RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520872.5

STAU2-208, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene STAU2, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2-208ENST00000520872 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.95■■■■■ 5.11
STAU2-208ENST00000520872 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.95■■■■■ 4.31
STAU2-208ENST00000520872 ABCC9O60706 1549 aa41.3■■■■■ 4.2
STAU2-208ENST00000520872 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.63■■■■□ 3.93
STAU2-208ENST00000520872 NACADO15069 1562 aa39.52■■■■□ 3.92
STAU2-208ENST00000520872 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
STAU2-208ENST00000520872 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.11■■■■□ 3.85
STAU2-208ENST00000520872 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
STAU2-208ENST00000520872 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.91■■■■□ 3.82
STAU2-208ENST00000520872 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.73■■■■□ 3.79
STAU2-208ENST00000520872 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.5■■■■□ 3.75
STAU2-208ENST00000520872 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
STAU2-208ENST00000520872 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.31■■■■□ 3.72
STAU2-208ENST00000520872 SCRIBQ14160 1630 aa38.12■■■■□ 3.69
STAU2-208ENST00000520872 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.12■■■■□ 3.69
STAU2-208ENST00000520872 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
STAU2-208ENST00000520872 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.4■■■■□ 3.58
STAU2-208ENST00000520872 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.2■■■■□ 3.54
STAU2-208ENST00000520872 SMARCA4P51532 1647 aa36.5■■■■□ 3.43
STAU2-208ENST00000520872 NCAPD3P42695 1498 aa36.49■■■■□ 3.43
STAU2-208ENST00000520872 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.42■■■■□ 3.42
STAU2-208ENST00000520872 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
STAU2-208ENST00000520872 SMARCA2P51531 1590 aa36.35■■■■□ 3.41
STAU2-208ENST00000520872 HMGXB3Q12766 1538 aa36.28■■■■□ 3.4
STAU2-208ENST00000520872 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.23■■■■□ 3.39
STAU2-208ENST00000520872 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.15■■■■□ 3.38
STAU2-208ENST00000520872 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
STAU2-208ENST00000520872 WIZO95785 1651 aa35.7■■■■□ 3.31
STAU2-208ENST00000520872 NESP48681 1621 aa35.65■■■■□ 3.3
STAU2-208ENST00000520872 ERCC6Q03468 1493 aa35.6■■■■□ 3.29
STAU2-208ENST00000520872 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
STAU2-208ENST00000520872 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.56■■■■□ 3.28
STAU2-208ENST00000520872 CUX2O14529 1486 aa35.49■■■■□ 3.27
STAU2-208ENST00000520872 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
STAU2-208ENST00000520872 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.35■■■■□ 3.25
STAU2-208ENST00000520872 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.29■■■■□ 3.24
STAU2-208ENST00000520872 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
STAU2-208ENST00000520872 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.23■■■■□ 3.23
STAU2-208ENST00000520872 CFTRP13569 1480 aa35.09■■■■□ 3.21
STAU2-208ENST00000520872 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.97■■■■□ 3.19
STAU2-208ENST00000520872 WDR62O43379 1518 aa34.92■■■■□ 3.18
STAU2-208ENST00000520872 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.92■■■■□ 3.18
STAU2-208ENST00000520872 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.91■■■■□ 3.18
STAU2-208ENST00000520872 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.9■■■■□ 3.18
STAU2-208ENST00000520872 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.83■■■■□ 3.17
STAU2-208ENST00000520872 PRDM2Q13029 1718 aa34.78■■■■□ 3.16
STAU2-208ENST00000520872 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
STAU2-208ENST00000520872 TOPBP1Q92547 1522 aa34.35■■■■□ 3.09
STAU2-208ENST00000520872 ABCC8Q09428 1581 aa34.33■■■■□ 3.09
STAU2-208ENST00000520872 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.28■■■■□ 3.08
STAU2-208ENST00000520872 IFT140Q96RY7 1462 aa34.22■■■■□ 3.07
STAU2-208ENST00000520872 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
STAU2-208ENST00000520872 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
STAU2-208ENST00000520872 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
STAU2-208ENST00000520872 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
STAU2-208ENST00000520872 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
STAU2-208ENST00000520872 CUX1P39880 1505 aa33.94■■■■□ 3.02
STAU2-208ENST00000520872 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.86■■■■□ 3.01
STAU2-208ENST00000520872 OSCARQ8IYS5 282 aa33.85■■■■□ 3.01
STAU2-208ENST00000520872 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.83■■■■□ 3.01
STAU2-208ENST00000520872 SOGA1O94964 1423 aa33.83■■■■□ 3.01
STAU2-208ENST00000520872 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
STAU2-208ENST00000520872 WDR97A6NE52 1622 aa33.79■■■■□ 3
STAU2-208ENST00000520872 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
STAU2-208ENST00000520872 CHD1O14646 1710 aa33.57■■■□□ 2.96
STAU2-208ENST00000520872 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.57■■■□□ 2.96
STAU2-208ENST00000520872 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.57■■■□□ 2.96
STAU2-208ENST00000520872 TOP2BQ02880 1626 aa33.55■■■□□ 2.96
STAU2-208ENST00000520872 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.96
STAU2-208ENST00000520872 GRIN2BQ13224 1484 aa33.52■■■□□ 2.96
STAU2-208ENST00000520872 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.5■■■□□ 2.95
STAU2-208ENST00000520872 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
STAU2-208ENST00000520872 SYNJ1O43426 1573 aa33.5■■■□□ 2.95
STAU2-208ENST00000520872 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.48■■■□□ 2.95
STAU2-208ENST00000520872 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.45■■■□□ 2.95
STAU2-208ENST00000520872 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.41■■■□□ 2.94
STAU2-208ENST00000520872 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.41■■■□□ 2.94
STAU2-208ENST00000520872 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.41■■■□□ 2.94
STAU2-208ENST00000520872 PBRM1Q86U86 1689 aa33.41■■■□□ 2.94
STAU2-208ENST00000520872 ARHGEF11O15085 1522 aa33.37■■■□□ 2.93
STAU2-208ENST00000520872 SYNJ2O15056 1496 aa33.37■■■□□ 2.93
STAU2-208ENST00000520872 FBLN2P98095 1184 aa33.36■■■□□ 2.93
STAU2-208ENST00000520872 TRIM41Q8WV44 630 aa33.34■■■□□ 2.93
STAU2-208ENST00000520872 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.28■■■□□ 2.92
STAU2-208ENST00000520872 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
STAU2-208ENST00000520872 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.16■■■□□ 2.9
STAU2-208ENST00000520872 ADAMTS12P58397 1594 aa33.16■■■□□ 2.9
STAU2-208ENST00000520872 GRIN2AQ12879 1464 aa33.1■■■□□ 2.89
STAU2-208ENST00000520872 ARAP1Q96P48 1450 aa33.08■■■□□ 2.89
STAU2-208ENST00000520872 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.07■■■□□ 2.88
STAU2-208ENST00000520872 NUP160Q12769 1436 aa33.02■■■□□ 2.88
STAU2-208ENST00000520872 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.97■■■□□ 2.87
STAU2-208ENST00000520872 CEP170Q5SW79 1584 aa32.96■■■□□ 2.87
STAU2-208ENST00000520872 KIF27Q86VH2 1401 aa32.86■■■□□ 2.85
STAU2-208ENST00000520872 SHROOM2Q13796 1616 aa32.82■■■□□ 2.84
STAU2-208ENST00000520872 IGF1RP08069 1367 aa32.81■■■□□ 2.84
STAU2-208ENST00000520872 CUL7Q14999 1698 aa32.75■■■□□ 2.83
STAU2-208ENST00000520872 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.73■■■□□ 2.83
STAU2-208ENST00000520872 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.69■■■□□ 2.82
STAU2-208ENST00000520872 JPH4Q96JJ6 628 aa32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.4 ms