RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522456.1

HOXA3-205, Transcript of homeobox A3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA3, Length 503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-205ENST00000522456 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.43■■■■■ 6.14
HOXA3-205ENST00000522456 ABCC9O60706 1549 aa48.05■■■■■ 5.28
HOXA3-205ENST00000522456 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.02■■■■■ 5.28
HOXA3-205ENST00000522456 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.73■■■■■ 4.91
HOXA3-205ENST00000522456 NACADO15069 1562 aa45.39■■■■■ 4.86
HOXA3-205ENST00000522456 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.07■■■■■ 4.81
HOXA3-205ENST00000522456 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.07■■■■■ 4.81
HOXA3-205ENST00000522456 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.75■■■■■ 4.76
HOXA3-205ENST00000522456 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.69■■■■■ 4.74
HOXA3-205ENST00000522456 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.68■■■■■ 4.74
HOXA3-205ENST00000522456 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.38■■■■■ 4.69
HOXA3-205ENST00000522456 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
HOXA3-205ENST00000522456 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.15■■■■■ 4.66
HOXA3-205ENST00000522456 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.83■■■■■ 4.61
HOXA3-205ENST00000522456 SCRIBQ14160 1630 aa43.74■■■■■ 4.59
HOXA3-205ENST00000522456 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.41■■■■■ 4.54
HOXA3-205ENST00000522456 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
HOXA3-205ENST00000522456 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.3■■■■■ 4.52
HOXA3-205ENST00000522456 NCAPD3P42695 1498 aa41.89■■■■■ 4.3
HOXA3-205ENST00000522456 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.76■■■■■ 4.28
HOXA3-205ENST00000522456 SMARCA4P51532 1647 aa41.72■■■■■ 4.27
HOXA3-205ENST00000522456 SMARCA2P51531 1590 aa41.66■■■■■ 4.26
HOXA3-205ENST00000522456 HMGXB3Q12766 1538 aa41.6■■■■■ 4.25
HOXA3-205ENST00000522456 ERCC6Q03468 1493 aa41.51■■■■■ 4.24
HOXA3-205ENST00000522456 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
HOXA3-205ENST00000522456 CUX2O14529 1486 aa41.47■■■■■ 4.23
HOXA3-205ENST00000522456 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.46■■■■■ 4.23
HOXA3-205ENST00000522456 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
HOXA3-205ENST00000522456 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXA3-205ENST00000522456 NESP48681 1621 aa41.26■■■■■ 4.19
HOXA3-205ENST00000522456 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXA3-205ENST00000522456 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXA3-205ENST00000522456 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
HOXA3-205ENST00000522456 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXA3-205ENST00000522456 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXA3-205ENST00000522456 WIZO95785 1651 aa40.67■■■■■ 4.1
HOXA3-205ENST00000522456 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.61■■■■■ 4.09
HOXA3-205ENST00000522456 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.4■■■■■ 4.06
HOXA3-205ENST00000522456 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
HOXA3-205ENST00000522456 WDR62O43379 1518 aa40.31■■■■■ 4.04
HOXA3-205ENST00000522456 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.23■■■■■ 4.03
HOXA3-205ENST00000522456 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
HOXA3-205ENST00000522456 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.17■■■■■ 4.02
HOXA3-205ENST00000522456 CFTRP13569 1480 aa40.14■■■■■ 4.02
HOXA3-205ENST00000522456 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
HOXA3-205ENST00000522456 PRDM2Q13029 1718 aa39.77■■■■□ 3.96
HOXA3-205ENST00000522456 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.69■■■■□ 3.94
HOXA3-205ENST00000522456 TRIM41Q8WV44 630 aa39.63■■■■□ 3.93
HOXA3-205ENST00000522456 OSCARQ8IYS5 282 aa39.5■■■■□ 3.91
HOXA3-205ENST00000522456 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
HOXA3-205ENST00000522456 IFT140Q96RY7 1462 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXA3-205ENST00000522456 TOPBP1Q92547 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
HOXA3-205ENST00000522456 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
HOXA3-205ENST00000522456 ABCC8Q09428 1581 aa39.3■■■■□ 3.88
HOXA3-205ENST00000522456 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.26■■■■□ 3.88
HOXA3-205ENST00000522456 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
HOXA3-205ENST00000522456 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
HOXA3-205ENST00000522456 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.05■■■■□ 3.84
HOXA3-205ENST00000522456 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.05■■■■□ 3.84
HOXA3-205ENST00000522456 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.05■■■■□ 3.84
HOXA3-205ENST00000522456 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
HOXA3-205ENST00000522456 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.83
HOXA3-205ENST00000522456 ARHGEF11O15085 1522 aa38.92■■■■□ 3.82
HOXA3-205ENST00000522456 CHD1O14646 1710 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXA3-205ENST00000522456 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.83■■■■□ 3.81
HOXA3-205ENST00000522456 SOGA1O94964 1423 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXA3-205ENST00000522456 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXA3-205ENST00000522456 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
HOXA3-205ENST00000522456 FBLN2P98095 1184 aa38.72■■■■□ 3.79
HOXA3-205ENST00000522456 CUX1P39880 1505 aa38.69■■■■□ 3.78
HOXA3-205ENST00000522456 WDR97A6NE52 1622 aa38.69■■■■□ 3.78
HOXA3-205ENST00000522456 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.61■■■■□ 3.77
HOXA3-205ENST00000522456 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXA3-205ENST00000522456 ARAP1Q96P48 1450 aa38.54■■■■□ 3.76
HOXA3-205ENST00000522456 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
HOXA3-205ENST00000522456 GRIN2BQ13224 1484 aa38.49■■■■□ 3.75
HOXA3-205ENST00000522456 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXA3-205ENST00000522456 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
HOXA3-205ENST00000522456 SYNJ1O43426 1573 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXA3-205ENST00000522456 SYNJ2O15056 1496 aa38.37■■■■□ 3.73
HOXA3-205ENST00000522456 PBRM1Q86U86 1689 aa38.35■■■■□ 3.73
HOXA3-205ENST00000522456 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXA3-205ENST00000522456 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXA3-205ENST00000522456 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXA3-205ENST00000522456 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
HOXA3-205ENST00000522456 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
HOXA3-205ENST00000522456 TOP2BQ02880 1626 aa38.08■■■■□ 3.69
HOXA3-205ENST00000522456 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.08■■■■□ 3.69
HOXA3-205ENST00000522456 GRIN2AQ12879 1464 aa38■■■■□ 3.67
HOXA3-205ENST00000522456 ADAMTS12P58397 1594 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXA3-205ENST00000522456 NUP160Q12769 1436 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-205ENST00000522456 CEP170Q5SW79 1584 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-205ENST00000522456 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXA3-205ENST00000522456 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXA3-205ENST00000522456 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.81■■■■□ 3.64
HOXA3-205ENST00000522456 SHROOM2Q13796 1616 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXA3-205ENST00000522456 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
HOXA3-205ENST00000522456 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.46■■■■□ 3.59
HOXA3-205ENST00000522456 JPH4Q96JJ6 628 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXA3-205ENST00000522456 KIF27Q86VH2 1401 aa37.36■■■■□ 3.57
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