RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506274.1

KLHL8-206, Transcript of kelch like family member 8, humanhuman

TSL 2

Gene KLHL8, Length 1,924 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL8-206ENST00000506274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.39■■■■■ 7.26
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KLHL8-206ENST00000506274 SMARCA2P51531 1590 aa45.43■■■■■ 4.86
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KLHL8-206ENST00000506274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.68■■■■■ 4.74
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KLHL8-206ENST00000506274 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.28■■■■■ 4.68
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KLHL8-206ENST00000506274 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
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KLHL8-206ENST00000506274 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.93■■■■■ 4.62
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KLHL8-206ENST00000506274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.73■■■■■ 4.59
KLHL8-206ENST00000506274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.67■■■■■ 4.58
KLHL8-206ENST00000506274 EEA1Q15075 1411 aa43.66■■■■■ 4.58
KLHL8-206ENST00000506274 CUX1P39880 1505 aa43.64■■■■■ 4.58
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KLHL8-206ENST00000506274 NESP48681 1621 aa43.49■■■■■ 4.55
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KLHL8-206ENST00000506274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.43■■■■■ 4.54
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KLHL8-206ENST00000506274 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.08■■■■■ 4.49
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KLHL8-206ENST00000506274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
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KLHL8-206ENST00000506274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
KLHL8-206ENST00000506274 ARAP1Q96P48 1450 aa42.04■■■■■ 4.32
KLHL8-206ENST00000506274 IFT140Q96RY7 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
KLHL8-206ENST00000506274 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.97■■■■■ 4.31
KLHL8-206ENST00000506274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.315e-6■■■□□ 16.9
KLHL8-206ENST00000506274 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
KLHL8-206ENST00000506274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
KLHL8-206ENST00000506274 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.81■■■■■ 4.28
KLHL8-206ENST00000506274 GRIN2BQ13224 1484 aa41.81■■■■■ 4.28
KLHL8-206ENST00000506274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.74■■■■■ 4.27
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