RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525695.5

EEF1D-212, Transcript of eukaryotic translation elongation factor 1 delta, humanhuman

TSL 5

Gene EEF1D, Length 907 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1D-212ENST00000525695 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.05■■■■■ 6.4
EEF1D-212ENST00000525695 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.96■■■■■ 5.43
EEF1D-212ENST00000525695 ABCC9O60706 1549 aa48.21■■■■■ 5.31
EEF1D-212ENST00000525695 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.2■■■■■ 4.99
EEF1D-212ENST00000525695 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.11■■■■■ 4.97
EEF1D-212ENST00000525695 NACADO15069 1562 aa46.08■■■■■ 4.97
EEF1D-212ENST00000525695 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
EEF1D-212ENST00000525695 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.71■■■■■ 4.91
EEF1D-212ENST00000525695 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.47■■■■■ 4.87
EEF1D-212ENST00000525695 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.09■■■■■ 4.81
EEF1D-212ENST00000525695 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.04■■■■■ 4.8
EEF1D-212ENST00000525695 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.02■■■■■ 4.81e-10■■□□□ 12.3
EEF1D-212ENST00000525695 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.83■■■■■ 4.77
EEF1D-212ENST00000525695 SCRIBQ14160 1630 aa44.8■■■■■ 4.76
EEF1D-212ENST00000525695 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.29■■■■■ 4.68
EEF1D-212ENST00000525695 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
EEF1D-212ENST00000525695 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.53■■■■■ 4.56
EEF1D-212ENST00000525695 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.3■■■■■ 4.52
EEF1D-212ENST00000525695 SMARCA4P51532 1647 aa42.76■■■■■ 4.44
EEF1D-212ENST00000525695 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
EEF1D-212ENST00000525695 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.57■■■■■ 4.41
EEF1D-212ENST00000525695 NCAPD3P42695 1498 aa42.53■■■■■ 4.4
EEF1D-212ENST00000525695 SMARCA2P51531 1590 aa42.48■■■■■ 4.39
EEF1D-212ENST00000525695 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.47■■■■■ 4.39
EEF1D-212ENST00000525695 HMGXB3Q12766 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
EEF1D-212ENST00000525695 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.3■■■■■ 4.36
EEF1D-212ENST00000525695 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
EEF1D-212ENST00000525695 WIZO95785 1651 aa41.98■■■■■ 4.31
EEF1D-212ENST00000525695 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
EEF1D-212ENST00000525695 NESP48681 1621 aa41.66■■■■■ 4.26
EEF1D-212ENST00000525695 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.66■■■■■ 4.26
EEF1D-212ENST00000525695 ERCC6Q03468 1493 aa41.55■■■■■ 4.24
EEF1D-212ENST00000525695 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
EEF1D-212ENST00000525695 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.43■■■■■ 4.22
EEF1D-212ENST00000525695 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.3■■■■■ 4.2
EEF1D-212ENST00000525695 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.18■■■■■ 4.18
EEF1D-212ENST00000525695 CUX2O14529 1486 aa41.1■■■■■ 4.17
EEF1D-212ENST00000525695 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.1■■■■■ 4.17
EEF1D-212ENST00000525695 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
EEF1D-212ENST00000525695 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.03■■■■■ 4.16
EEF1D-212ENST00000525695 CFTRP13569 1480 aa41.03■■■■■ 4.16
EEF1D-212ENST00000525695 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.88■■■■■ 4.13
EEF1D-212ENST00000525695 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.84■■■■■ 4.13
EEF1D-212ENST00000525695 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.82■■■■■ 4.12
EEF1D-212ENST00000525695 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
EEF1D-212ENST00000525695 WDR62O43379 1518 aa40.67■■■■■ 4.1
EEF1D-212ENST00000525695 PRDM2Q13029 1718 aa40.61■■■■■ 4.09
EEF1D-212ENST00000525695 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
EEF1D-212ENST00000525695 TOPBP1Q92547 1522 aa40.2■■■■■ 4.03
EEF1D-212ENST00000525695 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.12■■■■■ 4.01
EEF1D-212ENST00000525695 ABCC8Q09428 1581 aa40.08■■■■■ 4.01
EEF1D-212ENST00000525695 IFT140Q96RY7 1462 aa39.97■■■■□ 3.99
EEF1D-212ENST00000525695 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
EEF1D-212ENST00000525695 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
EEF1D-212ENST00000525695 CUX1P39880 1505 aa39.85■■■■□ 3.97
EEF1D-212ENST00000525695 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
EEF1D-212ENST00000525695 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
EEF1D-212ENST00000525695 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.71■■■■□ 3.95
EEF1D-212ENST00000525695 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
EEF1D-212ENST00000525695 TRIM41Q8WV44 630 aa39.67■■■■□ 3.94
EEF1D-212ENST00000525695 SOGA1O94964 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
EEF1D-212ENST00000525695 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.6■■■■□ 3.934e-11■■■■■ 58.3
EEF1D-212ENST00000525695 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.52■■■■□ 3.922e-6■■■□□ 16.6
EEF1D-212ENST00000525695 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
EEF1D-212ENST00000525695 SYNJ1O43426 1573 aa39.46■■■■□ 3.91
EEF1D-212ENST00000525695 TOP2BQ02880 1626 aa39.42■■■■□ 3.9
EEF1D-212ENST00000525695 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.4■■■■□ 3.9
EEF1D-212ENST00000525695 WDR97A6NE52 1622 aa39.38■■■■□ 3.89
EEF1D-212ENST00000525695 OSCARQ8IYS5 282 aa39.34■■■■□ 3.89
EEF1D-212ENST00000525695 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.31■■■■□ 3.88
EEF1D-212ENST00000525695 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.25■■■■□ 3.87
EEF1D-212ENST00000525695 GRIN2BQ13224 1484 aa39.23■■■■□ 3.87
EEF1D-212ENST00000525695 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.2■■■■□ 3.87
EEF1D-212ENST00000525695 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.18■■■■□ 3.86
EEF1D-212ENST00000525695 FBLN2P98095 1184 aa39.17■■■■□ 3.86
EEF1D-212ENST00000525695 CHD1O14646 1710 aa39.16■■■■□ 3.86
EEF1D-212ENST00000525695 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
EEF1D-212ENST00000525695 PBRM1Q86U86 1689 aa39.11■■■■□ 3.85
EEF1D-212ENST00000525695 SYNJ2O15056 1496 aa38.99■■■■□ 3.83
EEF1D-212ENST00000525695 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
EEF1D-212ENST00000525695 ADAMTS12P58397 1594 aa38.86■■■■□ 3.81
EEF1D-212ENST00000525695 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.82■■■■□ 3.8
EEF1D-212ENST00000525695 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
EEF1D-212ENST00000525695 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
EEF1D-212ENST00000525695 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
EEF1D-212ENST00000525695 ARHGEF11O15085 1522 aa38.79■■■■□ 3.8
EEF1D-212ENST00000525695 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.77■■■■□ 3.8
EEF1D-212ENST00000525695 GRIN2AQ12879 1464 aa38.74■■■■□ 3.79
EEF1D-212ENST00000525695 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.74■■■■□ 3.79
EEF1D-212ENST00000525695 KIF27Q86VH2 1401 aa38.68■■■■□ 3.78
EEF1D-212ENST00000525695 CEP170Q5SW79 1584 aa38.57■■■■□ 3.77
EEF1D-212ENST00000525695 NUP160Q12769 1436 aa38.55■■■■□ 3.76
EEF1D-212ENST00000525695 IGF1RP08069 1367 aa38.53■■■■□ 3.76
EEF1D-212ENST00000525695 ARAP1Q96P48 1450 aa38.48■■■■□ 3.75
EEF1D-212ENST00000525695 CUL7Q14999 1698 aa38.43■■■■□ 3.74
EEF1D-212ENST00000525695 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.41■■■■□ 3.74
EEF1D-212ENST00000525695 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.33■■■■□ 3.73
EEF1D-212ENST00000525695 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.31■■■■□ 3.72
EEF1D-212ENST00000525695 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.27■■■■□ 3.72
EEF1D-212ENST00000525695 SHROOM2Q13796 1616 aa38.26■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms