RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495518.1

SLC22A18-211, Transcript of solute carrier family 22 member 18, humanhuman

TSL 2

Gene SLC22A18, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18-211ENST00000495518 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.21■■■■□ 3.87
SLC22A18-211ENST00000495518 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCC9O60706 1549 aa34.41■■■■□ 3.1
SLC22A18-211ENST00000495518 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.1■■■□□ 2.89
SLC22A18-211ENST00000495518 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.02■■■□□ 2.88
SLC22A18-211ENST00000495518 NACADO15069 1562 aa32.94■■■□□ 2.86
SLC22A18-211ENST00000495518 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.67■■■□□ 2.82
SLC22A18-211ENST00000495518 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
SLC22A18-211ENST00000495518 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.44■■■□□ 2.78
SLC22A18-211ENST00000495518 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.757e-7■■■■□ 25.6
SLC22A18-211ENST00000495518 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC22A18-211ENST00000495518 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.91■■■□□ 2.7
SLC22A18-211ENST00000495518 SCRIBQ14160 1630 aa31.82■■■□□ 2.68
SLC22A18-211ENST00000495518 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.8■■■□□ 2.68
SLC22A18-211ENST00000495518 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC22A18-211ENST00000495518 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SLC22A18-211ENST00000495518 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.07■■■□□ 2.56
SLC22A18-211ENST00000495518 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.96■■■□□ 2.55
SLC22A18-211ENST00000495518 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SLC22A18-211ENST00000495518 SMARCA4P51532 1647 aa30.42■■■□□ 2.46
SLC22A18-211ENST00000495518 NCAPD3P42695 1498 aa30.42■■■□□ 2.46
SLC22A18-211ENST00000495518 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.37■■■□□ 2.45
SLC22A18-211ENST00000495518 SMARCA2P51531 1590 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC22A18-211ENST00000495518 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC22A18-211ENST00000495518 HMGXB3Q12766 1538 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC22A18-211ENST00000495518 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
SLC22A18-211ENST00000495518 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC22A18-211ENST00000495518 WIZO95785 1651 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC22A18-211ENST00000495518 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SLC22A18-211ENST00000495518 ERCC6Q03468 1493 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC22A18-211ENST00000495518 NESP48681 1621 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC22A18-211ENST00000495518 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC22A18-211ENST00000495518 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC22A18-211ENST00000495518 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC22A18-211ENST00000495518 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC22A18-211ENST00000495518 CUX2O14529 1486 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC22A18-211ENST00000495518 CFTRP13569 1480 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC22A18-211ENST00000495518 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.25■■■□□ 2.27
SLC22A18-211ENST00000495518 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.23■■■□□ 2.27
SLC22A18-211ENST00000495518 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SLC22A18-211ENST00000495518 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC22A18-211ENST00000495518 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC22A18-211ENST00000495518 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.14■■■□□ 2.26
SLC22A18-211ENST00000495518 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SLC22A18-211ENST00000495518 WDR62O43379 1518 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC22A18-211ENST00000495518 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC22A18-211ENST00000495518 PRDM2Q13029 1718 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC22A18-211ENST00000495518 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCC8Q09428 1581 aa28.75■■■□□ 2.19
SLC22A18-211ENST00000495518 TOPBP1Q92547 1522 aa28.65■■■□□ 2.18
SLC22A18-211ENST00000495518 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.58■■■□□ 2.17
SLC22A18-211ENST00000495518 IFT140Q96RY7 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
SLC22A18-211ENST00000495518 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
SLC22A18-211ENST00000495518 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SLC22A18-211ENST00000495518 SOGA1O94964 1423 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A18-211ENST00000495518 OSCARQ8IYS5 282 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A18-211ENST00000495518 CUX1P39880 1505 aa28.32■■■□□ 2.12
SLC22A18-211ENST00000495518 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SLC22A18-211ENST00000495518 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC22A18-211ENST00000495518 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC22A18-211ENST00000495518 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
SLC22A18-211ENST00000495518 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SLC22A18-211ENST00000495518 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SLC22A18-211ENST00000495518 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
SLC22A18-211ENST00000495518 FBLN2P98095 1184 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC22A18-211ENST00000495518 WDR97A6NE52 1622 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC22A18-211ENST00000495518 TOP2BQ02880 1626 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC22A18-211ENST00000495518 GRIN2BQ13224 1484 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC22A18-211ENST00000495518 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SLC22A18-211ENST00000495518 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC22A18-211ENST00000495518 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28■■■□□ 2.07
SLC22A18-211ENST00000495518 SYNJ1O43426 1573 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC22A18-211ENST00000495518 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
SLC22A18-211ENST00000495518 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.95■■■□□ 2.06
SLC22A18-211ENST00000495518 CHD1O14646 1710 aa27.89■■■□□ 2.05
SLC22A18-211ENST00000495518 TRIM41Q8WV44 630 aa27.87■■■□□ 2.05
SLC22A18-211ENST00000495518 SYNJ2O15056 1496 aa27.85■■■□□ 2.05
SLC22A18-211ENST00000495518 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.84■■■□□ 2.05
SLC22A18-211ENST00000495518 PBRM1Q86U86 1689 aa27.81■■■□□ 2.04
SLC22A18-211ENST00000495518 ARHGEF11O15085 1522 aa27.7■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.7■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.68■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC22A18-211ENST00000495518 KIF27Q86VH2 1401 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC22A18-211ENST00000495518 GRIN2AQ12879 1464 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC22A18-211ENST00000495518 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC22A18-211ENST00000495518 ADAMTS12P58397 1594 aa27.59■■■□□ 2.01
SLC22A18-211ENST00000495518 IGF1RP08069 1367 aa27.53■■■□□ 2
SLC22A18-211ENST00000495518 NUP160Q12769 1436 aa27.5■■□□□ 1.99
SLC22A18-211ENST00000495518 ARAP1Q96P48 1450 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC22A18-211ENST00000495518 CEP170Q5SW79 1584 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC22A18-211ENST00000495518 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC22A18-211ENST00000495518 JPH4Q96JJ6 628 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC22A18-211ENST00000495518 CUL7Q14999 1698 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC22A18-211ENST00000495518 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.26■■□□□ 1.95
SLC22A18-211ENST00000495518 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.5 ms