RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527763.5

CRACR2B-205, Transcript of calcium release activated channel regulator 2B, humanhuman

TSL 2

Gene CRACR2B, Length 1,728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2B-205ENST00000527763 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.26■■■■■ 8.04
CRACR2B-205ENST00000527763 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.34■■■■■ 6.77
CRACR2B-205ENST00000527763 ABCC9O60706 1549 aa55.34■■■■■ 6.45
CRACR2B-205ENST00000527763 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.57■■■■■ 6.33
CRACR2B-205ENST00000527763 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.3■■■■■ 6.28
CRACR2B-205ENST00000527763 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.96■■■■■ 6.23
CRACR2B-205ENST00000527763 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.78■■■■■ 6.2
CRACR2B-205ENST00000527763 NACADO15069 1562 aa53.76■■■■■ 6.2
CRACR2B-205ENST00000527763 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.54■■■■■ 6.16
CRACR2B-205ENST00000527763 SCRIBQ14160 1630 aa52.58■■■■■ 6.01
CRACR2B-205ENST00000527763 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.4■■■■■ 5.98
CRACR2B-205ENST00000527763 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.33■■■■■ 5.97
CRACR2B-205ENST00000527763 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.04■■■■■ 5.92
CRACR2B-205ENST00000527763 BICRAQ9NZM4 1560 aa52■■■■■ 5.91
CRACR2B-205ENST00000527763 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.84■■■■■ 5.73
CRACR2B-205ENST00000527763 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.5■■■■■ 5.67
CRACR2B-205ENST00000527763 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.44■■■■■ 5.67
CRACR2B-205ENST00000527763 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.38■■■■■ 5.66
CRACR2B-205ENST00000527763 SMARCA4P51532 1647 aa50.36■■■■■ 5.65
CRACR2B-205ENST00000527763 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.21■■■■■ 5.63
CRACR2B-205ENST00000527763 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.04■■■■■ 5.6
CRACR2B-205ENST00000527763 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.03■■■■■ 5.6
CRACR2B-205ENST00000527763 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.9■■■■■ 5.58
CRACR2B-205ENST00000527763 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.88■■■■■ 5.57
CRACR2B-205ENST00000527763 WIZO95785 1651 aa49.84■■■■■ 5.57
CRACR2B-205ENST00000527763 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.83■■■■■ 5.57
CRACR2B-205ENST00000527763 SMARCA2P51531 1590 aa49.78■■■■■ 5.56
CRACR2B-205ENST00000527763 NCAPD3P42695 1498 aa49.69■■■■■ 5.55
CRACR2B-205ENST00000527763 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.5■■■■■ 5.51
CRACR2B-205ENST00000527763 HMGXB3Q12766 1538 aa49.44■■■■■ 5.5
CRACR2B-205ENST00000527763 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
CRACR2B-205ENST00000527763 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.86■■■■■ 5.41
CRACR2B-205ENST00000527763 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.34■■■■■ 5.33
CRACR2B-205ENST00000527763 CFTRP13569 1480 aa48.25■■■■■ 5.31
CRACR2B-205ENST00000527763 NESP48681 1621 aa48.24■■■■■ 5.31
CRACR2B-205ENST00000527763 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.1■■■■■ 5.29
CRACR2B-205ENST00000527763 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.81■■■■■ 5.24
CRACR2B-205ENST00000527763 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.75■■■■■ 5.23
CRACR2B-205ENST00000527763 PRDM2Q13029 1718 aa47.72■■■■■ 5.23
CRACR2B-205ENST00000527763 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.54■■■■■ 5.2
CRACR2B-205ENST00000527763 ERCC6Q03468 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
CRACR2B-205ENST00000527763 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.53■■■■■ 5.2
CRACR2B-205ENST00000527763 ABCC8Q09428 1581 aa47.38■■■■■ 5.18
CRACR2B-205ENST00000527763 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.27■■■■■ 5.16
CRACR2B-205ENST00000527763 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.24■■■■■ 5.15
CRACR2B-205ENST00000527763 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
CRACR2B-205ENST00000527763 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.19■■■■■ 5.14
CRACR2B-205ENST00000527763 CUX1P39880 1505 aa47.16■■■■■ 5.14
CRACR2B-205ENST00000527763 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
CRACR2B-205ENST00000527763 TOPBP1Q92547 1522 aa47.1■■■■■ 5.13
CRACR2B-205ENST00000527763 SYNJ1O43426 1573 aa47.07■■■■■ 5.12
CRACR2B-205ENST00000527763 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.06■■■■■ 5.12
CRACR2B-205ENST00000527763 WDR62O43379 1518 aa47.04■■■■■ 5.12
CRACR2B-205ENST00000527763 TRIM41Q8WV44 630 aa46.99■■■■■ 5.11
CRACR2B-205ENST00000527763 TOP2BQ02880 1626 aa46.97■■■■■ 5.11
CRACR2B-205ENST00000527763 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.91■■■■■ 5.1
CRACR2B-205ENST00000527763 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.83■■■■■ 5.09
CRACR2B-205ENST00000527763 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
CRACR2B-205ENST00000527763 CUX2O14529 1486 aa46.69■■■■■ 5.07
CRACR2B-205ENST00000527763 SOGA1O94964 1423 aa46.66■■■■■ 5.06
CRACR2B-205ENST00000527763 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.65■■■■■ 5.06
CRACR2B-205ENST00000527763 IFT140Q96RY7 1462 aa46.5■■■■■ 5.03
CRACR2B-205ENST00000527763 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
CRACR2B-205ENST00000527763 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.4■■■■■ 5.02
CRACR2B-205ENST00000527763 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
CRACR2B-205ENST00000527763 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
CRACR2B-205ENST00000527763 WDR97A6NE52 1622 aa46.26■■■■■ 5
CRACR2B-205ENST00000527763 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.24■■■■■ 4.99
CRACR2B-205ENST00000527763 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.21■■■■■ 4.992e-7■■■■□ 23.9
CRACR2B-205ENST00000527763 KIF27Q86VH2 1401 aa46.17■■■■■ 4.98
CRACR2B-205ENST00000527763 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.09■■■■■ 4.97
CRACR2B-205ENST00000527763 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
CRACR2B-205ENST00000527763 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.06■■■■■ 4.96
CRACR2B-205ENST00000527763 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
CRACR2B-205ENST00000527763 IGF1RP08069 1367 aa45.97■■■■■ 4.95
CRACR2B-205ENST00000527763 EEA1Q15075 1411 aa45.94■■■■■ 4.95
CRACR2B-205ENST00000527763 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.91■■■■■ 4.94
CRACR2B-205ENST00000527763 GRIN2BQ13224 1484 aa45.91■■■■■ 4.94
CRACR2B-205ENST00000527763 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.82■■■■■ 4.92
CRACR2B-205ENST00000527763 PBRM1Q86U86 1689 aa45.78■■■■■ 4.92
CRACR2B-205ENST00000527763 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.71■■■■■ 4.91
CRACR2B-205ENST00000527763 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.67■■■■■ 4.9
CRACR2B-205ENST00000527763 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
CRACR2B-205ENST00000527763 PRXQ9BXM0 1461 aa45.6■■■■■ 4.89
CRACR2B-205ENST00000527763 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.59■■■■■ 4.89
CRACR2B-205ENST00000527763 ADAMTS12P58397 1594 aa45.53■■■■■ 4.88
CRACR2B-205ENST00000527763 CUL7Q14999 1698 aa45.53■■■■■ 4.88
CRACR2B-205ENST00000527763 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
CRACR2B-205ENST00000527763 SYNJ2O15056 1496 aa45.48■■■■■ 4.87
CRACR2B-205ENST00000527763 FBLN2P98095 1184 aa45.47■■■■■ 4.87
CRACR2B-205ENST00000527763 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.46■■■■■ 4.87
CRACR2B-205ENST00000527763 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.45■■■■■ 4.87
CRACR2B-205ENST00000527763 KIF21BO75037 1637 aa45.36■■■■■ 4.85
CRACR2B-205ENST00000527763 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.35■■■■■ 4.85
CRACR2B-205ENST00000527763 GRIN2AQ12879 1464 aa45.32■■■■■ 4.85
CRACR2B-205ENST00000527763 GOLGA3Q08378 1498 aa45.24■■■■■ 4.83
CRACR2B-205ENST00000527763 CHD1O14646 1710 aa45.21■■■■■ 4.83
CRACR2B-205ENST00000527763 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
CRACR2B-205ENST00000527763 NUP160Q12769 1436 aa45.1■■■■■ 4.81
CRACR2B-205ENST00000527763 CEP170Q5SW79 1584 aa45.06■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms