RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521711.5

ADRA1A-211, Transcript of adrenoceptor alpha 1A, humanhuman

TSL 5

Gene ADRA1A, Length 1,877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADRA1A-211ENST00000521711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.21■■■■■ 5.95
ADRA1A-211ENST00000521711 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.66■■■■■ 4.9
ADRA1A-211ENST00000521711 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
ADRA1A-211ENST00000521711 ABCC9O60706 1549 aa43.37■■■■■ 4.53
ADRA1A-211ENST00000521711 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.25■■■■■ 4.51
ADRA1A-211ENST00000521711 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.12■■■■■ 4.49
ADRA1A-211ENST00000521711 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
ADRA1A-211ENST00000521711 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.53■■■■■ 4.4
ADRA1A-211ENST00000521711 NACADO15069 1562 aa42.53■■■■■ 4.4
ADRA1A-211ENST00000521711 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.24■■■■■ 4.35
ADRA1A-211ENST00000521711 SCRIBQ14160 1630 aa42.01■■■■■ 4.31
ADRA1A-211ENST00000521711 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.54■■■■■ 4.24
ADRA1A-211ENST00000521711 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.99■■■■■ 4.15
ADRA1A-211ENST00000521711 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
ADRA1A-211ENST00000521711 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
ADRA1A-211ENST00000521711 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.62■■■■■ 4.09
ADRA1A-211ENST00000521711 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
ADRA1A-211ENST00000521711 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.36■■■■■ 4.05
ADRA1A-211ENST00000521711 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
ADRA1A-211ENST00000521711 SMARCA4P51532 1647 aa40.22■■■■■ 4.03
ADRA1A-211ENST00000521711 WIZO95785 1651 aa40.08■■■■■ 4.01
ADRA1A-211ENST00000521711 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
ADRA1A-211ENST00000521711 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.68■■■■□ 3.94
ADRA1A-211ENST00000521711 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
ADRA1A-211ENST00000521711 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.56■■■■□ 3.92
ADRA1A-211ENST00000521711 SMARCA2P51531 1590 aa39.54■■■■□ 3.92
ADRA1A-211ENST00000521711 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
ADRA1A-211ENST00000521711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.26■■■■□ 3.88
ADRA1A-211ENST00000521711 NCAPD3P42695 1498 aa39.22■■■■□ 3.87
ADRA1A-211ENST00000521711 HMGXB3Q12766 1538 aa39.18■■■■□ 3.86
ADRA1A-211ENST00000521711 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.18■■■■□ 3.86
ADRA1A-211ENST00000521711 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.91■■■■□ 3.82
ADRA1A-211ENST00000521711 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.42■■■■□ 3.74
ADRA1A-211ENST00000521711 ABCC8Q09428 1581 aa38.35■■■■□ 3.73
ADRA1A-211ENST00000521711 TRIM41Q8WV44 630 aa38.34■■■■□ 3.73
ADRA1A-211ENST00000521711 CFTRP13569 1480 aa38.31■■■■□ 3.72
ADRA1A-211ENST00000521711 PRDM2Q13029 1718 aa38.26■■■■□ 3.72
ADRA1A-211ENST00000521711 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.22■■■■□ 3.71
ADRA1A-211ENST00000521711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.06■■■■□ 3.68
ADRA1A-211ENST00000521711 NESP48681 1621 aa38.03■■■■□ 3.68
ADRA1A-211ENST00000521711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.97■■■■□ 3.67
ADRA1A-211ENST00000521711 SYNJ1O43426 1573 aa37.96■■■■□ 3.67
ADRA1A-211ENST00000521711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.83■■■■□ 3.65
ADRA1A-211ENST00000521711 TOP2BQ02880 1626 aa37.8■■■■□ 3.64
ADRA1A-211ENST00000521711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.79■■■■□ 3.64
ADRA1A-211ENST00000521711 CUX1P39880 1505 aa37.75■■■■□ 3.63
ADRA1A-211ENST00000521711 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
ADRA1A-211ENST00000521711 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.65■■■■□ 3.62
ADRA1A-211ENST00000521711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.64■■■■□ 3.62
ADRA1A-211ENST00000521711 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.61■■■■□ 3.61
ADRA1A-211ENST00000521711 SOGA1O94964 1423 aa37.54■■■■□ 3.6
ADRA1A-211ENST00000521711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.47■■■■□ 3.59
ADRA1A-211ENST00000521711 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.46■■■■□ 3.59
ADRA1A-211ENST00000521711 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.44■■■■□ 3.58
ADRA1A-211ENST00000521711 TOPBP1Q92547 1522 aa37.41■■■■□ 3.58
ADRA1A-211ENST00000521711 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
ADRA1A-211ENST00000521711 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.37■■■■□ 3.57
ADRA1A-211ENST00000521711 EEA1Q15075 1411 aa37.36■■■■□ 3.57
ADRA1A-211ENST00000521711 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.22■■■■□ 3.55
ADRA1A-211ENST00000521711 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.22■■■■□ 3.55
ADRA1A-211ENST00000521711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
ADRA1A-211ENST00000521711 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.2■■■■□ 3.55
ADRA1A-211ENST00000521711 ERCC6Q03468 1493 aa37.19■■■■□ 3.54
ADRA1A-211ENST00000521711 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.11■■■■□ 3.53
ADRA1A-211ENST00000521711 KIF27Q86VH2 1401 aa37.1■■■■□ 3.53
ADRA1A-211ENST00000521711 CUX2O14529 1486 aa37.08■■■■□ 3.53
ADRA1A-211ENST00000521711 WDR62O43379 1518 aa37.02■■■■□ 3.52
ADRA1A-211ENST00000521711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
ADRA1A-211ENST00000521711 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
ADRA1A-211ENST00000521711 WDR97A6NE52 1622 aa36.97■■■■□ 3.51
ADRA1A-211ENST00000521711 KIF21BO75037 1637 aa36.96■■■■□ 3.51
ADRA1A-211ENST00000521711 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
ADRA1A-211ENST00000521711 GOLGA3Q08378 1498 aa36.88■■■■□ 3.49
ADRA1A-211ENST00000521711 PRXQ9BXM0 1461 aa36.79■■■■□ 3.48
ADRA1A-211ENST00000521711 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.79■■■■□ 3.48
ADRA1A-211ENST00000521711 IGF1RP08069 1367 aa36.79■■■■□ 3.48
ADRA1A-211ENST00000521711 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
ADRA1A-211ENST00000521711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.76■■■■□ 3.48
ADRA1A-211ENST00000521711 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
ADRA1A-211ENST00000521711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.72■■■■□ 3.47
ADRA1A-211ENST00000521711 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.7■■■■□ 3.47
ADRA1A-211ENST00000521711 IFT140Q96RY7 1462 aa36.7■■■■□ 3.46
ADRA1A-211ENST00000521711 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.67■■■■□ 3.46
ADRA1A-211ENST00000521711 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.61■■■■□ 3.45
ADRA1A-211ENST00000521711 CUL7Q14999 1698 aa36.58■■■■□ 3.45
ADRA1A-211ENST00000521711 PBRM1Q86U86 1689 aa36.58■■■■□ 3.45
ADRA1A-211ENST00000521711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
ADRA1A-211ENST00000521711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
ADRA1A-211ENST00000521711 CEP162Q5TB80 1403 aa36.53■■■■□ 3.44
ADRA1A-211ENST00000521711 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
ADRA1A-211ENST00000521711 GRIN2BQ13224 1484 aa36.39■■■■□ 3.42
ADRA1A-211ENST00000521711 ADAMTS12P58397 1594 aa36.29■■■■□ 3.4
ADRA1A-211ENST00000521711 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ADRA1A-211ENST00000521711 CLIP1P30622 1438 aa36.29■■■■□ 3.4
ADRA1A-211ENST00000521711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.24■■■■□ 3.39
ADRA1A-211ENST00000521711 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.22■■■■□ 3.39
ADRA1A-211ENST00000521711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.21■■■■□ 3.39
ADRA1A-211ENST00000521711 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
ADRA1A-211ENST00000521711 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36■■■■□ 3.35
ADRA1A-211ENST00000521711 SYNJ2O15056 1496 aa35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms