RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507114.1

ANKRD40-202, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD40, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-202ENST00000507114 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.56■■■■■ 4.24
ANKRD40-202ENST00000507114 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.91■■■■□ 3.5
ANKRD40-202ENST00000507114 ABCC9O60706 1549 aa35.93■■■■□ 3.34
ANKRD40-202ENST00000507114 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.66■■■■□ 3.14
ANKRD40-202ENST00000507114 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.66■■■■□ 3.14
ANKRD40-202ENST00000507114 NACADO15069 1562 aa34.66■■■■□ 3.14
ANKRD40-202ENST00000507114 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
ANKRD40-202ENST00000507114 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.49■■■■□ 3.11
ANKRD40-202ENST00000507114 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD40-202ENST00000507114 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.9■■■■□ 3.02
ANKRD40-202ENST00000507114 SCRIBQ14160 1630 aa33.68■■■□□ 2.98
ANKRD40-202ENST00000507114 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.6■■■□□ 2.97
ANKRD40-202ENST00000507114 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.59■■■□□ 2.97
ANKRD40-202ENST00000507114 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.26■■■□□ 2.92
ANKRD40-202ENST00000507114 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.81■■■□□ 2.84
ANKRD40-202ENST00000507114 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
ANKRD40-202ENST00000507114 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.52■■■□□ 2.8
ANKRD40-202ENST00000507114 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.34■■■□□ 2.77
ANKRD40-202ENST00000507114 SMARCA4P51532 1647 aa32.23■■■□□ 2.75
ANKRD40-202ENST00000507114 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
ANKRD40-202ENST00000507114 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.02■■■□□ 2.72
ANKRD40-202ENST00000507114 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.99■■■□□ 2.71
ANKRD40-202ENST00000507114 SMARCA2P51531 1590 aa31.98■■■□□ 2.71
ANKRD40-202ENST00000507114 NCAPD3P42695 1498 aa31.96■■■□□ 2.71
ANKRD40-202ENST00000507114 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.9■■■□□ 2.7
ANKRD40-202ENST00000507114 HMGXB3Q12766 1538 aa31.83■■■□□ 2.69
ANKRD40-202ENST00000507114 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
ANKRD40-202ENST00000507114 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
ANKRD40-202ENST00000507114 WIZO95785 1651 aa31.7■■■□□ 2.67
ANKRD40-202ENST00000507114 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
ANKRD40-202ENST00000507114 NESP48681 1621 aa31.13■■■□□ 2.57
ANKRD40-202ENST00000507114 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.11■■■□□ 2.57
ANKRD40-202ENST00000507114 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
ANKRD40-202ENST00000507114 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.03■■■□□ 2.56
ANKRD40-202ENST00000507114 CCDC88BA6NC98 1476 aa31■■■□□ 2.55
ANKRD40-202ENST00000507114 ERCC6Q03468 1493 aa30.98■■■□□ 2.55
ANKRD40-202ENST00000507114 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.89■■■□□ 2.53
ANKRD40-202ENST00000507114 CFTRP13569 1480 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD40-202ENST00000507114 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.81■■■□□ 2.52
ANKRD40-202ENST00000507114 PRDM2Q13029 1718 aa30.73■■■□□ 2.51
ANKRD40-202ENST00000507114 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.69■■■□□ 2.5
ANKRD40-202ENST00000507114 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
ANKRD40-202ENST00000507114 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.64■■■□□ 2.5
ANKRD40-202ENST00000507114 CUX2O14529 1486 aa30.59■■■□□ 2.49
ANKRD40-202ENST00000507114 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.56■■■□□ 2.48
ANKRD40-202ENST00000507114 WDR62O43379 1518 aa30.45■■■□□ 2.47
ANKRD40-202ENST00000507114 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ANKRD40-202ENST00000507114 ABCC8Q09428 1581 aa30.24■■■□□ 2.43
ANKRD40-202ENST00000507114 TOPBP1Q92547 1522 aa30.21■■■□□ 2.43
ANKRD40-202ENST00000507114 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.2■■■□□ 2.43
ANKRD40-202ENST00000507114 CUX1P39880 1505 aa30.04■■■□□ 2.4
ANKRD40-202ENST00000507114 IFT140Q96RY7 1462 aa29.99■■■□□ 2.39
ANKRD40-202ENST00000507114 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ANKRD40-202ENST00000507114 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.92■■■□□ 2.38
ANKRD40-202ENST00000507114 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
ANKRD40-202ENST00000507114 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ANKRD40-202ENST00000507114 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD40-202ENST00000507114 SOGA1O94964 1423 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD40-202ENST00000507114 TOP2BQ02880 1626 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD40-202ENST00000507114 SYNJ1O43426 1573 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD40-202ENST00000507114 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ANKRD40-202ENST00000507114 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD40-202ENST00000507114 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ANKRD40-202ENST00000507114 WDR97A6NE52 1622 aa29.68■■■□□ 2.34
ANKRD40-202ENST00000507114 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
ANKRD40-202ENST00000507114 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
ANKRD40-202ENST00000507114 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.63■■■□□ 2.33
ANKRD40-202ENST00000507114 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.51■■■□□ 2.31
ANKRD40-202ENST00000507114 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.5■■■□□ 2.31
ANKRD40-202ENST00000507114 GRIN2BQ13224 1484 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD40-202ENST00000507114 PBRM1Q86U86 1689 aa29.47■■■□□ 2.31
ANKRD40-202ENST00000507114 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.45■■■□□ 2.31
ANKRD40-202ENST00000507114 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD40-202ENST00000507114 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
ANKRD40-202ENST00000507114 CHD1O14646 1710 aa29.35■■■□□ 2.29
ANKRD40-202ENST00000507114 OSCARQ8IYS5 282 aa29.35■■■□□ 2.29
ANKRD40-202ENST00000507114 TRIM41Q8WV44 630 aa29.31■■■□□ 2.28
ANKRD40-202ENST00000507114 FBLN2P98095 1184 aa29.3■■■□□ 2.28
ANKRD40-202ENST00000507114 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.3■■■□□ 2.28
ANKRD40-202ENST00000507114 SYNJ2O15056 1496 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKRD40-202ENST00000507114 KIF27Q86VH2 1401 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKRD40-202ENST00000507114 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ANKRD40-202ENST00000507114 ADAMTS12P58397 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD40-202ENST00000507114 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD40-202ENST00000507114 IGF1RP08069 1367 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD40-202ENST00000507114 GRIN2AQ12879 1464 aa29.1■■■□□ 2.25
ANKRD40-202ENST00000507114 CUL7Q14999 1698 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD40-202ENST00000507114 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD40-202ENST00000507114 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD40-202ENST00000507114 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD40-202ENST00000507114 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40-202ENST00000507114 CEP170Q5SW79 1584 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40-202ENST00000507114 NUP160Q12769 1436 aa28.95■■■□□ 2.23
ANKRD40-202ENST00000507114 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD40-202ENST00000507114 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD40-202ENST00000507114 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD40-202ENST00000507114 ARHGEF11O15085 1522 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD40-202ENST00000507114 EEA1Q15075 1411 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD40-202ENST00000507114 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD40-202ENST00000507114 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.76■■■□□ 2.19
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