RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496124.1

PRDM15-216, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-216ENST00000496124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.85■■■■□ 3.17
PRDM15-216ENST00000496124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.84■■■□□ 2.53
PRDM15-216ENST00000496124 ABCC9O60706 1549 aa30.22■■■□□ 2.43
PRDM15-216ENST00000496124 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.26■■■□□ 2.27
PRDM15-216ENST00000496124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PRDM15-216ENST00000496124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29■■■□□ 2.23
PRDM15-216ENST00000496124 NACADO15069 1562 aa28.96■■■□□ 2.23
PRDM15-216ENST00000496124 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.72■■■□□ 2.19
PRDM15-216ENST00000496124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.72■■■□□ 2.19
PRDM15-216ENST00000496124 SCRIBQ14160 1630 aa28.38■■■□□ 2.13
PRDM15-216ENST00000496124 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.35■■■□□ 2.13
PRDM15-216ENST00000496124 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
PRDM15-216ENST00000496124 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.12■■■□□ 2.09
PRDM15-216ENST00000496124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.93■■■□□ 2.06
PRDM15-216ENST00000496124 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.5■■□□□ 1.99
PRDM15-216ENST00000496124 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PRDM15-216ENST00000496124 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.25■■□□□ 1.95
PRDM15-216ENST00000496124 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.22■■□□□ 1.95
PRDM15-216ENST00000496124 SMARCA4P51532 1647 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM15-216ENST00000496124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PRDM15-216ENST00000496124 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM15-216ENST00000496124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM15-216ENST00000496124 SMARCA2P51531 1590 aa26.78■■□□□ 1.88
PRDM15-216ENST00000496124 NCAPD3P42695 1498 aa26.7■■□□□ 1.87
PRDM15-216ENST00000496124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PRDM15-216ENST00000496124 WIZO95785 1651 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM15-216ENST00000496124 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PRDM15-216ENST00000496124 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.65■■□□□ 1.86
PRDM15-216ENST00000496124 HMGXB3Q12766 1538 aa26.63■■□□□ 1.85
PRDM15-216ENST00000496124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PRDM15-216ENST00000496124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PRDM15-216ENST00000496124 NESP48681 1621 aa26.2■■□□□ 1.78
PRDM15-216ENST00000496124 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.04■■□□□ 1.76
PRDM15-216ENST00000496124 ERCC6Q03468 1493 aa26.03■■□□□ 1.76
PRDM15-216ENST00000496124 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26■■□□□ 1.75
PRDM15-216ENST00000496124 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM15-216ENST00000496124 CFTRP13569 1480 aa25.86■■□□□ 1.73
PRDM15-216ENST00000496124 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.84■■□□□ 1.73
PRDM15-216ENST00000496124 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.84■■□□□ 1.73
PRDM15-216ENST00000496124 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.76■■□□□ 1.71
PRDM15-216ENST00000496124 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.72■■□□□ 1.71
PRDM15-216ENST00000496124 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PRDM15-216ENST00000496124 PRDM2Q13029 1718 aa25.66■■□□□ 1.7
PRDM15-216ENST00000496124 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.63■■□□□ 1.69
PRDM15-216ENST00000496124 CUX2O14529 1486 aa25.53■■□□□ 1.68
PRDM15-216ENST00000496124 WDR62O43379 1518 aa25.5■■□□□ 1.67
PRDM15-216ENST00000496124 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PRDM15-216ENST00000496124 TOPBP1Q92547 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM15-216ENST00000496124 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM15-216ENST00000496124 ABCC8Q09428 1581 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM15-216ENST00000496124 CUX1P39880 1505 aa25.26■■□□□ 1.63
PRDM15-216ENST00000496124 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRDM15-216ENST00000496124 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM15-216ENST00000496124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PRDM15-216ENST00000496124 IFT140Q96RY7 1462 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM15-216ENST00000496124 SYNJ1O43426 1573 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM15-216ENST00000496124 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PRDM15-216ENST00000496124 SOGA1O94964 1423 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM15-216ENST00000496124 TOP2BQ02880 1626 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM15-216ENST00000496124 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PRDM15-216ENST00000496124 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM15-216ENST00000496124 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PRDM15-216ENST00000496124 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
PRDM15-216ENST00000496124 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
PRDM15-216ENST00000496124 WDR97A6NE52 1622 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM15-216ENST00000496124 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.84■■□□□ 1.57
PRDM15-216ENST00000496124 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM15-216ENST00000496124 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM15-216ENST00000496124 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM15-216ENST00000496124 GRIN2BQ13224 1484 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM15-216ENST00000496124 TRIM41Q8WV44 630 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM15-216ENST00000496124 PBRM1Q86U86 1689 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM15-216ENST00000496124 FBLN2P98095 1184 aa24.7■■□□□ 1.54
PRDM15-216ENST00000496124 CHD1O14646 1710 aa24.61■■□□□ 1.53
PRDM15-216ENST00000496124 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PRDM15-216ENST00000496124 KIF27Q86VH2 1401 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM15-216ENST00000496124 ADAMTS12P58397 1594 aa24.55■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 SYNJ2O15056 1496 aa24.53■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.53■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 OSCARQ8IYS5 282 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM15-216ENST00000496124 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM15-216ENST00000496124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM15-216ENST00000496124 IGF1RP08069 1367 aa24.43■■□□□ 1.5
PRDM15-216ENST00000496124 GRIN2AQ12879 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
PRDM15-216ENST00000496124 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PRDM15-216ENST00000496124 CUL7Q14999 1698 aa24.36■■□□□ 1.49
PRDM15-216ENST00000496124 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.33■■□□□ 1.49
PRDM15-216ENST00000496124 CEP170Q5SW79 1584 aa24.33■■□□□ 1.48
PRDM15-216ENST00000496124 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.3■■□□□ 1.48
PRDM15-216ENST00000496124 NUP160Q12769 1436 aa24.27■■□□□ 1.48
PRDM15-216ENST00000496124 ARHGEF11O15085 1522 aa24.2■■□□□ 1.47
PRDM15-216ENST00000496124 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.2■■□□□ 1.47
PRDM15-216ENST00000496124 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.18■■□□□ 1.46
PRDM15-216ENST00000496124 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.18■■□□□ 1.46
PRDM15-216ENST00000496124 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.18■■□□□ 1.46
PRDM15-216ENST00000496124 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.17■■□□□ 1.46
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