RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527749.5

RELA-211, Transcript of RELA proto-oncogene, NF-kB subunit, humanhuman

TSL 5

Gene RELA, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELA-211ENST00000527749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.73■■■■■ 8.27
RELA-211ENST00000527749 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.21■■■■■ 7.07
RELA-211ENST00000527749 ABCC9O60706 1549 aa57.85■■■■■ 6.85
RELA-211ENST00000527749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.69■■■■■ 6.51
RELA-211ENST00000527749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.65■■■■■ 6.5
RELA-211ENST00000527749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.63■■■■■ 6.5
RELA-211ENST00000527749 NACADO15069 1562 aa55.62■■■■■ 6.49
RELA-211ENST00000527749 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.31■■■■■ 6.45
RELA-211ENST00000527749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.16■■■■■ 6.42
RELA-211ENST00000527749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.46■■■■■ 6.31
RELA-211ENST00000527749 SCRIBQ14160 1630 aa54.13■■■■■ 6.26
RELA-211ENST00000527749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.1■■■■■ 6.25
RELA-211ENST00000527749 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.03■■■■■ 6.24
RELA-211ENST00000527749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.36■■■■■ 6.13
RELA-211ENST00000527749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.96■■■■■ 6.07
RELA-211ENST00000527749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.55■■■■■ 6
RELA-211ENST00000527749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.31■■■■■ 5.96
RELA-211ENST00000527749 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.02■■■■■ 5.92
RELA-211ENST00000527749 SMARCA4P51532 1647 aa51.75■■■■■ 5.88
RELA-211ENST00000527749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.68■■■■■ 5.86
RELA-211ENST00000527749 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.47■■■■■ 5.83
RELA-211ENST00000527749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.42■■■■■ 5.82
RELA-211ENST00000527749 SMARCA2P51531 1590 aa51.33■■■■■ 5.81
RELA-211ENST00000527749 NCAPD3P42695 1498 aa51.33■■■■■ 5.81
RELA-211ENST00000527749 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.2■■■■■ 5.79
RELA-211ENST00000527749 HMGXB3Q12766 1538 aa51.1■■■■■ 5.77
RELA-211ENST00000527749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51■■■■■ 5.75
RELA-211ENST00000527749 WIZO95785 1651 aa50.93■■■■■ 5.74
RELA-211ENST00000527749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.92■■■■■ 5.74
RELA-211ENST00000527749 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.36■■■■■ 5.65
RELA-211ENST00000527749 NESP48681 1621 aa50.14■■■■■ 5.62
RELA-211ENST00000527749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.94■■■■■ 5.59
RELA-211ENST00000527749 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.85■■■■■ 5.57
RELA-211ENST00000527749 ERCC6Q03468 1493 aa49.81■■■■■ 5.56
RELA-211ENST00000527749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
RELA-211ENST00000527749 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.78■■■■■ 5.56
RELA-211ENST00000527749 CFTRP13569 1480 aa49.6■■■■■ 5.53
RELA-211ENST00000527749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.6■■■■■ 5.53
RELA-211ENST00000527749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.52■■■■■ 5.52
RELA-211ENST00000527749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
RELA-211ENST00000527749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.31■■■■■ 5.48
RELA-211ENST00000527749 PRDM2Q13029 1718 aa49.24■■■■■ 5.47
RELA-211ENST00000527749 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.22■■■■■ 5.47
RELA-211ENST00000527749 CUX2O14529 1486 aa49.18■■■■■ 5.46
RELA-211ENST00000527749 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.12■■■■■ 5.45
RELA-211ENST00000527749 WDR62O43379 1518 aa48.95■■■■■ 5.43
RELA-211ENST00000527749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
RELA-211ENST00000527749 TOPBP1Q92547 1522 aa48.55■■■■■ 5.36
RELA-211ENST00000527749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.5■■■■■ 5.35
RELA-211ENST00000527749 ABCC8Q09428 1581 aa48.47■■■■■ 5.35
RELA-211ENST00000527749 CUX1P39880 1505 aa48.27■■■■■ 5.32
RELA-211ENST00000527749 IFT140Q96RY7 1462 aa48.16■■■■■ 5.3
RELA-211ENST00000527749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.16■■■■■ 5.3
RELA-211ENST00000527749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.07■■■■■ 5.29
RELA-211ENST00000527749 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
RELA-211ENST00000527749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48■■■■■ 5.27
RELA-211ENST00000527749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.99■■■■■ 5.27
RELA-211ENST00000527749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.97■■■■■ 5.27
RELA-211ENST00000527749 SOGA1O94964 1423 aa47.93■■■■■ 5.26
RELA-211ENST00000527749 SYNJ1O43426 1573 aa47.91■■■■■ 5.26
RELA-211ENST00000527749 TOP2BQ02880 1626 aa47.87■■■■■ 5.25
RELA-211ENST00000527749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.87■■■■■ 5.25
RELA-211ENST00000527749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.79■■■■■ 5.24
RELA-211ENST00000527749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.73■■■■■ 5.231e-9■■■■■ 32.8
RELA-211ENST00000527749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
RELA-211ENST00000527749 WDR97A6NE52 1622 aa47.67■■■■■ 5.22
RELA-211ENST00000527749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.58■■■■■ 5.21
RELA-211ENST00000527749 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.48■■■■■ 5.19
RELA-211ENST00000527749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.4■■■■■ 5.18
RELA-211ENST00000527749 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.4■■■■■ 5.18
RELA-211ENST00000527749 GRIN2BQ13224 1484 aa47.35■■■■■ 5.17
RELA-211ENST00000527749 PBRM1Q86U86 1689 aa47.3■■■■■ 5.16
RELA-211ENST00000527749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.3■■■■■ 5.16
RELA-211ENST00000527749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
RELA-211ENST00000527749 OSCARQ8IYS5 282 aa47.18■■■■■ 5.14
RELA-211ENST00000527749 CHD1O14646 1710 aa47.17■■■■■ 5.14
RELA-211ENST00000527749 FBLN2P98095 1184 aa47.11■■■■■ 5.13
RELA-211ENST00000527749 SYNJ2O15056 1496 aa47.02■■■■■ 5.12
RELA-211ENST00000527749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47■■■■■ 5.12
RELA-211ENST00000527749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
RELA-211ENST00000527749 TRIM41Q8WV44 630 aa46.96■■■■■ 5.11
RELA-211ENST00000527749 KIF27Q86VH2 1401 aa46.96■■■■■ 5.11
RELA-211ENST00000527749 ADAMTS12P58397 1594 aa46.94■■■■■ 5.11
RELA-211ENST00000527749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.84■■■■■ 5.09
RELA-211ENST00000527749 IGF1RP08069 1367 aa46.76■■■■■ 5.08
RELA-211ENST00000527749 GRIN2AQ12879 1464 aa46.76■■■■■ 5.08
RELA-211ENST00000527749 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.68■■■■■ 5.06
RELA-211ENST00000527749 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.64■■■■■ 5.06
RELA-211ENST00000527749 CUL7Q14999 1698 aa46.61■■■■■ 5.05
RELA-211ENST00000527749 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.56■■■■■ 5.04
RELA-211ENST00000527749 CEP170Q5SW79 1584 aa46.55■■■■■ 5.04
RELA-211ENST00000527749 NUP160Q12769 1436 aa46.54■■■■■ 5.04
RELA-211ENST00000527749 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.49■■■■■ 5.03
RELA-211ENST00000527749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.46■■■■■ 5.03
RELA-211ENST00000527749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.46■■■■■ 5.03
RELA-211ENST00000527749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.46■■■■■ 5.03
RELA-211ENST00000527749 ARHGEF11O15085 1522 aa46.46■■■■■ 5.03
RELA-211ENST00000527749 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.22■■■■■ 4.99
RELA-211ENST00000527749 SHROOM2Q13796 1616 aa46.17■■■■■ 4.98
RELA-211ENST00000527749 EEA1Q15075 1411 aa46.14■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms