RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510793.5

MIB2-225, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 5

Gene MIB2, Length 889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-225ENST00000510793 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.18■■■■■ 6.42
MIB2-225ENST00000510793 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.36■■■■■ 5.49
MIB2-225ENST00000510793 ABCC9O60706 1549 aa48.98■■■■■ 5.43
MIB2-225ENST00000510793 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.73■■■■■ 5.07
MIB2-225ENST00000510793 NACADO15069 1562 aa46.5■■■■■ 5.03
MIB2-225ENST00000510793 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.35■■■■■ 5.01
MIB2-225ENST00000510793 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.96■■■■■ 4.95
MIB2-225ENST00000510793 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.87■■■■■ 4.93
MIB2-225ENST00000510793 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
MIB2-225ENST00000510793 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.63■■■■■ 4.9
MIB2-225ENST00000510793 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.57■■■■■ 4.89
MIB2-225ENST00000510793 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.55■■■■■ 4.88
MIB2-225ENST00000510793 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.45■■■■■ 4.87
MIB2-225ENST00000510793 SCRIBQ14160 1630 aa45.07■■■■■ 4.81
MIB2-225ENST00000510793 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
MIB2-225ENST00000510793 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.28■■■■■ 4.68
MIB2-225ENST00000510793 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
MIB2-225ENST00000510793 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.02■■■■■ 4.64
MIB2-225ENST00000510793 SMARCA4P51532 1647 aa43■■■■■ 4.47
MIB2-225ENST00000510793 NCAPD3P42695 1498 aa42.91■■■■■ 4.46
MIB2-225ENST00000510793 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.88■■■■■ 4.46
MIB2-225ENST00000510793 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
MIB2-225ENST00000510793 SMARCA2P51531 1590 aa42.76■■■■■ 4.44
MIB2-225ENST00000510793 HMGXB3Q12766 1538 aa42.67■■■■■ 4.42
MIB2-225ENST00000510793 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.57■■■■■ 4.41
MIB2-225ENST00000510793 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.53■■■■■ 4.4
MIB2-225ENST00000510793 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
MIB2-225ENST00000510793 NESP48681 1621 aa42.23■■■■■ 4.35
MIB2-225ENST00000510793 ERCC6Q03468 1493 aa42.19■■■■■ 4.34
MIB2-225ENST00000510793 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
MIB2-225ENST00000510793 CUX2O14529 1486 aa41.94■■■■■ 4.3
MIB2-225ENST00000510793 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.91■■■■■ 4.3
MIB2-225ENST00000510793 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
MIB2-225ENST00000510793 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.74■■■■■ 4.27
MIB2-225ENST00000510793 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
MIB2-225ENST00000510793 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.63■■■■■ 4.25
MIB2-225ENST00000510793 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.59■■■■■ 4.25
MIB2-225ENST00000510793 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
MIB2-225ENST00000510793 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.43■■■■■ 4.22
MIB2-225ENST00000510793 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.28■■■■■ 4.2
MIB2-225ENST00000510793 CFTRP13569 1480 aa41.26■■■■■ 4.2
MIB2-225ENST00000510793 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.2■■■■■ 4.19
MIB2-225ENST00000510793 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.2■■■■■ 4.19
MIB2-225ENST00000510793 WDR62O43379 1518 aa41.19■■■■■ 4.18
MIB2-225ENST00000510793 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.07■■■■■ 4.16
MIB2-225ENST00000510793 PRDM2Q13029 1718 aa41.01■■■■■ 4.16
MIB2-225ENST00000510793 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
MIB2-225ENST00000510793 TOPBP1Q92547 1522 aa40.49■■■■■ 4.07
MIB2-225ENST00000510793 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.37■■■■■ 4.05
MIB2-225ENST00000510793 IFT140Q96RY7 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
MIB2-225ENST00000510793 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
MIB2-225ENST00000510793 ABCC8Q09428 1581 aa40.31■■■■■ 4.04
MIB2-225ENST00000510793 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
MIB2-225ENST00000510793 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
MIB2-225ENST00000510793 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
MIB2-225ENST00000510793 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
MIB2-225ENST00000510793 OSCARQ8IYS5 282 aa40.05■■■■■ 4
MIB2-225ENST00000510793 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.98■■■■□ 3.99
MIB2-225ENST00000510793 CUX1P39880 1505 aa39.97■■■■□ 3.99
MIB2-225ENST00000510793 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
MIB2-225ENST00000510793 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.93■■■■□ 3.98
MIB2-225ENST00000510793 SOGA1O94964 1423 aa39.87■■■■□ 3.97
MIB2-225ENST00000510793 TRIM41Q8WV44 630 aa39.85■■■■□ 3.97
MIB2-225ENST00000510793 CHD1O14646 1710 aa39.8■■■■□ 3.96
MIB2-225ENST00000510793 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
MIB2-225ENST00000510793 WDR97A6NE52 1622 aa39.69■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.59■■■■□ 3.93
MIB2-225ENST00000510793 FBLN2P98095 1184 aa39.57■■■■□ 3.93
MIB2-225ENST00000510793 ARHGEF11O15085 1522 aa39.52■■■■□ 3.92
MIB2-225ENST00000510793 PBRM1Q86U86 1689 aa39.48■■■■□ 3.91
MIB2-225ENST00000510793 GRIN2BQ13224 1484 aa39.48■■■■□ 3.91
MIB2-225ENST00000510793 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.45■■■■□ 3.91
MIB2-225ENST00000510793 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.45■■■■□ 3.91
MIB2-225ENST00000510793 SYNJ1O43426 1573 aa39.45■■■■□ 3.91
MIB2-225ENST00000510793 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.43■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 TOP2BQ02880 1626 aa39.42■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.42■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 SYNJ2O15056 1496 aa39.31■■■■□ 3.88
MIB2-225ENST00000510793 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
MIB2-225ENST00000510793 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.28■■■■□ 3.88
MIB2-225ENST00000510793 ARAP1Q96P48 1450 aa39.18■■■■□ 3.86
MIB2-225ENST00000510793 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.14■■■■□ 3.86
MIB2-225ENST00000510793 ADAMTS12P58397 1594 aa39.09■■■■□ 3.85
MIB2-225ENST00000510793 GRIN2AQ12879 1464 aa39.01■■■■□ 3.84
MIB2-225ENST00000510793 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.95■■■■□ 3.83
MIB2-225ENST00000510793 CEP170Q5SW79 1584 aa38.91■■■■□ 3.82
MIB2-225ENST00000510793 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.9■■■■□ 3.82
MIB2-225ENST00000510793 NUP160Q12769 1436 aa38.85■■■■□ 3.81
MIB2-225ENST00000510793 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.78■■■■□ 3.8
MIB2-225ENST00000510793 SHROOM2Q13796 1616 aa38.69■■■■□ 3.78
MIB2-225ENST00000510793 KIF27Q86VH2 1401 aa38.59■■■■□ 3.77
MIB2-225ENST00000510793 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
MIB2-225ENST00000510793 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.54■■■■□ 3.76
MIB2-225ENST00000510793 IGF1RP08069 1367 aa38.54■■■■□ 3.76
MIB2-225ENST00000510793 CUL7Q14999 1698 aa38.51■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms