RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514036.5

RAI14-223, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-223	ENST00000514036	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		16.91	■□□□□ 0.3
RAI14-223	ENST00000514036	ABCC9	O60706	1549 aa		15.62	■□□□□ 0.09
RAI14-223	ENST00000514036	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RAI14-223	ENST00000514036	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RAI14-223	ENST00000514036	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RAI14-223	ENST00000514036	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	14.56	□□□□□ -0.08
RAI14-223	ENST00000514036	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RAI14-223	ENST00000514036	NACAD	O15069	1562 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RAI14-223	ENST00000514036	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RAI14-223	ENST00000514036	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		14.28	□□□□□ -0.12
RAI14-223	ENST00000514036	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RAI14-223	ENST00000514036	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		14.04	□□□□□ -0.16
RAI14-223	ENST00000514036	SCRIB	Q14160	1630 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RAI14-223	ENST00000514036	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RAI14-223	ENST00000514036	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAI14-223	ENST00000514036	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RAI14-223	ENST00000514036	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RAI14-223	ENST00000514036	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RAI14-223	ENST00000514036	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-223	ENST00000514036	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RAI14-223	ENST00000514036	CUX2	O14529	1486 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAI14-223	ENST00000514036	NES	P48681	1621 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RAI14-223	ENST00000514036	NCAPD3	P42695	1498 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAI14-223	ENST00000514036	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAI14-223	ENST00000514036	SMARCA4	P51532	1647 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RAI14-223	ENST00000514036	SMARCA2	P51531	1590 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RAI14-223	ENST00000514036	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RAI14-223	ENST00000514036	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RAI14-223	ENST00000514036	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RAI14-223	ENST00000514036	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RAI14-223	ENST00000514036	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAI14-223	ENST00000514036	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAI14-223	ENST00000514036	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-223	ENST00000514036	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAI14-223	ENST00000514036	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RAI14-223	ENST00000514036	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13	□□□□□ -0.33
RAI14-223	ENST00000514036	WIZ	O95785	1651 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RAI14-223	ENST00000514036	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.96	□□□□□ -0.34
RAI14-223	ENST00000514036	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RAI14-223	ENST00000514036	WDR62	O43379	1518 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RAI14-223	ENST00000514036	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RAI14-223	ENST00000514036	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RAI14-223	ENST00000514036	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAI14-223	ENST00000514036	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAI14-223	ENST00000514036	CFTR	P13569	1480 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RAI14-223	ENST00000514036	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RAI14-223	ENST00000514036	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RAI14-223	ENST00000514036	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RAI14-223	ENST00000514036	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RAI14-223	ENST00000514036	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.38
RAI14-223	ENST00000514036	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RAI14-223	ENST00000514036	ARHGEF11	O15085	1522 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RAI14-223	ENST00000514036	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RAI14-223	ENST00000514036	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.6	□□□□□ -0.39
RAI14-223	ENST00000514036	PRDM2	Q13029	1718 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RAI14-223	ENST00000514036	TOPBP1	Q92547	1522 aa		12.58	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	IFT140	Q96RY7	1462 aa		12.58	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	12.56	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	CHD1	O14646	1710 aa		12.55	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	FBLN2	P98095	1184 aa		12.55	□□□□□ -0.4
RAI14-223	ENST00000514036	ARAP1	Q96P48	1450 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RAI14-223	ENST00000514036	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RAI14-223	ENST00000514036	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RAI14-223	ENST00000514036	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RAI14-223	ENST00000514036	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RAI14-223	ENST00000514036	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RAI14-223	ENST00000514036	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RAI14-223	ENST00000514036	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RAI14-223	ENST00000514036	SOGA1	O94964	1423 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RAI14-223	ENST00000514036	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RAI14-223	ENST00000514036	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RAI14-223	ENST00000514036	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RAI14-223	ENST00000514036	CUX1	P39880	1505 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RAI14-223	ENST00000514036	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
RAI14-223	ENST00000514036	SYNJ1	O43426	1573 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RAI14-223	ENST00000514036	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	GRIN2B	Q13224	1484 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	PBRM1	Q86U86	1689 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	SYNJ2	O15056	1496 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
RAI14-223	ENST00000514036	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RAI14-223	ENST00000514036	CEP170	Q5SW79	1584 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RAI14-223	ENST00000514036	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RAI14-223	ENST00000514036	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
RAI14-223	ENST00000514036	GRIN2A	Q12879	1464 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RAI14-223	ENST00000514036	ADAMTS12	P58397	1594 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RAI14-223	ENST00000514036	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RAI14-223	ENST00000514036	NUP160	Q12769	1436 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RAI14-223	ENST00000514036	SHROOM2	Q13796	1616 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RAI14-223	ENST00000514036	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
RAI14-223	ENST00000514036	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RAI14-223	ENST00000514036	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RAI14-223	ENST00000514036	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		12	□□□□□ -0.49
RAI14-223	ENST00000514036	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RAI14-223	ENST00000514036	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RAI14-223	ENST00000514036	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49

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