RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516506.1

RNA5SP520-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 520, humanhuman

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Gene RNA5SP520, Length 113 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP520-201ENST00000516506 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.81■■■□□ 2.2
RNA5SP520-201ENST00000516506 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.6■■□□□ 1.69
RNA5SP520-201ENST00000516506 ABCC9O60706 1549 aa25.18■■□□□ 1.62
RNA5SP520-201ENST00000516506 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.12■■□□□ 1.45
RNA5SP520-201ENST00000516506 NACADO15069 1562 aa24.09■■□□□ 1.45
RNA5SP520-201ENST00000516506 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RNA5SP520-201ENST00000516506 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.97■■□□□ 1.43
RNA5SP520-201ENST00000516506 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.94■■□□□ 1.42
RNA5SP520-201ENST00000516506 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.83■■□□□ 1.41
RNA5SP520-201ENST00000516506 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.69■■□□□ 1.38
RNA5SP520-201ENST00000516506 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.57■■□□□ 1.36
RNA5SP520-201ENST00000516506 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
RNA5SP520-201ENST00000516506 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.4■■□□□ 1.34
RNA5SP520-201ENST00000516506 SCRIBQ14160 1630 aa23.36■■□□□ 1.33
RNA5SP520-201ENST00000516506 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.16■■□□□ 1.3
RNA5SP520-201ENST00000516506 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RNA5SP520-201ENST00000516506 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
RNA5SP520-201ENST00000516506 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.63■■□□□ 1.21
RNA5SP520-201ENST00000516506 SMARCA4P51532 1647 aa22.36■■□□□ 1.17
RNA5SP520-201ENST00000516506 NCAPD3P42695 1498 aa22.3■■□□□ 1.16
RNA5SP520-201ENST00000516506 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.29■■□□□ 1.16
RNA5SP520-201ENST00000516506 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RNA5SP520-201ENST00000516506 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.24■■□□□ 1.15
RNA5SP520-201ENST00000516506 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.19■■□□□ 1.14
RNA5SP520-201ENST00000516506 SMARCA2P51531 1590 aa22.17■■□□□ 1.14
RNA5SP520-201ENST00000516506 HMGXB3Q12766 1538 aa22.14■■□□□ 1.13
RNA5SP520-201ENST00000516506 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RNA5SP520-201ENST00000516506 WIZO95785 1651 aa21.96■■□□□ 1.11
RNA5SP520-201ENST00000516506 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RNA5SP520-201ENST00000516506 NESP48681 1621 aa21.83■■□□□ 1.08
RNA5SP520-201ENST00000516506 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RNA5SP520-201ENST00000516506 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.65■■□□□ 1.06
RNA5SP520-201ENST00000516506 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.61■■□□□ 1.05
RNA5SP520-201ENST00000516506 ERCC6Q03468 1493 aa21.6■■□□□ 1.05
RNA5SP520-201ENST00000516506 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.51■■□□□ 1.03
RNA5SP520-201ENST00000516506 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RNA5SP520-201ENST00000516506 CUX2O14529 1486 aa21.5■■□□□ 1.03
RNA5SP520-201ENST00000516506 CFTRP13569 1480 aa21.48■■□□□ 1.03
RNA5SP520-201ENST00000516506 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.47■■□□□ 1.03
RNA5SP520-201ENST00000516506 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.47■■□□□ 1.03
RNA5SP520-201ENST00000516506 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.34■■□□□ 1.01
RNA5SP520-201ENST00000516506 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.31■■□□□ 1
RNA5SP520-201ENST00000516506 WDR62O43379 1518 aa21.29■■□□□ 1
RNA5SP520-201ENST00000516506 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.28■■□□□ 1
RNA5SP520-201ENST00000516506 PRDM2Q13029 1718 aa21.24■□□□□ 0.99
RNA5SP520-201ENST00000516506 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
RNA5SP520-201ENST00000516506 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RNA5SP520-201ENST00000516506 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.03■□□□□ 0.96
RNA5SP520-201ENST00000516506 TOPBP1Q92547 1522 aa21.02■□□□□ 0.96
RNA5SP520-201ENST00000516506 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.95■□□□□ 0.94
RNA5SP520-201ENST00000516506 ABCC8Q09428 1581 aa20.9■□□□□ 0.94
RNA5SP520-201ENST00000516506 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RNA5SP520-201ENST00000516506 IFT140Q96RY7 1462 aa20.86■□□□□ 0.93
RNA5SP520-201ENST00000516506 CUX1P39880 1505 aa20.85■□□□□ 0.93
RNA5SP520-201ENST00000516506 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RNA5SP520-201ENST00000516506 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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RNA5SP520-201ENST00000516506 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.75■□□□□ 0.91
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RNA5SP520-201ENST00000516506 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
RNA5SP520-201ENST00000516506 SOGA1O94964 1423 aa20.7■□□□□ 0.9
RNA5SP520-201ENST00000516506 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RNA5SP520-201ENST00000516506 WDR97A6NE52 1622 aa20.63■□□□□ 0.89
RNA5SP520-201ENST00000516506 SYNJ1O43426 1573 aa20.63■□□□□ 0.89
RNA5SP520-201ENST00000516506 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.6■□□□□ 0.89
RNA5SP520-201ENST00000516506 TOP2BQ02880 1626 aa20.6■□□□□ 0.89
RNA5SP520-201ENST00000516506 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
RNA5SP520-201ENST00000516506 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.55■□□□□ 0.88
RNA5SP520-201ENST00000516506 OSCARQ8IYS5 282 aa20.55■□□□□ 0.88
RNA5SP520-201ENST00000516506 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.51■□□□□ 0.87
RNA5SP520-201ENST00000516506 CHD1O14646 1710 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP520-201ENST00000516506 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.48■□□□□ 0.87
RNA5SP520-201ENST00000516506 GRIN2BQ13224 1484 aa20.47■□□□□ 0.87
RNA5SP520-201ENST00000516506 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.46■□□□□ 0.87
RNA5SP520-201ENST00000516506 PBRM1Q86U86 1689 aa20.42■□□□□ 0.86
RNA5SP520-201ENST00000516506 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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RNA5SP520-201ENST00000516506 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.32■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 ARHGEF11O15085 1522 aa20.29■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 ADAMTS12P58397 1594 aa20.29■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.27■□□□□ 0.84
RNA5SP520-201ENST00000516506 GRIN2AQ12879 1464 aa20.24■□□□□ 0.83
RNA5SP520-201ENST00000516506 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.21■□□□□ 0.83
RNA5SP520-201ENST00000516506 NUP160Q12769 1436 aa20.19■□□□□ 0.82
RNA5SP520-201ENST00000516506 CEP170Q5SW79 1584 aa20.18■□□□□ 0.82
RNA5SP520-201ENST00000516506 IGF1RP08069 1367 aa20.18■□□□□ 0.82
RNA5SP520-201ENST00000516506 TRIM41Q8WV44 630 aa20.17■□□□□ 0.82
RNA5SP520-201ENST00000516506 ARAP1Q96P48 1450 aa20.16■□□□□ 0.82
RNA5SP520-201ENST00000516506 KIF27Q86VH2 1401 aa20.13■□□□□ 0.81
RNA5SP520-201ENST00000516506 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.08■□□□□ 0.81
RNA5SP520-201ENST00000516506 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.08■□□□□ 0.8
RNA5SP520-201ENST00000516506 SHROOM2Q13796 1616 aa20.06■□□□□ 0.8
RNA5SP520-201ENST00000516506 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.05■□□□□ 0.8
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RNA5SP520-201ENST00000516506 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.98■□□□□ 0.79
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