RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527089.5

CRACR2B-204, Transcript of calcium release activated channel regulator 2B, humanhuman

TSL 3

Gene CRACR2B, Length 824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2B-204ENST00000527089 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.13■■■■■ 6.58
CRACR2B-204ENST00000527089 ABCC9O60706 1549 aa51.31■■■■■ 5.8
CRACR2B-204ENST00000527089 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.73■■■■■ 5.71
CRACR2B-204ENST00000527089 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.72■■■■■ 5.39
CRACR2B-204ENST00000527089 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.59■■■■■ 5.37
CRACR2B-204ENST00000527089 NACADO15069 1562 aa48.1■■■■■ 5.29
CRACR2B-204ENST00000527089 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.59■■■■■ 5.21
CRACR2B-204ENST00000527089 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.5■■■■■ 5.2
CRACR2B-204ENST00000527089 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.48■■■■■ 5.19
CRACR2B-204ENST00000527089 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.25■■■■■ 5.15
CRACR2B-204ENST00000527089 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.22■■■■■ 5.15
CRACR2B-204ENST00000527089 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.57■■■■■ 5.05
CRACR2B-204ENST00000527089 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
CRACR2B-204ENST00000527089 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.37■■■■■ 5.01
CRACR2B-204ENST00000527089 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.36■■■■■ 5.01
CRACR2B-204ENST00000527089 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.32■■■■■ 5.01
CRACR2B-204ENST00000527089 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
CRACR2B-204ENST00000527089 SCRIBQ14160 1630 aa46.1■■■■■ 4.97
CRACR2B-204ENST00000527089 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.29■■■■■ 4.84
CRACR2B-204ENST00000527089 CUX2O14529 1486 aa44.59■■■■■ 4.73
CRACR2B-204ENST00000527089 NCAPD3P42695 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
CRACR2B-204ENST00000527089 ERCC6Q03468 1493 aa44.35■■■■■ 4.69
CRACR2B-204ENST00000527089 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.15■■■■■ 4.66
CRACR2B-204ENST00000527089 HMGXB3Q12766 1538 aa44.04■■■■■ 4.64
CRACR2B-204ENST00000527089 SMARCA2P51531 1590 aa44.01■■■■■ 4.64
CRACR2B-204ENST00000527089 SMARCA4P51532 1647 aa43.95■■■■■ 4.63
CRACR2B-204ENST00000527089 NESP48681 1621 aa43.88■■■■■ 4.62
CRACR2B-204ENST00000527089 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
CRACR2B-204ENST00000527089 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
CRACR2B-204ENST00000527089 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
CRACR2B-204ENST00000527089 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.57■■■■■ 4.57
CRACR2B-204ENST00000527089 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.53■■■■■ 4.56
CRACR2B-204ENST00000527089 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.33■■■■■ 4.53
CRACR2B-204ENST00000527089 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.25■■■■■ 4.51
CRACR2B-204ENST00000527089 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.21■■■■■ 4.51
CRACR2B-204ENST00000527089 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.98■■■■■ 4.47
CRACR2B-204ENST00000527089 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.95■■■■■ 4.47
CRACR2B-204ENST00000527089 TRIM41Q8WV44 630 aa42.93■■■■■ 4.46
CRACR2B-204ENST00000527089 WDR62O43379 1518 aa42.91■■■■■ 4.46
CRACR2B-204ENST00000527089 WIZO95785 1651 aa42.66■■■■■ 4.42
CRACR2B-204ENST00000527089 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.62■■■■■ 4.41
CRACR2B-204ENST00000527089 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.5■■■■■ 4.39
CRACR2B-204ENST00000527089 CFTRP13569 1480 aa42.38■■■■■ 4.38
CRACR2B-204ENST00000527089 OSCARQ8IYS5 282 aa42.33■■■■■ 4.37
CRACR2B-204ENST00000527089 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
CRACR2B-204ENST00000527089 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CRACR2B-204ENST00000527089 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
CRACR2B-204ENST00000527089 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
CRACR2B-204ENST00000527089 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
CRACR2B-204ENST00000527089 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
CRACR2B-204ENST00000527089 PRDM2Q13029 1718 aa41.93■■■■■ 4.3
CRACR2B-204ENST00000527089 IFT140Q96RY7 1462 aa41.8■■■■■ 4.28
CRACR2B-204ENST00000527089 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CRACR2B-204ENST00000527089 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
CRACR2B-204ENST00000527089 TOPBP1Q92547 1522 aa41.63■■■■■ 4.25
CRACR2B-204ENST00000527089 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.59■■■■■ 4.25
CRACR2B-204ENST00000527089 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
CRACR2B-204ENST00000527089 ABCC8Q09428 1581 aa41.5■■■■■ 4.23
CRACR2B-204ENST00000527089 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.43■■■■■ 4.22
CRACR2B-204ENST00000527089 CHD1O14646 1710 aa41.38■■■■■ 4.21
CRACR2B-204ENST00000527089 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.36■■■■■ 4.21
CRACR2B-204ENST00000527089 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CRACR2B-204ENST00000527089 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
CRACR2B-204ENST00000527089 ARAP1Q96P48 1450 aa41.28■■■■■ 4.2
CRACR2B-204ENST00000527089 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
CRACR2B-204ENST00000527089 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
CRACR2B-204ENST00000527089 FBLN2P98095 1184 aa41.08■■■■■ 4.17
CRACR2B-204ENST00000527089 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.98■■■■■ 4.15
CRACR2B-204ENST00000527089 WDR97A6NE52 1622 aa40.92■■■■■ 4.14
CRACR2B-204ENST00000527089 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.92■■■■■ 4.14
CRACR2B-204ENST00000527089 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CRACR2B-204ENST00000527089 SOGA1O94964 1423 aa40.91■■■■■ 4.14
CRACR2B-204ENST00000527089 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.89■■■■■ 4.14
CRACR2B-204ENST00000527089 SYNJ1O43426 1573 aa40.8■■■■■ 4.12
CRACR2B-204ENST00000527089 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.79■■■■■ 4.12
CRACR2B-204ENST00000527089 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
CRACR2B-204ENST00000527089 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CRACR2B-204ENST00000527089 GRIN2BQ13224 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
CRACR2B-204ENST00000527089 CUX1P39880 1505 aa40.66■■■■■ 4.1
CRACR2B-204ENST00000527089 SYNJ2O15056 1496 aa40.64■■■■■ 4.1
CRACR2B-204ENST00000527089 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
CRACR2B-204ENST00000527089 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.47■■■■■ 4.07
CRACR2B-204ENST00000527089 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
CRACR2B-204ENST00000527089 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.34■■■■■ 4.05
CRACR2B-204ENST00000527089 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.32■■■■■ 4.04
CRACR2B-204ENST00000527089 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.18■■■■■ 4.02
CRACR2B-204ENST00000527089 GRIN2AQ12879 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
CRACR2B-204ENST00000527089 ADAMTS12P58397 1594 aa40.09■■■■■ 4.01
CRACR2B-204ENST00000527089 NUP160Q12769 1436 aa40.08■■■■■ 4.01
CRACR2B-204ENST00000527089 CEP170Q5SW79 1584 aa40.08■■■■■ 4.01
CRACR2B-204ENST00000527089 SHROOM2Q13796 1616 aa40.01■■■■■ 4
CRACR2B-204ENST00000527089 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
CRACR2B-204ENST00000527089 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.9■■■■□ 3.98
CRACR2B-204ENST00000527089 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.85■■■■□ 3.97
CRACR2B-204ENST00000527089 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.84■■■■□ 3.97
CRACR2B-204ENST00000527089 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
CRACR2B-204ENST00000527089 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.8■■■■□ 3.96
CRACR2B-204ENST00000527089 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
CRACR2B-204ENST00000527089 JPH4Q96JJ6 628 aa39.56■■■■□ 3.92
CRACR2B-204ENST00000527089 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.55■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 276.2 ms