
TM7SF2-211ENST00000528026 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.02■■■■□ 3.68
TM7SF2-211ENST00000528026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
TM7SF2-211ENST00000528026 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.37■■■■□ 3.57
TM7SF2-211ENST00000528026 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.13■■■■□ 3.54
TM7SF2-211ENST00000528026 SMARCA4P51532 1647 aa36.72■■■■□ 3.47
TM7SF2-211ENST00000528026 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
TM7SF2-211ENST00000528026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.53■■■■□ 3.44
TM7SF2-211ENST00000528026 NCAPD3P42695 1498 aa36.5■■■■□ 3.43
TM7SF2-211ENST00000528026 SMARCA2P51531 1590 aa36.49■■■■□ 3.43
TM7SF2-211ENST00000528026 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.44■■■■□ 3.42
TM7SF2-211ENST00000528026 HMGXB3Q12766 1538 aa36.34■■■■□ 3.41
TM7SF2-211ENST00000528026 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.32■■■■□ 3.4
TM7SF2-211ENST00000528026 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
TM7SF2-211ENST00000528026 WIZO95785 1651 aa36.07■■■■□ 3.36
TM7SF2-211ENST00000528026 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
TM7SF2-211ENST00000528026 NESP48681 1621 aa35.72■■■■□ 3.31
TM7SF2-211ENST00000528026 ERCC6Q03468 1493 aa35.66■■■■□ 3.3
TM7SF2-211ENST00000528026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
TM7SF2-211ENST00000528026 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.59■■■■□ 3.29
TM7SF2-211ENST00000528026 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.46■■■■□ 3.27
TM7SF2-211ENST00000528026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.36■■■■□ 3.25
TM7SF2-211ENST00000528026 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.31■■■■□ 3.24
TM7SF2-211ENST00000528026 CUX2O14529 1486 aa35.27■■■■□ 3.24
TM7SF2-211ENST00000528026 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.23■■■■□ 3.23
TM7SF2-211ENST00000528026 CFTRP13569 1480 aa35.22■■■■□ 3.23
TM7SF2-211ENST00000528026 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
TM7SF2-211ENST00000528026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.08■■■■□ 3.21
TM7SF2-211ENST00000528026 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.05■■■■□ 3.2
TM7SF2-211ENST00000528026 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TM7SF2-211ENST00000528026 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.02■■■■□ 3.2
TM7SF2-211ENST00000528026 PRDM2Q13029 1718 aa34.98■■■■□ 3.19
TM7SF2-211ENST00000528026 WDR62O43379 1518 aa34.9■■■■□ 3.18
TM7SF2-211ENST00000528026 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
TM7SF2-211ENST00000528026 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.73■■■■□ 3.15
TM7SF2-211ENST00000528026 TOPBP1Q92547 1522 aa34.5■■■■□ 3.11
TM7SF2-211ENST00000528026 ABCC8Q09428 1581 aa34.46■■■■□ 3.11
TM7SF2-211ENST00000528026 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.45■■■■□ 3.11
TM7SF2-211ENST00000528026 IFT140Q96RY7 1462 aa34.3■■■■□ 3.08
TM7SF2-211ENST00000528026 CUX1P39880 1505 aa34.2■■■■□ 3.07
TM7SF2-211ENST00000528026 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
TM7SF2-211ENST00000528026 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
TM7SF2-211ENST00000528026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
TM7SF2-211ENST00000528026 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.11■■■■□ 3.05
TM7SF2-211ENST00000528026 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.07■■■■□ 3.04
TM7SF2-211ENST00000528026 SOGA1O94964 1423 aa34.05■■■■□ 3.04
TM7SF2-211ENST00000528026 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
TM7SF2-211ENST00000528026 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.038e-6■■■■□ 23.2
TM7SF2-211ENST00000528026 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.93■■■■□ 3.025e-6■■■■■ 29.2
TM7SF2-211ENST00000528026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
TM7SF2-211ENST00000528026 SYNJ1O43426 1573 aa33.87■■■■□ 3.01
TM7SF2-211ENST00000528026 TOP2BQ02880 1626 aa33.86■■■■□ 3.01
TM7SF2-211ENST00000528026 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.86■■■■□ 3.01
TM7SF2-211ENST00000528026 WDR97A6NE52 1622 aa33.82■■■■□ 3.01
TM7SF2-211ENST00000528026 OSCARQ8IYS5 282 aa33.78■■■■□ 3
TM7SF2-211ENST00000528026 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.74■■■□□ 2.99
TM7SF2-211ENST00000528026 GRIN2BQ13224 1484 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-211ENST00000528026 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-211ENST00000528026 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-211ENST00000528026 CHD1O14646 1710 aa33.65■■■□□ 2.98
TM7SF2-211ENST00000528026 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.64■■■□□ 2.98
TM7SF2-211ENST00000528026 FBLN2P98095 1184 aa33.63■■■□□ 2.97
TM7SF2-211ENST00000528026 PBRM1Q86U86 1689 aa33.63■■■□□ 2.97
TM7SF2-211ENST00000528026 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
TM7SF2-211ENST00000528026 TRIM41Q8WV44 630 aa33.49■■■□□ 2.95
TM7SF2-211ENST00000528026 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
TM7SF2-211ENST00000528026 SYNJ2O15056 1496 aa33.47■■■□□ 2.95
TM7SF2-211ENST00000528026 ADAMTS12P58397 1594 aa33.34■■■□□ 2.93
TM7SF2-211ENST00000528026 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.34■■■□□ 2.93
TM7SF2-211ENST00000528026 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.29■■■□□ 2.92
TM7SF2-211ENST00000528026 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.29■■■□□ 2.92
TM7SF2-211ENST00000528026 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.29■■■□□ 2.92
TM7SF2-211ENST00000528026 ARHGEF11O15085 1522 aa33.26■■■□□ 2.91
TM7SF2-211ENST00000528026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.26■■■□□ 2.91
TM7SF2-211ENST00000528026 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.25■■■□□ 2.91
TM7SF2-211ENST00000528026 GRIN2AQ12879 1464 aa33.24■■■□□ 2.91
TM7SF2-211ENST00000528026 KIF27Q86VH2 1401 aa33.23■■■□□ 2.91
TM7SF2-211ENST00000528026 CEP170Q5SW79 1584 aa33.09■■■□□ 2.89
TM7SF2-211ENST00000528026 IGF1RP08069 1367 aa33.09■■■□□ 2.89
TM7SF2-211ENST00000528026 NUP160Q12769 1436 aa33.08■■■□□ 2.89
TM7SF2-211ENST00000528026 CUL7Q14999 1698 aa33.04■■■□□ 2.88
TM7SF2-211ENST00000528026 ARAP1Q96P48 1450 aa32.99■■■□□ 2.87
TM7SF2-211ENST00000528026 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.97■■■□□ 2.87
TM7SF2-211ENST00000528026 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.91■■■□□ 2.86
TM7SF2-211ENST00000528026 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.91■■■□□ 2.86
TM7SF2-211ENST00000528026 SHROOM2Q13796 1616 aa32.84■■■□□ 2.85
TM7SF2-211ENST00000528026 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.81■■■□□ 2.84
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